FC Eschborn spadły do Oberligi 2013/14.
Bayern (Bawaria) Drużyny W Regionallidze w grupie bawarskiej w sezonie 2012/13 występowało 20 drużyn. Drużyna Miasto Sezon 2011/12 Uwagi Drużyny, które występowały w Regionallidze Süd 2011/12: SpVgg Greuther Fürth II Fürth 6 miejsce FC Ingolstadt 04 II Ingolstadt 9 miejsce 1. FC Nürnberg II Norymberga 10 miejsce TSV 1860 Monachium II Monachium 13 miejsce domowe mecze rozgrywa w Ismaning FC Bayern Monachium II Monachium 14 miejsce domowe mecze rozgrywa w Kirchheim bei München FC Memmingen Memmingen 15 miejsce Drużyny, które awansowały z Oberligi 2011/12: TSV 1860 Rosenheim Rosenheim 1 miejsce Bayernliga SpVgg Bayern Hof Hof 2 miejsce Bayernliga SC Eltersdorf Erlangen 3 miejsce Bayernliga TSV Buchbach Buchbach 4 miejsce Bayernliga TSV 1896 Rain Rain 5 miejsce Bayernliga SV Seligenporten Pyrbaum 6 miejsce Bayernliga VfL Frohnlach Ebersdorf bei Coburg 7 miejsce Bayernliga FC Eintracht Bamberg Bamberg 8 miejsce Bayernliga FC Ismaning Ismaning 9 miejsce Bayernliga SV Heimstetten Kirchheim bei München