Неравновесное сцепление генов ( (LD)) — неслучайное распределение частот аллелей разных локусов, которое может быть обусловлено не только тесным генетическим сцеплением генов, но и наличием адаптивного преимущества конкретной комбинации аллелей, частота которой соответственно возрастает в сравнении с частотой, ожидаемой при случайном распределении.
Программы для вычисления LD LiAn - Linkage Analysis 3.7 (Ias) (online) Arlequin 3.5 (p-values, D, D', r², χ²) (Windows) LinkDos on the Web (Δ, D, D') (online) MultiLocus 1.3b (Ia, rd) (Windows, MacOS) MIDAS - Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)
Визуализация JLIN - Java based Linkage Disequilibrium plotter 1.6.0 (Java) GOLD - Graphical Overview of Linkage Disequilibrium (Windows)
Ссылки Mueller J.C. Linkage disequilibrium for different scales and applications. Brief Bioinform. 2004, 5:355-364. A Compilation of Some Available Software for Linkage Disequilibrium Analysis
Категория:Генетика