Od 8 do 11 kwietnia 1942 w Tiranie trwała pierwsza narada konsultacyjna działaczy Komunistycznej Partii Albanii. 8 kwietnia wydał główny raport ze spotkaniaEnver Hoxha, „Report Delivered to the 1st Consultative Meeting of the Activists of the Communist Party of Albania” w: Selected Works of Enver Hoxha: cz. I, s. 3–30.. W lipcu napisał i wydał w imieniu partii komunistycznej apel do albańskich chłopówEnver Hoxha, „Call to the Albanian Peasantry” w: Sellected Works of Enver Hoxha: cz. I, s. 31–38.. Jego apel miał na celu pozyskanie wsparcia chłopskiego do walki z okupantami. Hoxha zachęcał chłopów do gromadzenia zboża, odmowy płacenia podatków i opłat zwierzęcychEnver Hoxha, „Call to the Albanian Peasantry” w: Selected Works of Enver Hoxha: cz. I, s. 36.. thumb|Enver Hoxha jako partyzant w 1944.
Był inicjatorem powołania na konferencji z 16 października 1942 we wsi Peza Ruchu Wyzwolenia Narodowego (UNC) skupiającego siły antyfaszystowskie niezależnie od ideologii lub klasy. W marcu 1943 roku został wybrany I sekretarzem przez I Krajową Konferencję Partii Komunistycznej. Ruch i jego siły zbrojne występujące pod nazwą UNC-Armia Narodowo-Wyzwoleńcza stały się najsilniejszą siłą polityczną i wojskową kraju. W połowie 1944 roku kontrolowały 3/4 obszaru kraju.