W latach 1502–1507 wykonał zespół dziewięciu obrazów dla bractwa dalmatyńskiego Scuola di San Giorgio degli Schiavoni. Cykl obejmował historie świętych Jerzego, Hieronima i Tryfona oraz dwie sceny ewangeliczne. W przeciwieństwie do innych wielkich zespołów Carpaccia obrazy te pozostają w budynku, dla którego zostały wykonane.
Najbardziej znanym obrazem tego zespołu jest Wizja św. Augustyna, dawniej interpretowana jako przedstawienie św. Hieronima. Scena ukazuje św. Augustyna w wypełnionej książkami i przedmiotami pracowni w chwili mistycznego doświadczenia śmierci Hieronima. Obraz jest przykładem charakterystycznego dla Carpaccia łączenia tematu religijnego z drobiazgowym przedstawieniem wnętrza, sprzętów, ksiąg, instrumentów i zwierząt.
W latach około 1504–1508 Carpaccio namalował cykl życia Marii dla Scuola degli Albanesi. Zespół został później rozproszony pomiędzy muzea w Wenecji, Mediolanie i Bergamo. Kolejnym dużym zamówieniem był cykl życia św. Szczepana, wykonywany od 1511 roku dla Scuola di Santo Stefano. Zachowane obrazy z tego zespołu znajdują się w Berlinie, Paryżu, Mediolanie i Stuttgarcie.