Гаплогруппа R — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.
Происхождение Гаплогруппа R является потомком макрогруппы N и по древности, широте распространения и количеству групп-потомков сама может быть названа макрогруппой. Вероятно, возникла на Ближнем Востоке вскоре (всего через несколько тысяч лет) после заселения его людьми (около 55 тыс. л. н.). В дальнейшем из этого региона была осуществлена экспансия, так что носители группы R (зачастую вместе с другими субкладами группы N) распространились: на юг в Аравию и северо-восточную Африку, на восток по Иранскому нагорью, далее в Центральную Азию до Алтая и на Индостан, на север в Анатолию, на Кавказ и далее в восточную Европу.
Субклады R5, R6, R7, R8, R30, R31 являются автохтонными гаплогруппами в Индии. В наборе данных по Центральной Азии (Comas et al. 2004) из 232 линий только 2 принадлежат к R5Malliya gounder Palanichamy et al. Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia , December 2004.
К потомкам этой группы относятся B, UK (и её потомки U и K), F, R0 (и её потомки HV, H, и V), а также pre-JT (и её потомки JT, J и T).
Палеогенетика Митохондриальная гаплогруппа R* была обнаружена у палеосибиряка из Усть-Ишима (Усть-ишимский человек), жившего 45 тыс. лет назад, но в 2016 году команда Позника классифицировала у усть-ишимца митохондриальную гаплогруппу U*Posnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. fig. 15)..
Гаплогруппу R определили у представителея культуры из пещеры (Ранис, Тюрингия), жившего около 45 тыс. лет назадDorothea Mylopotamitaki et al. Homo sapiens reached the higher latitudes of Europe by 45,000 years ago // Nature, 31 January 2024.
Гаплогруппа R определена у позднепалеолитического образца CC7-2289 (ок. 44 тыс. л. н.) из пещеры Бачо Киро в БолгарииJean-Jacques Hublin et al. Initial Upper Palaeolithic Homo sapiens from Bacho Kiro Cave, Bulgaria , 11 May 2020
К гаплогруппе R* относится митохондриальный геном молочного зуба из пещеры Фумане (:it:Grotta di Fumane), найденный в слое возрастом 41 110 — 38 500 лет (протоориньяк)Палеогенетические данные подтвердили, что создателями протоориньякской культуры были люди современного типа , 27.04.2015.
У останков девушки Пальиччи 23 (:en:Paglicci 23) из итальянской пещеры Пальиччи возрастом около 28 тыс. лет была обнаружена кембриджская эталонная последовательность (:en:Cambridge Reference Sequence) HVR1, указывающая на то, что индивидуум имел либо митохондриальную гаплогруппу R, либо митохондриальную гаплогруппу HA 28,000 Years Old Cro-Magnon mtDNA Sequence Differs from All Potentially Contaminating Modern Sequences. Анализ ДНК кроманьонца Paglicci-12, жившего около 24 тыс. лет назад, показал, что он принадлежал к митохондриальной гаплогруппе R.
У обитательницы Афонтовой горы AG-3, жившей 16 930—16 490 лет назад, была обнаружена субклада R1b.
R1 определена у образца yak025 (14 865—14 590 лет до н. э.) из пещеры Хайыргас (Khaiyrgas Cave, дюктайская культура)Gülşah Merve Kılınç et al. Investigating Holocene human population history in North Asia using ancient mitogenomes , 12 June 2018 // Dataset 1 / Table S4. У образца Khaiyrgas-1 из Якутии (16,9 тыс. л. н.) определена R1b.
R9c1b определили у образца Qihe3 (11 747—11 356 лет до настоящего времени) из провинции Фуцзянь в КитаеTianyi Wang et al. Human population history at the crossroads of East and Southeast Asia since 11,000 years ago // Cell, June 24, 2021.
R2-a* определили у образца AH2 (8205—7756 лет до н. э.) из Тепе Абдул-Хосейн (Tepe Abdul Hosein) в Иране (шахрестан Нурабад).
R11 определили у образца NE35 (AR8.9K, ARpost9K, 9131—8770 лет до настоящего времени) из Амурского региона (Китай)Xiaowei Mao et al. The deep population history of northern East Asia from the Late Pleistocene to the Holocene , May 27, 2021.
R3 обнаружена у представителя неолита Венгрии, жившего ок. 7500 лет назадFu. Q. et al. The genetic history of Ice Age Europe, Nature, published online 2 May 2016..
R1b определена у мезолитических обитателей UzOO76, UzOO77_new 7200 л. н. Южного Оленьего островаAlissa Mittnik et al. The Genetic History of Northern Europe , 03.03.2017.
R1a определили у энеолитических образцов I2055 (Unakozovskaya, 6533 л. н.) и I2056 (Unakozovskaya, 6477,5 л. н.) с Северного Кавказа (Унакозовская пещера на ручье Мешоко)Chuan-Chao Wang et al. The genetic prehistory of the Greater Caucasus , May 16, 2018.
R1b1 определена у представительницы эстонской культуры боевых топоров SOP002 (2864—2495 лет до н. э.) из могильника в уезде Ида-ВирумааLehti Saag, Sergey V. Vasilyev, Svetlana V. Oshibkina et al. Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain (Table 1), July 03, 2020 (bioRxiv ).
R1a определили у представителя новосвободненского этапа майкопской культуры I6268 (5564 л. н.) из урочища Клады в Адыгее.
R1a1a определили у образца MK5009.A0101 с Северного Кавказа (Marinskaya 5, 4710 л. н.).
R1b1 определена у образца GLZ003 из Глазково (Glazkovskoe predmestie, Иркутская область), датирующегося возрастом 4519—4417 л. н. (ранний бронзовый век Байкала)He Yu et al. Paleolithic to Bronze Age Siberians Reveal Connections with First Americans and across Eurasia , May 20, 2020.
R1a определили у представителей дарквети-мешоковской культуры (накольчатой жемчужной керамики) эпохи позднего энеолитаChuan-Chao Wang et al. The genetic prehistory of the Greater Caucasus , May 16, 2018.
R1b определена у образца эпохи бронзы Anosovo-1 из Забайкалья (ок. 4 тыс. л. н.)Gülşah Merve Kılınç et al. Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia , 2021.
R1b определили у представителя посткатакомбной лолинской культуры NV3001 (Nevinnomiskiy 3, 3970,5 л. н.) в Калмыкии (Лола).
R1b1 определили у образца BIY002.A0101 (III—II века до н. э., саргатский горизонт) из урочища Горная Бития на реке Ишим, расположенного в 8 км к юго-западу от деревни Нижняя Ильинка (Омская область)Guido Alberto Gnecchi-Ruscone et al. Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians // Science Advances. Vol. 7, Issue 13, 26 Mar 2021.
R+16189 определили у тибетского образца C4568 (Piyangjiweng, префектура Нгари, 2300 л. н.)HONGRU WANG et al. Human genetic history on the Tibetan Plateau in the past 5100 years // SCIENCE ADVANCES, 17 Mar 2023.
R1b1 определили у таримской мумии L5213 (2000—1800 л. н.)Extended Data Table 1 A summary of the Bronze Age Xinjiang individuals reported in this study . From: Fan Zhang et al. The genomic origins of the Bronze Age Tarim Basin mummies // Nature, 2021.
R11R11 MTree обнаружена у неклассифицированного образца KHI001 (средне-поздний бронзовый век) из Восточно-Евразийской степи с АлтаяChoongwon Jeong et al. A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia's Eastern Steppe , 2020.
R1a определили у образца ALA135 (1876—1636 лет до н. э.) из Телль-Атчана (Алалах, Турция)Tara Ingman et al. Human mobility at Tell Atchana (Alalakh), Hatay, Turkey during the 2nd millennium BC: Integration of isotopic and genomic evidence // Plos One, June 30, 2021.
R1b1 определили у представителей унетицкой культуры из Чехии I14191 (Czech_EBA_Unetice, 3850 л. н.)Nick Patterson et al. Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age // Nature, 22 December 2021.
R1b1 обнаружена у образца I3860 (Oy-Dzhaylau III, 3626 л. н.) из среднего-позднего бронзового века Казахстана (Oy_Dzhaylau_MLBA_o) (The Genomic Formation of South and Central Asia, bioRxiv ).
R9b1a3 определили у образца LayiKD01 (1532—1403 л. н.), R9b1b — у образца QinchangKD14 (1545—1407 л. н.) из Китая (Гуанси-Чжуанский автономный район).
R1a1a обнаружена в образце из могильника Канагех (Kanagegh, Армения) возрастом 1500—1300 лет до нашей эрыMargaryan, Derenko et al. Eight Millennia of Matrilineal Genetic Continuity in the South Caucasus , Current Biology 27, 1–6 July 10, 2017, DOI: 10.1016/j.cub.2017.05.087.
R1b1 обнаружена у обитателя Неркин-Геташена (Nerqin Getashen, Армения), жившего 1400—1200 лет до нашей эры.
У образцов из района Хафт-Тапе периода среднего Элама определены митохондриальные гаплогруппы R2 и R5.
R6 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарской республики (VIII—VI века до н. э.)Eugenia Boulygina et al. Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus, 2020.
R9 определена у образца из висячих гробов из ЮньнаниXiaoming Zhang et al. A Matrilineal Genetic Perspectiveof Hanging Coffin Customin Southern China and Northern Thailand, April 24, 20.
R30 определили у человека с южноазиатской примесью в 40–50 % с кладбища Ват Комноу (Vat Komnou) в Ангкор-Борее (Камбоджа), жившего в начале 1-го тысячелетия (95%-й доверительный интервал — 78—234 гг., калиброванная дата)Piya Changmai et al. Ancient DNA from Protohistoric Period Cambodia indicates that South Asians admixed with local populations as early as 1st-3rd centuries CE , July 05, 2022.
R-a5a2a1a1* определили у представителя мазунинской культуры (1680 (1734—1626) л. н.)R-a5a2a1a1 // YFull. MTree, id:CGG021463Hugh McColl, Elizaveta Chernyh et al. Steppe Ancestry in western Eurasia and the spread of the Germanic Languages, Marth 14 2024 (Supplementary Tables S1-S5).
R0a1 определена у образцов с христианского кладбища R (∼650—1000 гг.) на острове в Северном СуданеKendra A. Sirak et al. Social stratification without genetic differentiation at the site of Kulubnarti in Christian Period Nubia , February 17, 2021 (Supplementary Figure 5, 6 ).
R11a обнаружена у позднесредневекового образца DEC01/SHR001 из Монголии.
R1a1a обнаружена у норвежского образца VK114 из Тронхейма (XII—XIII век)Ashot Margaryan et al. Population genomics of the Viking world , 2019.
R9b1b определили у образца HuatuyanNL18 (500 л. н.), R+16189 — у образца HuatuyanNL19 (455—294 л. н.) из Китая (Гуанси-Чжуанский автономный район).
Примечания
См. также
Ссылки
Общие сведения Ian Logan’s Mitochondrial DNA Site - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree R R YFull MTree 1.02.00 (under construction)
Гаплогруппа R Spread of Haplogroup R, from National Geographic
R