Exoribonuclează

miniatura|Diagrama reacțiilor pentru exoribonucleazele 3'-5' hidrolitice (stânga) și fosforolitice (dreapta) în degradarea ARN-ului. O exoribonuclează este o enzimă atât exonuclează, cât și ribonuclează, care degradează ARN-ul prin eliminarea nucleotidelor terminale din capătul 5' sau capătul 3' al moleculei de ARN. Enzimele care elimină nucleotidele din capătul 5' sunt numite 5'-3' exoribonucleaze, iar enzimele care elimină nucleotidele din capătul 3' sunt numite 3'-5' exoribonucleaze.

Exoribonucleazele clivează legătura nucleotidă-nucleotidă, folosind fie apă (caz în care se numește activitate hidrolitică), fie fosfat anorganic (caz în care este numită activitate fosforolitică). Exoribonucleazele hidrolitice sunt clasificate sub numărul EC 3.1, iar exoribonucleazele fosforolitice sub numărul EC 2.7.7. Deoarece enzimele fosforolitice folosesc fosfat anorganic pentru a scinda legăturile, acestea eliberează adenozindisfosfat, iar enzimele hidrolitice (care folosesc apă) eliberează adenozinmonosfosfat.

Exoribonucleazele există în toate regatele biologice, bacterii, arhee și eucariote. Exoribonucleazele sunt implicate în degradarea multor tipuri diferite de ARN, printre care ARN mesager, ARN de transfer, ARN ribozomal și miRNA. Exoribonucleazele pot fi fie proteine simple (precum RNaza D sau RNaza PH), fie complexe de mai multe proteine, precum exozomul (în care sunt reprezentate patru dintre marile familii de exoribonucleaze).

Familii majore FamilieExemplu de membriDistribuțieActivitate cataliticăRNRRNază RCele mai multe bacterii, toate eucariotele3'-5' hidroliticăRNază IIRrp44DEDDRNază DAnumite bacterii, toate eucariotele3'-5' hidroliticăRNază TPM/Scl-100OligoribonucleazăRBNRNază BNAnumite bacterii3'-5' hidroliticăPDXPNPazăToate regatele3'-5' fosforoliticăPM/Scl-75RNază PHRRP4Rrp4Toate eucariotele, cel mai multe arhee3'-5' hidrolitică5PXExoribonucleaza IToate eucariotele5'-3' hidroliticăExoribonucleaza II

Vezi și

Endoribonuclează Nuclează Dezoxiribonuclează Exodezoxiribonuclează Endodezoxiribonuclează

Bibliografie

Categorie:Ribonucleaze