Życie prywatne thumb|Sophia Schliemann w złotej biżuterii ze „skarbu Priama” (ok. 1873) Z obu małżeństw Schliemann miał pięcioro dzieci. Troje z pierwszego, z Jekateriną Łyżiną: syna Siergieja (1855–1941) i dwie córki: Natalię (1859–1869) i Nadieżdę (1861–1935). Dwoje z drugiego, z Zofią Engastromenos: córkę Andromachę (1871−1962) i syna Agamemnona (1878−1954). Małżeństwo to było bardzo udane. Zofia podziwiała swojego męża i wspierała go we wszystkich zamierzeniach, uczestnicząc osobiście w pracach wykopaliskowych i dzieląc z nim trudy, udręki i przeciwności.
Poliglota thumb|Grobowiec Schliemanna na ateńskim cmentarzu Heinrich Schliemann był wybitnym poliglotą-samoukiem. Władał takimi językami jak angielski, francuski, portugalski, włoski, hiszpański, rosyjski, holenderski, łaciński, grecki, starogrecki, szwedzki, polski, arabski.
Nauce języków w okresie pobytu w Holandii poświęcał cały dzień i sporą część nocy. Wyznawał zasadę, że dla nauczenia się danego języka należy w nim głośno mówić (wskutek tego musiał nawet zmieniać mieszkania na żądanie zniecierpliwionych sąsiadów). Aby mieć słuchacza, za niewielką opłatą wynajmował przypadkowego człowieka.