Po upadku ZSRR stan sieci znacznie się pogorszył. W 2004 r. zlikwidowano linie tramwajowe do portu im. Lenina i do Pałacu Sportu. Po likwidacji tej trasy linię tramwajową nr 1 skrócono do nowej pętli Cyrk i stała się linią szczytową, ponieważ pokrywała się z trasą linii nr 3. Zlikwidowano także linię nr 17, która kursowała do portu. W 2008 r. przeprowadzono remont pętli tramwajowej Zaporoże-1 i trasy tramwajowej na prospekcie Lenina.
Sukcesywnie spadała także liczba obsługiwanych linii: 15 (2003 r.), 12 (2005 r.), 10 (2015 r.), 8 (2017 r.), zrezygnowano także z użytkowania zajezdni nr 2, która jednak nie została rozebrana, a jedynie zamknięta.
Linie Stan z 27 grudnia 2019 r. LiniaTrasa125pxWokzał Zaporiżżia I ↔ Zaporiżżia-Liwe125pxZawod «Kremnijpolimer» ↔ Pawło-Kiczkas125pxMajdan Woli ↔ Mjasokombinat125pxMajdan Woli ↔ Zaporiżżia-Liwe125pxAwtostrada ↔ Zaporiżcyrk125pxMajdan Woli ↔ Szewczenkiwśkyj mikrorajon125pxWokzał Zaporiżżia I ↔ Pawło-Kiczkas