II wojna światowa Göth na początku wojny został przeniesiony do 1. SS-Sturmbann 11. SS-Standarte i awansowany na SS-Oberscharführera (sierżanta sztabowego) na początku 1941 roku. Od połowy 1941 do końca maja 1942 roku, pracując jako Einsatzführer i urzędnik finansowy w katowickim biurze Reichskommissar für die Festigung deutschen Volkstums – RKFDV (Komisarza Rzeszy ds. Umocnienia Narodowości Niemieckiej), zyskał reputację doświadczonego administratora w działaniach mających na celu izolację, przesiedlenie i eksterminację ludności żydowskiej. 14 lipca 1941 roku otrzymał awans na stopień SS-Untersturmführera. Otrzymał również od swojego dowódcy Dienstleistungszeugnis (Zaświadczenie o Służbie), w którym chwalono jego służbę, a także opisano go jako „skłonnego do poniesienia ofiary, przygotowanego do działania członka SS”, który „nadaje się do objęcia funkcji jednego z dowódców w SS” i „ma światowy pogląd rasowy”.