Гаплогруппа DE — человеческая Y-хромосомная гаплогруппа. Её определяют мутации однонуклеотидного полиморфизма M1(YAP), M145(P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183.
Она известна за счёт определяющего её полиморфизма уникального события — инсерции YAP. Эта мутация произошла, когда участок ДНК Alu, копирующий себя, добавил копию в Y-хромосому. Так, Y-хромосомы, содержащие мутацию YAP, называют YAP+, а не содержащие — YAP-.
Появление Происходит от мутации гаплогруппы CT, произошедшей у мужчины, жившего около 68,5 тыс. лет назад (дата определена по снипам компанией YFull).
По одной версии, гаплогруппа DE и YAP+ появились в Африке. Это подтверждается тем, что: В Африке YAP имеет наибольшее распространение (более 80 %). DE содержит две подгруппы, которые не пересекаются филогенетически или географически. Гаплогруппа C появилась примерно в одно время с DE где-то в Азии, и нет никаких свидетельств, в том числе археологических, о миграциях народов из Азии в Африку в ту эпоху.
Более вероятно, что YAP+ родом из Азии. Это подтверждают следующие аргументы: Учитывая наличие YAP у носителей гаплогруппы D в северо-восточной Индии и на Андаманских островах, можно предположить, что в Южной Азии некоторые из хромосом M168 привели к добавлению YAP и мутации M174. Гаплогруппа CT, от которой происходит DE, имеет неафриканское происхождениеChuan-Chao Wang, Li Hui. Comparison of Y-chromosomal lineage dating using either evolutionary or genealogical Y-STR mutation rates, bioRxiv posted online May 3, 2014. Существуют свидетельства несколько более поздних перемещений хромосом из Азии в Африку. Большинство африканских линий E имеет явное европеоидное ближневосточное или североафриканское происхождение и их распространение в Африке среди негроидов объясняется эффектом основателя и замещением исконно негроидных линий A и B.
Однако не исключено формирование гаплогруппы в Северной или Восточной Африке.
В 2016 году Позник и Андерхилл показали, что Y-хромосомная гаплогруппа E возникла за пределами Африки, а общий предок всех неафриканских линий (TMRCA), в том числе гаплогрупп DE и CF, жил ~ 76 тыс. лет назадPosnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences , Nature Genetics, 48, 593–599.. Разделение гаплогруппы DE на субклады D и E произошло 69,0 ± 14,7 тыс. л. н., приход носителей гаплогруппы Е в Африку произошёл 65,5 ± 8,5 тыс. лет назадVicente M Cabrera et al. Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup L3 basic lineages migrated back to Africa from Asia around 70,000 years ago , December 13, 2017.
Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что линии DE и CF разошлись 77 тыс. л. н. (исходя из скорости мутации 0,76×10-9 на пару нуклеотидов в год).
Этногеографическое распространение До сих пор не было найдено ни одного живущего в настоящий момент представителя парагруппы DE. Найденные 5 образцов у нигерийцев оказались на самом деле редким субкладом гаплогруппы D2 (A5580.2)Weale et al. (2003), Rare Deep-Rooting Y Chromosome Lineages in Humans: Lessons for Phylogeography , ''Genetics, Vol. 165, 229—234. То же самое относится к образцу из народа налу из Гвинеи-Бисау . У двух представителей на ТибетеShi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations , BMC Biology, оказался на самом деле субклад D-M174, а также у одного образца из Республики Алтай в БешпельтиреKharkov et al. (2007).
Дерево Филогенетическое дерево YCC 2008Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008. DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183) DE* D (M174, (021355)) E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)
Примечания
DE