W 2003 roku Ruíz zdobył 15 bramek dla Galaxy i po raz drugi z rzędu zdobył nagrodę Złotego Buta dla najlepszego strzelca rozgrywek. W 2004 roku z Galaxy dotarł do półfinału play-off, a z 11 golami w sezonie stał się najlepszym strzelcem swojego klubu.
W 2005 roku Ruíz przeszedł do teksańskiego FC Dallas. W tym samym roku po raz czwarty z rzędu wystąpił w MLS All-Star, czyli meczu gwiazd. W Dallas zadebiutował 4 lutego w wygranym 2:1 meczu z Chicago Fire, a swojego pierwszego gola dla nowego klubu zdobył w kwietniu w wygranym 3:1 meczu z Chivas USA. W FC grał w ataku z Eddie Johnsonem, a po odejściu Amerykanina jego partenerem w napadzie został Kenny Cooper. W 2005 roku Ruíz zdobył 11 goli, a rok później 13, jednak w obu przypadkach zespół z Dallas odpadał w ćwierćfinale play-off. W 2008 roku grał w dwóch innych klubach Major League Soccer - Los Angeles Galaxy i kanadyjskim Toronto FC.
W 2009 roku Ruíz został piłkarzem paragwajskiej Olimpii Asunción, a następnie przeszedł do meksykańskiej Puebli. Latem 2010 ponownie trafił do Grecji i został piłkarzem Arisu Saloniki.
22 lutego Gwatemalczyk podpisał kontrakt z Philadelphią Union prowadzoną przez Piotra Nowaka.