AMP-deaminata 3 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom AMPD3.
Ovaj gen kodira člana porodice gena AMP-deaminaza. Kodirani protein je visoko regulirani enzim koji katalizira hidrolitsku deaminaciju adenozin-monofosfata u inozin-monofosfat, tačku grananja u adenilatnom katabolitskom putu. Ovaj gen kodira izoforme eritrocita (E), dok drugi članovi porodice kodiraju izoforme koje prevladavaju u mišićnim (M) i jetrenim (L) ćelijama. Mutacije u ovom genu dovode do klinički asimptomskog, autosomno recesivnog stanja, nedostatka AMP-deaminaze eritrocita. Opisane su i alternativno prerađenesu varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme ovog gena.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 767 aminokiselina, a molekulska težina 88.812 Da.
1020304050 MPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIG QKEAKERELQKELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPP AASPAMSPTTPVVTGATSLPTPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQ AAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRITSQYLGHPRADTAPPEEGLPDFHP PPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVYDNKKMLEHQEPHSLPYPD LETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKEL KSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRG RKITLRQVFDGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASE LRDLYLKTENYLGGEYFARMVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPEEW PNLAYWFIQHKVYSPNMRWIIQVPRIYDIFRSKKLLPNFGKMLENIFLPL FKATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKHSDHMFSDKSPNPDVWTSE QNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCGEAGSITHLVSAF LTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLRE FLHKGLHVSLSTDDPMQFHYTKEALMEEYAIAAQVWKLSTCDLCEIARNS VLQSGLSHQEKQKFLGQNYYKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNEL SFLSDAMKSEEITALTN
Modelni organizmi +Fenotip mutantnog nokaut-miša Ampd3 SvojstvoFenotip Vijabilnost homozigota Normalan Studija recesivne letalnostiNormalan Plodnost Normalan Tjelesna težina Normalan Test otvorenog polja: anksioznost Normalan Neurološka procjenaNormalan Snaga stiskaNormalan Test vruće ploče Normalan Dismorfologija Normalan Indirektna kalorimetrija Normalan Test tolerancije glukoze Normalan Slušni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Normalan Radiografija Normalan Tjelesna temperatura Normalan Morfologija oka Normalan Klinička hemija (nalaz)Normalan Plazmatski imunoglobulini Nenormalan Hematologija Normalan Leukociti periferne krvi Nenormalan Mikronukleus test Normalan Težina srca NormalanHistopatologija mozgaNenormalan Histopatologija oka Normalan MikroCT i kvantitativni faksitron Nenormalan Salmonella infekcija Normal Citrobacter infekcija NormalSvi testovi i analize su iz Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana Pnpotm1a (KOMP) Wtsi, generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za nokaut-miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije. Od 24 izvedena testa ina mutantnim miševima, uočene su dvije značajne abnormalnosti. Tokom gestacije, nije utvrđen homozigotni mutantni embrion, pa tako nijedan nije preživio do odvikavanja. Preostali testovi su izvedeni na mutiranim heterozigotnim odraslim miševima; opažene su četiri značajijne abnormalnosti kod ovih životinja. Druga mišja linija, zvana Ampd3T689A, generirana je mutagenezom ENU. Ovaj miš nosi mutaciju koja povećava funkciju AMPD3. Mutantne životinje imaju značajno kraći životni vijek crvenih krvnih ćelija, cikličku eritropoezu, splenomegaliju i otpornost na infekciju sa Plasmodium chabaudi .
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 11 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika Kategorija:Mišji mutirani geni