W związku z powstaniem Litwy Środkowej 9 października 1920 gmina Rudziszki wraz z mniejszą częścią powiatu trockiego znalazła się w jej strukturachDz. Urz. TKR. Większa, zachodnia część powiatu (choć bez m.in. Troków i gminy Rudziszki) weszła w skład Republiki Litewskiej. Powiat ten zachował nazwę trocki, a siedzibę ustanowiono w Koszedarach, przez co przez pewien czas istniały dwa powiaty o tej samej nazwie – polski i litewski.
13 kwietnia 1922 roku gmina Rudziszki weszła w skład objętej władzą polską Ziemi Wileńskiej – Art. 8., po czym powiat trocki połączono z powiatem wileńskim w nowy powiat wileńsko-trocki). Ziemię Wileńską przekształcono 20 stycznia 1926 w województwo wileńskie.
Według stanu z 1 listopada 1938, gmina podzielona była na 17 gromad: Angleniki, Borcie, Cegielnia, Dołkitany, Ligojnie, Madziuny, Międzyrzecze, Miodowarce, Obale, Ołona, Popiszki, Połuknia, Szklary, Rudniki, Rudziszki, Wejksztelańce i ZwierzyniecRozporządzenie Wojewody Wileńskiego z dnia 20 września 1938 r. w sprawie zmiany granic gromad, utworzenia nowych gromad i ustalenia ich nazw w powiecie wileńsko-trockim (Wileński Dziennik Wojewodzki, 1938, nr. 14, poz.