Ochrony Tuńczyka Atlantyckiego (ICCAT) oraz Międzynarodową Komisję Wielorybnictwa (IWC), natomiast dla wszystkich innych gatunków (w tym dorsza i śledzia) — bezpośrednio przez Unię Europejską i Rosję, w ramach dwustronnego generalnego regionalnego porozumienia w sprawie zarządzania rybołówstwem (dawniej było to zadanie generalnej regionalnej organizacji ds. zarządzania rybołówstwem na morzu bałtyckim tj. Międzynarodowej Komisji Rybołówstwa Morza Bałtyckiego, jednak ponieważ Unia Europejska posiada wyłączny mandat do reprezentowania swoich członków w tego rodzaju organizacjach, to w wyniku jej rozszerzenia liczba członków Komisji spadła z sześciu do zaledwie dwóch, wskutek czego jej dalsze istnienie uznano za zbędne). Przydzielane Unii Europejskiej bałtyckie kwoty połowowe rozdzielane są z kolei pomiędzy jej ośmiu położonych nad Bałtykiem członków.