Systematyka Płaz uchodził w przeszłości za rasę żaby wodnej. Obecnie wiadomo, że stanowi oddzielny gatunek, natomiast żaba wodna jest krzyżówką żaby jeziorkowej i śmieszki. Pomimo tego niektórzy specjaliści nie wliczają jej do Pelophylax esculentus complex, dawniej nazywany Rana esculenta complex (kompleks żab zielonych), gdzie umieszcza się śmieszkę i żabę wodną. Inni naukowcy nie podzielają tego zdania.
Płaza klasyfikowano dawniej w rodzaju Rana. W 1992 Dubois sporządził przegląd nadrodziny Ranoidea. Pomimo trudności między innymi z rodzajem Rana (według późniejszych opracowań Hillisa i Wilcoxa z 2005 miałby on w tej postaci liczyć ponad 250 gatunków) utrzymał go, wprowadzając jednak podział na podrodzaje. Jednym z wprowadzonych przez niego 33 podrodzajów był właśnie Pelophylax, obejmujący "Palaearctic Water Frogs" (żaby wodne Palearktyki). Naukowiec sam przyznawał, że jego klasyfikacja jest tymczasowa, stanowiąc raczej punkt wyjścia do dalszych badań. Frost i współpracownicy zaproponowali w 2006 podniesienie Pelophylax do rangi rodzaju, obejmującego – oprócz żaby jeziorkowej – również żaby śmieszkę i wodną.