Obrazy przekazane przez zmarłą w 1986 córkę Marie, Viebeke, do Muzeum Sztuki w Skagen ukazują talent malarki z niewykorzystanym potencjałem, która mogła stać się jedną z czołowych artystek Skagen. Tę opinię potwierdzono w 2002 w związku z wydaniem książki Tonni Arnolda Kunsten i Marie Krøyers liv i wystawą dotychczas nieznanych prac malarki (40 obrazów i 20 szkiców) w Kunstforeningen w Kopenhadze. Prace odnaleziono we Szwecji. Kilka prac Marie Krøye znajduje się w kolekcji Muzeum sztuki w Skagen.
Dekoratorstwo Do projektowania mebli zainspirował Marie szkocki projektant Charles Rennie Mackintosh. Kiedy w 1895 wraz z pierwszym mężem przeprowadziła się do domu urzędniczego w Skagen Vesterby, zaprojektowała meble i wnętrze. Podobnie zrobiła, gdy nabyli swój dom w Bergensgade w Kopenhadze. Niektóre z jej mebli są przechowywane w Narodowym Muzeum Danii. Ponieważ prenumerowała czasopismo „The Studio”, mogła śledzić twórczość Williama Morris i Edwarda Burne-Jones, którzy byli członkami Arts and Crafts Movment. Rozszerzyły zainteresowania o kominki, tkaniny, wyposażenie kuchni i panele ścienne. Zainspirowała architekta ze Skagen, Ulrika Plesnera, by uwzględnił w swoich pracach plany Marie.