Монотопический интегральный белок —Это тип мембранного белка, который постоянно прикреплён к мембране. Все трансмембранные белки можно отнести к интегральным мембранным белкам, но не все интегральные мембранные белки являются трансмембранными. Иммуноглобулины составляют значительную часть белков, закодированных в геноме организма. Белки, проходящие через мембрану, окружены кольцевыми липидами, то есть липидами, которые находятся в непосредственном контакте с мембранным белком. Такие белки можно отделить от мембран только с помощью детергентов, неполярных растворителей или иногда денатурирующих агентов.
Белки, которые лишь временно прикрепляются к клеточным мембранам, называются периферическими мембранными белками. Эти белки могут либо связываться с интегральными мембранными белками, либо самостоятельно встраиваться в липидный бислой несколькими способами.
Структура С помощью рентгеновской кристаллографии или спектроскопии ядерного магнитного резонанса были определены трёхмерные структуры ~160 различных интегральных мембранных белков с точностью до атома. Их изучение сопряжено с трудностями, связанными с выделением и кристаллизацией. Кроме того, в базе данных о белках доступны структуры многих водорастворимых белковых доменов интегральных мембранных белков. Их α-спирали, обеспечивающие фиксацию в мембране, были удалены, чтобы облегчить выделение и кристаллизацию. Поиск интегральных мембранных белков в базе данных о белках (на основе классификации по генной онтологии)
Интегральные мембранные белки можно разделить на две группы:
Интегральные политопные белки (трансмембранные белки)
Интегральные монотопные белки
Интегральный политопный белок Наиболее распространённым типом интегральных мембранных белков является трансмембранный белок, который проходит через всю биологическую мембрану. Однопроходные мембранные белки пересекают мембрану только один раз, в то время как многопроходные мембранные белки пронизывают мембрану несколько раз. Однопроходные мембранные белки можно разделить на белки типа I, которые расположены таким образом, что их карбоксильный конец обращён к цитозолю, и белки типа II, у которых аминоконец обращён к цитозолю. Белки III типа имеют несколько трансмембранных доменов в одном полипептиде, а белки IV типа состоят из нескольких разных полипептидов, собранных вместе в канале, проходящем через мембрану. Белки V типа прикрепляются к липидному бислою с помощью ковалентно связанных липидов. Наконец, белки типа VI имеют как трансмембранные домены, так и липидные якоря.
Примеры монотопических интегральных белков В качестве примера можно привести следующие белки: Простгландин-H2-синтазы 1 и 2 (циклооксигеназы) Ланостеролсинтаза Микросомальная Простгандин-E-синтаза Карнитин-O-пальмитилтрансфераза II
Примечания
Категория:Мембранные белки