Rozpoczął swoją karierę pisarską pisząc krótkie historyjki i wysyłając je do japońskich magazynów, które jednakże nigdy ich nie opublikowały. Twierdzi, że jego historie miały zazwyczaj po 400 stron, podczas gdy magazyny preferowały historie mające 100 stron. Po tym, razem ze swoim przyjacielem, skupił się na kręceniu filmów 8 mm kamerą.

Kariera W wywiadzie dla serii G4 Icons, Kojima dużo opowiada o swojej wczesnej karierze i wpływie gier wideo na jego życie. Dorastał oglądając filmy ze swoimi rodzicami. Głównie przypadło mu do gustu amerykańskie kino science-fiction. Studiując ekonomię na uniwersytecie, wolny czas poświęcał na granie w gry wideo na konsoli Famicom. Podczas czwartego roku studiów, Kojima zaskoczył swoich kolegów oświadczając im, że ma zamiar dołączyć do rynku gier wideo, pomimo wcześniejszych ambicji zostania reżyserem filmowym. Twierdził, że kariera w przemyśle gier wideo byłaby dla niego bardziej satysfakcjonująca. Wskazał Super Mario Bros. i Portopia Renzoku Satsujin JikenEverything is Possible: Inside the Minds of Gaming’s Master Storytellers – Page 2 – Features at GameSpot. jako gry, które zainspirowały go do podjęcia tej decyzji.