Sezon 2006/2007 rozpoczął się dosyć dobrze dla Dinama, które na dzień 4 listopada 2006 jest liderem w tabeli ligi chorwackiej. Ponadto tuż przed rozpoczęciem sezonu Dinamo dołożyło kolejne trofeum do klubowej gabloty, był to Superpuchar Chorwacji wywalczony po zwycięstwie nad zespołem NK Rijeka 4:1. Vukojević wystąpił na razie w 8 meczach, ale nie udało mu się zdobyć żadnego gola. Nie powiodło się zespołowi „Niebieskich” w Pucharze UEFA, gdzie z marzeń o fazie grupowej wyleczył ich francuski zespół AJ Auxerre, a konkretnie polski napastnik, Ireneusz Jeleń. W meczu na Maksimirze Dinamo przegrało 1:2, a jednego z goli dla Auxerre zdobył właśnie Jeleń. Na stadionie l’Abbe Deschamps Auxerre zwyciężyło 3:1, a Jeleń zdobył aż 2 gole. Kontaktowego gola zdobył Eduardo w 61 minucie z rzutu karnego.
thumb
Dynamo Kijów Zawodnik podpisał z najbardziej utytułowanym ukraińskim zespołem, Dynamo Kijów, kontrakt w 2008 roku. Od pierwszych meczów został podstawowym piłkarzem nowego klubu, grając na pozycji pomocnika. W 2012 roku coraz mniej wychodził na boisko dlatego 27 lutego 2013 został wypożyczony do Spartaka MoskwaВукоевич покинул расположение киевского „Динамо” в Турции – UA-Футбол..