Kiedy Mongołowie podbili północne Chiny, zakładając dynastię Yuan (1271–1368) nestorianizm został przywrócony temu państwu po kilkusetletniej przerwie. Wraz z rozwojem terytorialnym chrześcijańskie sympatie dworu, podsycane przez wpływowe żony chanów, doprowadziły do zmian w systemie strategicznym. Po pobiciu Bagdadu w 1258 Mongołowie wymordowali wielu mieszkańców, jednak chrześcijanie zostali oszczędzeni. Kiedy wkroczyli do Palestyny pojawiła się nawet idea sformowania franko-mongolskiego przymierza przeciwko muzułmanom.
Mongolskie kontakty z zachodem doprowadziły także do wielu wypraw misjonarskich na wschód, głównie franciszkanów i dominikanów, mających na celu podporządkowanie Mongołów kurii rzymskiej.
Tło thumb|Stela z Xi’an, wzniesiona w 781 roku. Mongołowie byli nawracani na chrześcijaństwo od VII wiekuFoltz, „Religions of the Silk Road”, s. 90–150.Szerszy opis stworzony przez rabana Bar Saumę znajduje się w książce „The Monks of Kublai Khan Emperor of China”, Sir E. A. Wallis Budge. Online.. Wiele szczepów mongolskich, jak Kereici„Kereici byli pół-nomadycznym ludem pochodzenia tureckiego, zamieszkującym tereny wokół rzeki Orchon w dzisiejszej Mongolii Zewnętrznej.