Il galeone San Francisco andò perso per naufragio il 30 settembre 1609 al largo della costa orientale della penisola di Bōsō, sull'isola principale giapponese di Honshū, vicino al villaggio di Iwawada, provincia di Kazusa..
Storia La documentazione sul galeone San Francisco indica solo che si trattava di un galeone di oltre 1.000 toneladas, sebbene il tonnellaggio dei galeoni di Manila fosse stato limitato a 300 toneladas nel 1593 e a 200 nel 1604 per proteggere gli interessi economici dei mercanti "siviglini" nel commercio con l'America.. Questa restrizione, tuttavia, non fu mai applicata efficacemente e le dimensioni dei galeoni di Manila aumentarono da 300 e 500 a 1.000 toneladas prima del 1614, perché i mercanti di Manila e del Messico si rifiutarono di limitare i loro volumi commerciali al fine di massimizzare i loro profitti.
Il 25 luglio 1609 tre navi spagnole salparono dal porto di Cavite nelle Filippine.. Si trattava del galeone da 1.000 tonnellate, e con quattrocento persone a bordo, San Francisco Capitana, del galeone San Andrés del Perù (Almiranta) e della nave (nao) Santa Ana. La destinazione della flotta era il porto di Acapulco sulla costa pacifica della Nuova Spagna. Il generale della flotta era l'ex governatore delle Filippine, Rodrigo de Vivero y Velasco (1564-1636), che viaggiava a bordo del San Francisco, mentre Juan Ezquerra fungeva da ammiraglio, e Juan de Cevicos era il maestre.
Secondo la lettera conservata nell'Archivo General de Indias, i problemi del San Francisco iniziarono quasi immediatamente dopo la partenza delle tre navi da Cavite.. La San Andrés riuscì a navigare più vicino al vento rispetto alle altre due navi e le superò, diventando la prima delle tre navi a doppiare la punta di Maribelez all'ingresso della baia di Manila.. La San Francisco e la Santa Ana, invece, dovettero ancorare vicino alla costa perché il vento si era calmato e si stava facendo buio. Le navi salparono l'ancora la mattina seguente e la San Francisco perse presto di vista la Santa Ana, che a sua volta la superò perché era una nave più leggera. Non si videro più. Il San Francisco ebbe difficoltà a superare una delle isole all'ingresso della baia di Manila quando scoppiò una tempesta e il galeone fu costretto a tornare indietro verso la baia di Cavite, anche se alla fine gettò l'ancora a Bataan, a quattro leghe da Cavite.
Durante questo breve viaggio, l'equipaggio si rese conto che il galeone imbarcava acqua, sebbene la falla fosse stata notata per la prima volta due giorni prima della partenza, mentre il galeone si trovava ancora a Cavite.. Tuttavia, la falla sembrava essere localizzata sopra la linea di galleggiamento, e il nuovo governatore delle Filippine Juan de Silva decise di non intraprendere alcuna azione per evitare ulteriori ritardi nella partenza del galeone. Si notò anche che non vi erano abbastanza marinai esperti a bordo, una nave delle dimensioni di San Francisco richiedeva almeno 55 marinai, ma imbarcati non ce n'erano più di venti esperti. Quando Rodrigo de Vivero chiese a Juan de Silva altri marinai, il governatore rispose che non ve ne erano di disponibili. Il galeone prese il mare in queste condizioni e, durante il viaggio verso El Varadero, urtò contro diversi scogli sommersi. I piloti tentarono di riparare il timone a El Varadero, a causa della scarsa manovrabilità della nave, sebbene la riparazione si rivelò di breve durata perché dopo soli quattro giorni la manovrabilità peggiorò ulteriormente.
Il 10 agosto 1609 il galeone riprese il suo viaggio e lasciò le Filippine attraverso El Embocadero, spinto da una forte burrasca che lo portò rapidamente fuori dalla vista. Quella fu la prima di una serie di tempeste che il galeone dovette superare. Fin dalla prima burrasca, i passeggeri a bordo del San Francisco temettero il peggio a causa delle falle e del pessimo sistema di governo, che impedivano alla nave di cambiare rotta. Rodrigo de Vivero menzionò che il San Francisco era un robusto galeone di oltre 1.000 tonnellate, ma la sua costruzione era difettosa e a volte era impossibile governare la nave anche con trenta persone al timone.
Dato il San Francisco non era in grado di cambiare rotta, la forza del vento squarciò le vele perché il capitano non osò ammainarle. I piloti decisero quindi di gettare in mare la scialuppa e la merce, comprese casse e balle, trasportate sul ponte superiore. A quel punto, il galeone trasportava mezzo estado d'acqua sul ponte a causa del continuo beccheggio e rollio che continuavano a immergere i lati della nave. Le onde alte allagavano anche le cabine sia a prua che a poppa, e un'onda portò via una grande porzione della galleria della nave insieme a quattro piccole schiave che vi si trovavano.. La burrasca si placò quando il galeone si trovava a cinquanta leghe da Los Ladrones, a 15 gradi di latitudine nord.. Si decise quindi di cambiare la rotta del galeone per raggiungere una latitudine più elevata alla ricerca di venti più freschi. Nel suo resoconto, de Vivero menzionò che non vi furono più di quattro giorni di bel tempo durante il viaggio, fino all'affondamento del galeone. L'equipaggio cercò di riparare la nave e di issare nuove vele dopo la prima tempesta, ma il galeone era così danneggiato che i suoi fianchi continuavano a immergersi sott'acqua anche con il bel tempo, nonostante l'alto bordo libero. Di conseguenza, le onde continuavano a lavare il ponte superiore e l'acqua iniziò a entrare nelle cuccette dei passeggeri più ricchi. Questa situazione spinse alcuni dei passeggeri imbarcati a cercare di convincere gli altri a tornare a Manila, ma la nave proseguì il suo viaggio attraverso le tempeste.
Il 1° settembre, il maltempo costrinse l'equipaggio del San Francisco ad abbassare gli alberi di gabbia e a rimuovere le coperture. Il giorno seguente, il galeone fu colpito da un uragano che durò una settimana, con un solo giorno di bel tempo, durante il quale fu avvistato un isolotto abitato circondato da scogli a 18,5 gradi di latitudine nord. Si pensava che l'isolotto facesse parte della catena di destra delle Isole Marianne, sebbene fosse stato abbandonato dopo poche ore. Poco dopo, la tempesta si scatenò di nuovo violentemente, con la nave che aveva 13 palmi (2,7 m) d'acqua nella stiva sopra la base dell'albero.
L'ex governatore Rodrigo de Vivero, i suoi servitori e i passeggeri “più perbene” contribuirono a sopperire alla mancanza di marinai esperti a bordo del galeone, nonostante le pericolose condizioni causate dal rollio della nave, che contribuirono anche all'apertura di fessure dello scafo.. Inoltre, i marinai dovettero nuotare lungo la linea di galleggiamento della nave perché l'acqua raggiungeva l'albero maestro a causa dello sbandamento del galeone. Le manovre della nave si ruppero, le vele si lacerarono, le provviste furono gettate in mare e solo l'albero di trinchetto rimase in buone condizioni. Pertanto, i piloti e gli ufficiali decisero di dirigersi verso il Giappone e, mentre la nave era in rotta, avvistarono alcune isole a 28,5 gradi di latitudine nord, che furono erroneamente identificate come Las Hermanas. Alcuni dei passeggeri, e in particolare il pilota principale e il contramaestre che trasportavano 150.000 pesos, temevano che il loro denaro sarebbe stato confiscato all'arrivo in Giappone, e pertanto cercarono di convincere il resto dei passeggeri che era impossibile navigare fino a lì e che sarebbe stato più facile dirigersi verso la Nuova Spagna. Riuscirono a convincere tutti, così il Generale ordinò un cambio di rotta verso la Nuova Spagna, nonostante i venti contrari, con il galeone che continuò a navigare con grande difficoltà, e con le vele ammainate, fino al 28 settembre, quando scoppiò un altro uragano, più forte. Il mare agitato spense la lanterna del galeone, riempì la cabina del castello di poppa con due palme (0,42 m) d'acqua e alzò il livello dell'acqua all'interno dell'imbarcazione. Il bompresso si ruppe e, quando la prua del galeone iniziò ad aprirsi, si decise di tagliare l'albero maestro.
La situazione era così disperata che i marinai portarono a poppa, il luogo più sicuro della nave, i gesuiti presenti a bordo, il maestro Salinas e frate Diego del Aguila, per ascoltare le confessioni dei passeggeri che riuscivano a raggiungerli.. Il continuo imbarco di acqua all'interno della nave costrinse tutti, compresi Rodrigo de Vivero, padre Pedro de Montes e altri religiosi, a far funzionare le pompe di sentina senza sosta.
Durante l'ultimo uragano, i piloti persero di vista la latitudine della nave e credettero di trovarsi a 33,5 gradi nord. Il 30 settembre, alle dieci di sera, fu avvistata terra e alcune grandi colline a circa un quarto di lega di distanza. I piloti stavano cercando di doppiare queste colline quando, poco dopo, il galeone si incagliò improvvisamente sugli scogli, inclinandosi di lato e lasciando l'equipaggio e i passeggeri appesi alle sartie. Rimasero in questa situazione dalle 20:30 fino all'alba, e cinquanta persone furono travolte dalle onde e annegarono. Secondo uno dei resoconti dei gesuiti, il San Francisco aveva ancora la vela di prua issata, e quindi il vento continuava a spingere e a rompere lo scafo contro gli scogli. Alla fine la nave si spezzò in due all'alba, e la prua, insieme a parte della parte centrale della nave, affondò immediatamente con tutti coloro che vi avevano alloggiato. Rodrigo de Vivero si salvò perché i piloti avevano deciso di portarlo a prua, ma la nave si spezzò prima che essi raggiungessero il castello di prua.. Le onde trasportarono la sezione di poppa in una piccola insenatura sulla riva, dove si incagliò sulla spiaggia. La sezione di poppa comprendeva la cabina principale e quele più piccole, e persino una parte del primo ponte della nave.. Non e noto con certezza il numero dei sopravvissuti, che varia a seconda delle fonti: Padre Montes afferma che i sopravvissuti furono 300 sulle 400 persone presenti a bordo, mentre Padre Gregorio López disse che annegarono un numero variabile da venticinque a trenta persone. Rodrigo de Vivero indicò il numero dei morti in cinquanta.
Il galeone San Francisco era naufragato al largo della costa orientale della penisola di Bōsō, sull'isola principale giapponese di Honshū, vicino al villaggio di Iwawada, provincia di Kazusa, il 30 settembre 1609.. Rodrigo de Vivero menzionò che i cinque piloti a bordo del galeone commisero un errore di un grado nella stima della latitudine, mentre vi era un errore di due gradi nella carta nautica. Pertanto, i piloti pensavano di aver lasciato la penisola di Bōsō quando il galeone si incagliò sugli scogli. Tuttavia, nel 1610 Juan de Cevicos e Don Juan de Silva incolparono Rodrigo de Vivero per il naufragio, affermando che la nave era così vicina alla penisola di Bōsō perché la vera destinazione del galeone era il Giappone. nella