Aby przeciwstawić się homunkulusom, a także aby znaleźć May Chang (dziewczynkę posługującą się danchemią – leczniczą alchemią), Al i Ed wyruszają na północ i trafiają do fortecy Briggs, dowodzonej przez generał Olivier Mirę Armstrong. W trakcie pobytu w Briggs, przybywa tam Solf Kimblee, który nakazuje Elricowi znaleźć m.in. Scara. Wówczas Edward zostaje rozdzielony z bratem i przez pewien czas wędruje z chimerami Dariusem i Heinkelem, a następnie z homunkulusem-banitą, Greedem od którego dowiaduje się o Dniu Sądu. Wkrótce potem trafiają oni do Liore, gdzie walczą z Pride'm. Pomimo że homunkulus ma przewagę, Edward nie musi obawiać się śmierci, gdyż jest jednym z kandydatów na „ofiarę”. Podczas końcowej konfrontacji udaje mu się zabić Pride'a (osłabionego przeprowadzeniem ludzkiej transmutancji) dzięki pomocy duszy Kimblee'a, uwięzionej wewnątrz homunkulusa. W następnej walce z Ojcem, proteza ręki Edwarda zostaje zniszczona i jego życie jest zagrożone. Wówczas Alphonse, z pomocą May, przeprowadza transmutancję swojej duszy (niszcząc zbroję i powracając do prawdziwego ciała za Bramą Prawdy) i dzięki temu przywraca bratu jego prawdziwą rękę. Aby przywrócić Ala do życia, Ed poświęca własną Bramę, tym samym zrzekając się umiejętności alchemicznych.