Znaczenie dla nauki Jego odkrycia dowiodły, że wydarzenia opisane przez Homera i Wergiliusza mają swoje materialne podstawy i mogą być wiarygodnymi faktami historycznymi. Na sfinansowanie potwierdzających to badań poświęcił osobisty majątek pozyskany na transakcjach handlowych w Rosji i na bankowym obrocie złotem w Kalifornii.
Natomiast metodologia prowadzonych wykopalisk (m.in. celowe niszczenie obiektów, które go nie interesowały lub pozostawały w sprzeczności z przyjmowanymi przez niego założeniami) przyniosła archeologii najpewniej wiele niepowetowanych stratJerzy Ciechanowicz: Cień Minotaura. Warszawa: PIW, 1996, s. 165.. Jednakże zastosowana przez niego technika wykopalisk polegająca na dokonywaniu przekopów sondażowych, nadal jest aktualna.
Literackie biografie Autobiografia badacza przygotowana do druku przez jego żonę, została opublikowana wkrótce po jego śmierci (Heinrich Schliemann’s Selbstbiographie bis zu seinem Tode vervollständigt (Hrsg. von Sophie Schliemann), F.A. Brockhaus, Leipzig 1892). W późniejszym czasie jego ruchliwe, bogate i niespokojne życie inspirowało autorów beletrystycznych powieści biograficznych, z których do najbardziej znanych należą : Emil Ludwig: Schliemann. Geschichte eines Goldsuchers. Paul Zsolnay Verlag, Wien 1932 Heinrich Alexander Stoll: Der Traum von Troja.