A implementação da Estratégia Global para a Conservação de Plantas (GSPC), é um de uma série de compromissos assumidos pelo Brasil, país signatário da Convenção sobre a Diversidade Biológica (CDB), perante a comunidade internacional. Das 16 metas estabelecidas pela GSPC, a primeira é a elaboração de uma "lista funcional amplamente acessível das espécies conhecidas de plantas de cada país, como um passo para a elaboração de uma lista completa da flora mundial".

O Jardim Botânico do Rio de Janeiro foi então designado pelo Ministério do Meio Ambiente, através do Centro Nacional de Conservação da Flora (CNCFlora), para coordenar a elaboração da Lista de Espécies da Flora do Brasil.

Em setembro de 2008 foi realizado um encontro no Jardim Botânico, que contou com a participação de 17 taxonomistas de diferentes instituições de todo o país. Nesta reunião, foi estabelecido o comitê organizador, os coordenadores de cada grupo taxonômico e as informações que deveriam ser disponibilizadas para cada táxon.

Foram avaliadas um total de 40.982 espécies da flora da Mata Atlântica, sendo 3.608 Fungos, 3.495 Algas, 1.521 de Briófitas, 1.176 Pteridófitas, 26 Gimnospermas e 31.156 Angiospermas. 419 gêneros e 17.624 espécies são endêmicos da Mata Atlântica. A lista abaixo apresenta todas as espécies endêmicas da Mata Atlântica presentes na Lista geral.

Família: #Acanthaceae #Achariaceae #Achatocarpaceae #Agavaceae #Alismataceae #Alliaceae #Alstroemeriaceae #Amaranthaceae #Amaryllidaceae #Anacardiaceae #Annonaceae #Apiaceae #Apocynaceae #Apodanthaceae #Aquifoliaceae #Araliaceae #Arecaceae #Aristolochiaceae #Asteraceae #Balanophoraceae #Begoniaceae #Berberidaceae #Bignoniaceae #Boraginaceae #Bromeliaceae #Burseraceae #Cactaceae #Calyceraceae #Campanulaceae #Canellaceae #Cannabaceae #Cannaceae #Capparaceae #Cardiopteridaceae #Caryocaraceae #Celastraceae #Chrysobalanaceae #Clethraceae #Clusiaceae #Combretaceae #Commelinaceae #Connaraceae #Convolvulaceae #Costaceae #Cucurbitaceae #Cunoniaceae #Cyclanthaceae #Cyperaceae #Dichapetalaceae #Dilleniaceae #Dioscoreaceae #Droseraceae #Ebenaceae #Elaeocarpaceae #Elatinacae #Ericaceae #Eriocaulaceae #Erythroxylaceae #Escalloniaceae #Euphorbiaceae #Fabaceae #Gentianaceae #Geraniaceae #Gesneriaceae #Gunneraceae #Heliconiaceae #Humiriaceae #Hypericaceae #Icacinaceae #Iridaceae #Lacistemataceae #Lamiaceae #Lauraceae #Lecythidaceae #Lentibulariaceae #Linaceae #Linderniaceae #Loasaceae #Loganiaceae #Loranthaceae #Lythraceae #Malpighiaceae #Malvaceae #Marantaceae #Marcgraviaceae #Melastomataceae #Meliaceae #Menispermaceae #Monimiaceae #Moraceae #Myristicaceae #Myrsinaceae #Myrtaceae #Nyctaginaceae #Ochnaceae #Olacaceae #Oleaceae #Onagraceae #Opiliaceae #Orchidaceae #Orobanchaceae #Oxalidaceae #Passifloraceae #Pentaphylacaceae #Peraceae #Phyllanthaceae #Picramniaceae #Piperaceae #Plantaginaceae #Poaceae #Podostemaceae #Polygalaceae #Polygonaceae #Portulacaceae #Proteaceae #Putranjivaceae #Quiinaceae #Ranunculaceae #Rhamnaceae #Rhizophoraceae #Rosaceae #Rubiaceae #Rutaceae #Sabiaceae #Salicaceae #Santalaceae #Sapindaceae #Sapotaceae #Scrophulariaceae #Simaroubaceae #Smilacaceae #Solanaceae #Styracaceae #Symplocaceae #Theophrastaceae #Thismiaceae #Thymelaeaceae #Trigoniaceae #Triuridaceae #Tropaeolaceae #Turneraceae #Urticaceae #Valerianaceae #Velloziaceae #Verbenaceae #Violaceae #Vitaceae #Vochysiaceae #Winteraceae #Xyridaceae #Zingiberaceae __NOTOC__

Angiosperma

Acanthaceae Gêneros: #Aphelandra #Chamaeranthemum #Clistax #Dyschoriste #Harpochilus #Herpetacanthus #Hygrophila #Justicia #Lepidagathis #Mendoncia #Odontonema #Pseuderanthemum #Ruellia #Schaueria #Sebastianoschaueria #Staurogyne #Stenandrium #Stenostephanus __NOTOC__

Aphelandra Aphelandra bahiensis (Nees) Wassh. Aphelandra bahiensis (Nees) Wassh. Aphelandra blanchetiana (Nees) Hook. Aphelandra bradeana Rizzini Aphelandra chamissoniana Nees Aphelandra claussenii Wassh. Aphelandra colorata (Vell.) Wassh. Aphelandra decorata (Nees) Wassh. Aphelandra espirito-santensis Profice & Wassh. Aphelandra gigantea (Rizzini) Profice Aphelandra grazielae Profice Aphelandra harleyi Wassh. Aphelandra hirta (Klotzsch) Wassh. Aphelandra hymenobracteata Profice Aphelandra ignea Nees ex Steud. Aphelandra liboniana Linden ex Hook. Aphelandra margaritae E.Morren Aphelandra marginata Nees & Mart. Aphelandra maximiliana (Nees) Benth. Aphelandra neesiana Wassh. Aphelandra nemoralis Nees Aphelandra nitida Nees & Mart. Aphelandra nuda Nees Aphelandra ornata (Nees) T.Anderson Aphelandra paulensis Wassh. Aphelandra phrynioides Lindau Aphelandra prismatica (Vell.) Hiern Aphelandra rigida Glaz. ex Mildbr. Aphelandra schottiana (Nees) Profice Aphelandra squarrosa Nees Aphelandra stephanophysa Nees Aphelandra variegata Morel Aphelandra wasshausenii Profice Chamaeranthemum Chamaeranthemum beyrichii Nees Chamaeranthemum gaudichaudii Nees Clistax Clistax brasiliensis Mart. Dyschoriste Dyschoriste schottiana (Nees) Kobuski Dyschoriste smithii Leonard Harpochilus Harpochilus phaeocarpus Nees Herpetacanthus Herpetacanthus longiflorus Moric. Herpetacanthus macahensis Nees Herpetacanthus macrophyllus Nees Herpetacanthus melancholicus Mart. ex Nees Herpetacanthus rubiginosus Nees Herpetacanthus tetrandrus (Nees & Mart.) Herter Hygrophila Hygrophila oblongifolia Nees Hygrophila paraibana Rizzini Hygrophila sessilifolia Rizzini Justicia Justicia andersonii Wassh. Justicia antirrhina Nees & Mart. Justicia araucariensis Profice Justicia beyrichii (Nees) Lindau Justicia bradeana Profice Justicia bullata (Nees) Profice Justicia catharinensis Lindau Justicia clausseniana (Nees) Profice Justicia congrua (Nees ex Mart.) Lindau Justicia cuneifolia Nees & Mart. Justicia cydoniifolia (Nees) Lindau Justicia cyrtantheriformis (Rizzini) Profice Justicia flosculosa Profice Justicia fulvohirsuta (Rizzini) Profice Justicia genuflexa Nees & Mart. Justicia harleyi Wassh. Justicia hatschbachii (Rizzini) Wassh. & L.B.Sm. Justicia heterophylla (Nees ex Mart.) Lindau Justicia involucrata (Nees) Leonard Justicia itatiaiensis Profice Justicia kleinii Wassh. & L.B.Sm. Justicia luschnathii Lindau Justicia meyeniana (Nees) Lindau Justicia minensis Profice Justicia nervata (Lindau) Profice Justicia parabolica (Nees) Profice Justicia paranaensis (Rizzini) Wassh. & L.B.Sm. Justicia physogaster Lindau Justicia plumbaginifolia Jacq. Justicia pohliana Profice Justicia polita (Nees) Profice Justicia pygmaea Lindau Justicia regnellii Lindau Justicia scheidweileri V.A.W.Graham Justicia schenckiana Lindau Justicia sebastianopolitana Profice Justicia sellowiana Profice Justicia symphyantha (Nees ex Mart.) Lindau Justicia tijucensis V.A.W.Graham Justicia trifoliata Roem. & Schult. Justicia wasshauseniana Profice Lepidagathis Lepidagathis cuneiformis Kameyama Lepidagathis diffusa (Nees) Lindau Lepidagathis laxifolia (Nees) Kameyama Lepidagathis meridionalis Kameyama Lepidagathis nemoralis (Mart. ex Nees) Kameyama Mendoncia Mendoncia bahiensis Profice Mendoncia blanchetiana Profice Odontonema Odontonema amplexicaule (Nees) Kuntze Odontonema dissitiflorum (Nees) Kuntze Pseuderanthemum Pseuderanthemum detruncatum (Nees ex Mart.) Radlk. Pseuderanthemum exaequatum (Nees) Radlk. Pseuderanthemum heterophyllum (Nees) Radlk. Pseuderanthemum macrophylum (Nees) Radlk. Pseuderanthemum riedelianum (Nees) Radlk. Pseuderanthemum verbenaceum (Nees & Mart.) Radlk. Ruellia Ruellia affinis (Schrad.) Lindau Ruellia blanchetiana (Moric.) Lindau Ruellia curviflora Nees & Mart. Ruellia herbstii (Hook.) Hiern Ruellia kleinii C.Ezcurra & Wassh. Ruellia laxa (Nees) Lindau Ruellia neowedia (Nees) Lindau Ruellia reitzii Wassh. & L.B.Sm. Ruellia riedeliana Profice Ruellia rubiginosa (Nees) Lindau Ruellia serrana Profice Ruellia sessilifolia (Nees) Lindau Ruellia silvaccola (Mart. ex Ness) Lindau Ruellia solitaria Vell. Ruellia subringens (Nees) Lindau Ruellia subssessilis (Nees) Lindau Schaueria Schaueria calycotricha (Link & Otto) Nees Schaueria gonyostachya (Nees & Mart.) Nees Schaueria hirsuta Nees Schaueria lachnostachya Nees Schaueria lophura Nees & Mart. Schaueria marginata Nees Schaueria maximiliani Nees Schaueria schottii Nees Schaueria sulfurea Nees Schaueria virginea Nees Sebastianoschaueria Sebastiano schaueria oblongata Nees Staurogyne Staurogyne alba Braz & R.Monteiro Staurogyne anigozanthus (Nees) Kuntze Staurogyne brachiata (Hiern) Leonard Staurogyne carvalhoi Profice Staurogyne euryphylla E.Hossain Staurogyne eustachya Lindau Staurogyne itatiaiae (Wawra) Leonard Staurogyne mandioccana (Nees) Kuntze Staurogyne parva Braz & R.Monteiro Staurogyne riedeliana (Nees) Kuntze Staurogyne rubescens Braz & R.Monteiro Staurogyne sylvatica Lindau ex Braz & R.Monteiro Staurogyne veronicifolia (Nees) Kuntze Stenandrium Stenandrium tenellum Nees Stenostephanus Stenostephanus lobeliiformis Nees

Achariaceae Carpotroche Carpotroche brasiliensis var. bahiensis Rizzini Kuhlmanniodendron Kuhlmanniodendron apterocarpum (Kuhlm.) Fiaschi & Groppo

Achatocarpaceae Achatocarpus Achatocarpus praecox Griseb.

Agavaceae Hagenbachia Hagenbachia brasiliensis Nees & Mart. Herreria Herreria grandiflora Griseb.

Alismataceae Echinodorus Echinodorus australis Rataj Echinodorus uruguayensis Arechav.

Alliaceae Gêneros: #Nothoscordum __NOTOC__ Nothoscordum Nothoscordum curvipes Ravenna

Alstroemeriaceae Gêneros: #Alstroemeria

__NOTOC__ Alstroemeria Alstroemeria albescens M.C.Assis Alstroemeria amabilis M.C.Assis Alstroemeria calliantha M.C.Assis Alstroemeria capixaba M.C.Assis Alstroemeria caryophyllaea Jacq. Alstroemeria foliosa Mart. ex Schult. & Schult.f. Alstroemeria fuscovinosa Ravenna Alstroemeria malmeana Kraenzl. Alstroemeria radula Dusén Alstroemeria ribeirensis Ravenna Alstroemeria riedeliana Audot. Alstroemeria sellowiana Seub. ex Schenk Alstroemeria speciosa M.C.Assis Alstroemeria variegata M.C.Assis

Amaranthaceae Celosia Celosia corymbifera Didr. Gomphrena Gomphrena scandens (R.E.Fr.) J.C.Siqueira Lecosia Lecosia formicarum Pedersen Lecosia oppositifolia Pedersen Quaternella Quaternella glabratoides (Suess.) Pedersen

Amaryllidaceae Eithea Eithea blumenavia (Koch & Bouché) Ravenna

Griffinia Griffinia alba Preuss & Meerow Griffinia arifolia Ravenna Griffinia colatinensis Ravenna Griffinia concinna (Mart.) Ravenna Griffinia cordata K.D.Preuss & Meerow Griffinia espiritensis Ravenna Griffinia hyacinthina Ker Gawl. Griffinia ilheusiana Ravenna Griffinia intermedia Lindl. Griffinia itambensis Ravenna Griffinia leucantha K.D.Preuss Griffinia mucurina Ravenna Griffinia parviflora Ker Gawl. Griffinia paubrasilica Ravenna Griffinia rochae Morel

Habranthus Habranthus concinnus Ravenna

Hippeastrum Hippeastrum aulicum Herb. Hippeastrum blossfeldiae (Traub & J.L.Doran) Van Scheepen Hippeastrum brasilianum (Traub & J.L.Doran) Dutilh Hippeastrum hemographes (Ravenna) Dutilh Hippeastrum marumbiense (Ravenna) Van Scheepen Hippeastrum morelianum Lem. Hippeastrum papilio (Ravenna) Van Scheepen Hippeastrum psittacinum Herb. Hippeastrum santacatarina (Traub) Dutilh

Worsleya Worsleya rayneri (Hook.f.) Traub & Moldenke

Zephyranthes Zephyranthes amoena Ravenna Zephyranthes capivarina Ravenna Zephyranthes gratissima Ravenna Zephyranthes lagesiana Ravenna Zephyranthes paranaensis Ravenna

Anacardiaceae Schinus Schinus spinosus Engl. Spondias Spondias macrocarpa Engl.

Annonaceae Anaxagorea Anaxagorea silvatica R.E.Fr. Annona Annona acutiflora Mart. Annona bahiensis (Maas & Westra) H.Rainer Annona dolabripetala Raddi Annona ferruginea (R.E.Fr.) H.Rainer Annona leptopetala (R.E.Fr.) H.Rainer Annona neolaurifolia H.Rainer Annona neosericea H.Rainer Annona parviflora (A.St.-Hil.) H.Rainer Annona pickelii (Diels) H.Rainer Annona salzmannii A.DC. Annona sylvatica A.St.-Hil. Annona ubatubensis (Maas & Westra) H.Rainer Annona xylopiifolia A.St.-Hil. & Tul. Bocagea Bocagea longepedunculata Mart. Duguetia Duguetia bahiensis Maas