本項では、TVアニメ『蒼穹のファフナー』（以下、1期と略す）、『蒼穹のファフナー RIGHT OF LEFT』、『蒼穹のファフナー EXODUS』、劇場アニメ『蒼穹のファフナー HEAVEN AND EARTH』（以下、劇場版と略す）、OVA『蒼穹のファフナー THE BEYOND』に登場する人物の解説をまとめる。
アルヴィスのファフナー搭乗者 主要人物を含むアルヴィスの子供たちには、人間以上の脳の処理速度を持たせ、フェストゥムの読心能力に対抗させ、ファフナー・ノートゥングモデルへの搭乗を可能とするため、フェストゥムの因子が組み込まれており、その影響として、それぞれ天才症候群（サヴァン・シンプトム）の兆候を有する現実のサヴァン症候群とは異なる。同項参照。。兆候には個人差や得意分野の差があり、劇中表立って語られないが、話の端々でその兆候を見つけることが出来る。たとえば、1期冒頭で子供たちがいじっている通信機は、構造理解力に優れた衛が修理したものである。またアルヴィス中枢の計器やシステムなども、どの子供達も基本的にごく短時間で使いこなせるようになっている。
また、大人世代の日本人のほとんどが受胎能力を失っているのとフェストゥム因子との融合のため、アルヴィスで生まれた子供たちのほとんどは人工子宮で受精卵を育てて、遺伝操作により生み出された者たちである。さらに中には、アルベリヒド機関によって保管されていた遺伝子を用いて生み出された両親が存在しない子供もおり、そういった子供たちは機関によって適性を見出された、血縁関係がない両親の元に“里子”として出される。
一騎と同級生達 主人公真壁一騎とその同期生。全員が学校で同じクラスで、総士と果林以外は島の実態を知ることなく過ごしていた。人類軍としてフェストゥムと戦っていたカノンも含め、本格的なファフナーパイロットとしてフェストゥムとの戦闘を始めた世代。 全員がノートゥング・モデルの搭乗者であり、北極ミールとの決戦から5年後に当たる『EXODUS』では真矢以外が引退していたが、全員復帰した。10年後に当たる『THE BEYOND』の時点ではフェストゥムに近い存在となった一騎と甲洋以外は死亡あるいは引退しており、実質的な現役パイロットは真矢だけである。 真壁 一騎（まかべ かずき） 声 - 石井真、豊口めぐみ（幼少時代） 誕生日：2131年9月21日 / 星座：乙女座 / 血液型：O型 / 身長・体重：169cm・56kg → 175cm (THE BEYOND) / 好きな物：静かな場所、美味い食事 / 家族構成：父・真壁史彦 【1期】 本作の主人公。陶芸家の父と2人暮らし。男所帯ゆえに家事が得意。 人工子宮で誕生したアルヴィスのファフナー搭乗者の中でも最高ランクの適性を持つが、認識制限コードレベルの解除がその段階にまで成されていないことと皆城総士との関係を考慮され、あえてファフナーの搭乗を当初は避けられていた。天才症候群の影響としては、驚異的な運動能力、反射神経、肉体の耐久力を持つ。 小説版では、総士に「競い合うライバルさえ居れば何所までも成長し、オリンピックの全種目で金メダルを取れる」とまで言われたこともある。咲良が唯一柔道で勝てなかった人物でもあり、対戦した際には彼女を失神寸前にまで追い込み、「いつか殺す」とまで言い残された。その後、一騎は咲良目当ての学校中の男子から挑戦状を受け続ける羽目になる。 幼い頃に親友・総士の左目を傷つけて失明させた事件をきっかけに、無気力で自己否定が強い性格となる。それゆえにファフナーに搭乗していても性格の変化がほとんど見受けられない。しかし実際は、敵を倒すたびに密かに暗い悦びを覚えており、降りた後で自己嫌悪を繰り返している小説版およびCD『NO WHERE』より。。そんな醜い心もジークフリードシステムを介して総士に筒抜けになっているが、周囲には秘密にしていることも負い目となっている総士は一騎に失明させられたことも内緒にしており、二重の意味で負い目となっている。。 フェストゥム襲撃に際して搭乗前の事故で死亡した果林に代わり、急遽マークエルフに搭乗して実戦に臨み迎撃に成功。その後は総士の下す命令に否応なく従いフェストゥムと戦うが、翔子の死と甲洋の離脱により総士へのわだかまりは日増しに強くなっていく。それが総士だけが知る真実に起因することだと気付き、総士の本当の考えを自分も知りたいという思いから、由紀恵に唆され竜宮島を離れる。 島の外の世界を目にし、一時は新国連軍の捕虜となるが、モルドバで再会した日野洋治からファフナー・マークザインを託され、初搭乗時の戦闘でフェストゥムの群れ、ザインが発した高熱でマグマ化した大地、大気を取り込み溶岩に覆われた巨大な赤子のような姿になり、のちに「ザルヴァートル化」と呼ばれる特異現象を引き起こす。その後一騎を迎えに来た真矢と溝口の輸送機に救助され、マークザインと共に竜宮島へ帰還する。帰還後はあらためて総士と向き合い始め、総士もまた不器用ながらわだかまりを解消するため努力したことで、歪だった2人の関係は健全化していく。 物語後半では同化現象の進行により視力が衰え、移動の際に杖が必要な状況になる。ミョルニア（真壁紅音）によってもたらされた最初のデータによって症状は一時的に改善したが、蒼穹作戦時に総士の搭乗していたジークフリードシステムの拘束を解き、同化現象を肩代わりした際に症状が再発。ほぼ完全に失明しながらも総士とのクロッシングが復旧し、総士の指揮でザインの同化による強化と増幅したエネルギーをマークジーベンのドラゴントゥースへ送り、真矢の狙撃で北極ミール・ポラリスの破壊に成功。蒼穹作戦成功後に回収ポイントから溝口の輸送機にて帰途に就いたと思った矢先、マークザインは暴走状態に陥ったイドゥンのマークニヒトに捕らえられ、輸送機ごと消されないために総士の指示でザインの手にあったジークフリードシステムと共に輸送機から落下。フェストゥムの世界の入り口、存在と無の地平線の間際へ落とされるが、フェストゥムの側に居た甲洋が現れ、存在の側へと引き戻され生還。マークザインの中にマークニヒトを封印することに成功する。 北極に単独でとり残されてしまったマークザインに、総士の指示により損傷のなかった長距離輸送機の主翼とエンジンを同化し離陸する事に成功。竜宮島への帰還の途に就くが、総士はフェストゥムに捕縛されていた時の同化により肉体がほぼ失われており、このまま存在と無の地平線を越えフェストゥムの世界へ行くこと、そして必ず再び自分の存在を作り出し帰ることを誓ったのち、ザインの手の中でジークフリードシステムもろとも砕け散り、一騎は慟哭する。ただ一人で島への帰還を果たし、総士との別れ際に交わした再会の約束を胸に出迎えてくれた仲間たちに微笑み、物語は幕を閉じる。 【RIGHT OF LEFT】 総士の幼馴染で僚の後輩。副司令の息子ながら、島の秘密は一切知らされておらず、自分の父親のもう一つの姿も当然知らない。総士とはかつて大変仲が良かったが、ある時期を境に不自然なほど疎遠になり、周囲からも孤立してしまっている。近藤剣司からの決闘を日課のように受けて立つことだけがかろうじて残った繋がり、といううらぶれた日々を過ごしている。 【劇場版】 溝口恭介と共に、甲洋の自宅兼店舗で遭った喫茶店「楽園」の経営を手伝いバイトコックをしている。看板メニューには「一騎カレー」「一騎ケーキ」などがある。 同化現象の進行に伴い両目を失明していたが、北極で回収されたフェストゥムに関するデータによって同化症状を回復させる薬が開発され、明るい場所では多少視える程度に回復している。しかし、一期終盤でマークザインが同化したと思われていたマークニヒトがザインの中で蠢いており、北極で来主操によってその命を繋ぎ留められていた総士とのクロッシングを通じてニヒトを封印し続けていた。その負荷のせいで治療の経過が芳しくなかった事が、エウロス型フェストゥム襲来時に再びマークザインに搭乗した際のデータにより判明する。 来主操のミール・ボレアリオスによって封印から解き放たれたマークニヒトを止めるため、マークザインに搭乗し激突する。カノンの同化を肩代わりする事と、来主のミールが無理矢理従わせていた他のフェストゥムの群れをその束縛から解き放つ事に注力したため、今度は逆にザインが一騎ごとマークニヒトに封印されてしまうが、再度来主がニヒトで群れを率いて竜宮島へ来襲した際、第二次蒼穹作戦により島から発進したRボート第二次蒼穹作戦前の作戦会議では、溝口が「例の(操が運ばれてきた)無人船で攻め込むか」という台詞を口にしているが、実際に作戦に使用されたのはRボートであり、脚本の修正漏れと思われる。のファフナー部隊がボレアリオス内部に攻撃を仕掛けた事でザインの封印が緩み、さらに甲洋のマークフィアーの同化による干渉と、真矢が突き立てたマインブレードにより封印が解け、ザインと共に復活。ボレアリオスによる島への同化攻撃をマークフュンフと共に阻止し、再びニヒトと対峙する。 「島との対決の道を選ばされてしまった自分はもう何も変えられない」と絶望する操に「選ぶんだ、何度でも 悲しいからって諦めないで、そこにいる事を、選び続けろ」と語り、ザインの同化能力によりボレアリオス・ミールによる操への支配に干渉しマークニヒトへの呪縛から解き放ちその代償に一騎自身が結晶化寸前にまで同化されてしまうが、自分のミールに意志を伝える事を選んだ操の呼びかけにより救われ、戦いを止める。その後現れた人類軍の攻撃機から発射された核ミサイルをマークニヒトと共に体当たりで止めようとするが、操がスフィンクス型の姿でマークニヒトから飛び出して単独でミサイルを受け止め、ザインはニヒトによって守られる。爆発によって操の肉体が消滅する寸前、その心と対話し「ああ、俺も(空が)綺麗だと思う」と語り掛けた。ザインを降りた一騎に、操が再生を終えた総士を通して「自分が生まれ直した場所にいつか一騎が来るかもしれない。その時一騎が空を見えないのは悲しい」と語り掛け、一騎の視力を完全に回復させた。それを最後に操の意識は途絶え、入れ替わりに存在と無の地平線から帰還した総士との再会を果たす。 【EXODUS】 喫茶「楽園」の調理人として、島の人々に憩いを提供する。料理の味は絶品らしく、カノンや剣司だけでなく保たちもそれを目当てに来店している。表向きは特に不自由はないように見えるが、これまでマークザインで戦い抜いてきた代償として自分の寿命があと3年程度しかない事が告知されており、総士からは元エースパイロットの経験を活かしファフナーパイロットの教官になる道を打診されるが、「何かを学んでやり始めて、それが『やり残したこと』になるのが嫌なんだ」と答えている。また「3年あれば覚悟も出来る」と嘯くが、裏を返せばまだ迷いが残っている事を本人も気付かず口にしてしまっていた。 最前線で激闘に身を投じ続け、心身に様々な犠牲を強いてきたことや、年齢的にファフナーパイロットであり続けるのが難しくなってきたこともあり、アルヴィス上層部からファフナーへの搭乗を禁じられていた。普段は周囲の配慮を汲んで穏やかに暮らしているが、ウォーカー襲来後は乗れないと知りつつも封印状態のマークザインの元を訪れたり、父である史彦に「自分はまだ完全に（ファフナーに）乗れなくなった訳じゃない」、「いざとなったら自分を（捨て駒でもいいから）使って欲しい」と心情を吐露している。 人類軍兵士の間では、北極ミールを破壊した伝説のパイロット「D・アイランドのカズキ・マカベ」として英雄視され、自分たちにMAKABE因子を与えファフナーに乗れるようにしてくれたと感謝されている。しかし、因子による寿命の短縮という大きなリスクにさらされている彼らから逆に感謝されている事実は、一騎に戸惑いを与える。 派遣部隊の出発から間もなく目覚めた織姫から、真矢たちの危機を知らされ、再びマークザインに乗る事を命じられる。それを己の命の使い方と決意を固め同じくニヒトへの搭乗を決めた総士と共に島から旅立ち、アザゼル型・ロードランナーに襲撃を受けていたシュリーナガルの街に救援として参戦、機体の解体プランのためリミッターを全て外していたマークザインの力で他者を救うという「万能感」「救済意識」の2つが変性意識として発現した。ロードランナー率いる群れを相手に圧倒的な力を見せつけ撃破した後、美羽の願いによりナレイン将軍率いる人類軍とシュリーナガル市民すべてを守るため、脱出行に同行する。 脱出行の中で総士にフェストゥムの世界について尋ね「彼らの世界に触れるには、彼ら自身に触れるしかない」という答えに「それが俺の命の使い道なら、そうする」と返すが、真矢には「2人には帰る場所があって、それはとても幸せなことであるのを忘れないでほしい」と告げられ、全員で生きて島に帰るという決意を新たにする。 アザゼル型・アビエイターとの交戦時の様子から宇宙に他の敵がいること、それが人類軍とフェストゥムの両方に自分たちの居場所を教えている可能性に気付く。また、第二次脱出行で争いを望まないミールの欠片が集まったフェストゥムの森でその命を分けてもらった際は、自分の命の終わりの時が来たら返せるものは返したいと述べるが、同時にナレインから一騎ならミールの祝福を受け「命の果てを超えて戦い続ける永遠の戦士」になれるとも示唆された。竜宮島への合流を図る脱出行の果て、島との合流ポイントが示されたユーラシア大陸東端でのアビエイターとの交戦中についに同化現象が末期まで進行、右腕が結晶化・崩壊してしまう。EXODUS第21話『目覚めの時』。一騎の右腕については、ロードランナーとの戦闘（EXODUS第10話『希望の地へ』）、そしてアビエイターとの一度目の戦闘（同15話『交戦規定アルファ』）の両方でザインの右腕が破壊されており、また常にルガーランスを持って彼らに直接「触れ」続けていたため一騎の右腕にもザインとアザゼル型両方による同化が進行・蓄積していた。その後アビエイターを無理やりに同化し撃破には成功したものの、マークザインは高熱により溶解した岩塊に覆われた状態となり、一騎は昏睡状態に陥る。 眠りの中で、カノンと翔子の姿を借りた竜宮島ミールと対話し、その中で「島のミールは一騎を通して世界を祝福する」こと、「一騎は世界の傷を癒し、存在と痛みを調和させる存在」となる啓示を受ける。ミールの祝福を受け入れる事を自らの意志で選び、「生と死の循環を超えた存在」として覚醒（マスター型フェストゥムになったかは不明）。生命限界はなくなり再びマークザインに搭乗、ディアブロ型の同化攻撃により半壊状態だった竜宮島ファフナー部隊を救い、海神島に根付いたアショーカ・ミールを同化しようしていたベイグラント・ミールの侵攻を暉のゼロファフナーと共に阻止した。続く第四次蒼穹作戦ではジョナサンの駆るマークレゾンとの激闘の果てに相討ち寸前まで持ち込むが、マークザインによる同化を介した説得を選び、ジョナサンに元の記憶を取り戻させ正気に帰し、戦いを止めた。その後ベイグラントのコアによってマークレゾン諸共に虚無の空間へ落とされるが、そこで総士と末期の言葉を交わした後、甲洋と操によって救い出され帰還する。アショーカの世界樹の袂で沈黙したマークニヒトのコックピットから転生した総士を保護し、その2年後に総士とともに海神島で過ごしている姿が描かれ、EXODUSの物語は幕を閉じる。 劇場版で操を解き放った時と同様に、アザゼル型など特に強力な個体を同化する際には「お前は、俺だ 俺は、お前だ」と言葉に出し、一騎が機体の同化能力を引き出す際のキーワードとなっている。 【THE BEYOND】 転生した総士を育てながら海神島で平和な時を過ごしていたが、マレスペロの手引きを受けたマリス・エクセルシアにより総士と2人のエスペラントの少年少女が略取され、その奪還の為にマレスペロの支配下にあるハワイ圏にキャリースラスターで突入する場面から物語が幕を開ける。 アルタイル・ミールとの対話の切り札として成長を遂げた美羽の安全を確保するためマークザインを彼女に譲渡、第五次蒼穹作戦ではエインヘリアル・モデルとして再建造されたマークツヴァイ改・グリムリーパーのパイロットとして参戦。マークザインと同じく強大なエネルギー増幅現象・同化能力を行使し、アバドンの甲洋、クロノスの操と共にミールの影響を強く受けた存在として「3人のエレメント」としてベノン軍から脅威度の高さを警戒されている。 ファフナー搭乗時はSDPとして「無限のクロッシング」が常時発動し続けており蒼穹のファフナー THE BEYOND 1話～3話 劇場版パンフレットより。、味方のみならず戦いで消えていった敵の痛みも全て引き受け、その代償として力の行使と引き受けた痛みが一定量に達する度に、ボレアリオスへ転送され、強制的な休眠状態に陥ってしまい、その度に徐々に人としての感情が失なわれていくTHE BEYOND 第一話『蒼穹作戦』。また、マークアレスを覚醒させた際の眠りの後では目の前にいる真矢の姿が色彩を欠いた像でしか見られなくなった上、それ以外の周囲の景色は闇夜のように暗くほぼ視えなくなっており、肉体はともかく「人としての生存限界」は確実に近づいていた。。第五次蒼穹作戦では大量の敵を無に還しその痛みを引き受けたため、その後のフロロとの交戦中に眠りに落ちてしまい、無人となったグリムリーパーをベノン陣営に奪われてしまう。 グリムリーパーを失った後は西尾暉の乗機をエインヘリアル・モデルへコンバージョンしたマークツェーン改・アキレスに乗り換え（SDPはグリムリーパー時と同様）、アルヴィスの切り札としてパイロットを務めるほか、眠りに落ちていない間は第二種任務として「楽園・海神島店」の調理師を務め続けている。しかしSDPの代償による心の喪失だけでなく、肉体についてもフェストゥムの側に大きく傾いており、食事や料理は必要ではなく「自分を忘れないため」に行っている、と総士に告げている。また、マレスペロの絶対停止領域の影響で海神島の気温が低下し、真矢や竜宮島・海神島陣営の人々の会話時の呼気が白くなっている中、一騎の呼気は白くならず、体温も失っていることがうかがえるTHE BEYOND 第十話『嵐、来たりて』。 偽の竜宮島から総士を救出するが、その際に島の住民たちに擬態していたフェストゥムと総士の“妹・乙姫”であるフロロを彼の目の前で無に還したことで総士の激しい怒りと殺意にまで達する憎悪を向けられる事となってしまう。総士はついぞ一騎と海神島で暮らしていた時の記憶を取り戻す事はなかったが、一騎は変わらず総士への慈しみを持って接し続け、総士の成長と、彼が導く未来を見守り続けた。マークニヒトのパイロットとなった総士に対する「壁」として再びザルヴァートル・モデルを駆る必要性に同意、竜宮島の技術によって改修されたアキレスをかつてのマークザインの時と同じく大量の海水、大気、そしてべノン軍のフェストゥムおよびファフナー、艦隊群を吸収・同化することでザルヴァートル化に成功、“存在（ザイン）”と“無（ニヒト）”（そしてマークレゾン）に続く“全能”たる第4のザルヴァートル・モデル、マークアレスへと再構成した。 自我を持たないフェストゥムの個体を無に還すことに躊躇は持たないが、総士の奪還の際にやむなく無に還したフロロや、それに対して怒りを顕わにして咎めだてたレガートに対しては「消したくはない」という想いを持っている事を吐露する。その言葉通り、第六次蒼穹作戦で竜宮島に向かう一騎をリミッターをすべて外したスペクターで限界以上のSDPを発動しマークアレスの力を写し取ったレガートとの戦いでその攻撃を敢えて躱さずに受け止め「お前は、俺だ 俺は、お前だ」と呼びかけ、強力な同化によってスペクターの強化状態のみを解除し、無への還元は行わなかったTHE BEYOND 第十一話『英雄、二人』。結果的にレガートは限界を超えた力を発揮していたスペクターの強化解除と共にその反動を一身に受け、ソルダートを構成していたものと同様の黒い泥の塊に変化し、崩壊していった。しかし一騎はレガートの命を無に還してはいなかったため、彼は美羽とアルタイルの祝福を受けたスペクターのコアを起点として機体と共に再構成され、存在の側へと戻ってくることが出来た（状況は異なるが、EXODUSの甲洋とマークフィアーの再生に近い現象が起こったと考えられる）。。 EXODUSの時から変わらず「自分の命の使い道」を探し続けており、その事について言及する度に真矢からは悲しげな目で見つめられている。エレメントとしてミールの強い影響を受けた結果、その行動原理もフェストゥムに近いものとなっており、甲洋と共に「美羽の身の安全と意思を最優先にすること」を第一義として行動する。そのため、美羽が操の求めに応じて片腕を同化することに同意し真矢が操を止めるように一騎と甲洋に訴えた際も「美羽ちゃんが望むなら止められない」と答え、総士と美羽が竜宮島へ到達し、美羽とアルタイルが「対話」した結果どうなるかを知って美羽を止めようとした総士の前に立ちはだかることとなり、激昂した総士と最後の激闘を繰り広げる。その中で、存在と無の地平線を越え転生する前に総士が言い遺した「未来へ導け」という言葉を再び耳にし、これが総士が自分に託した未来である事を理解する。戦いの後、自らの役目が終わったとして総士に自分とマークアレスを同化するよう伝えその命と力を捧げようとするが、総士からは「自分や他人を犠牲にする事しか知らないんだな」と突き放される。総士と美羽を見送った後は戦いを止めて竜宮島に留まり、総士と美羽が導く未来を見守ったTHE BEYOND 第十一話『英雄、二人』。美羽とアルタイルの祝福を受け、マレスペロが消え本来の色を取り戻した空を浮上した竜宮島から見上げ「きれいだ…」と呟く。竜宮島への帰還を果たし、我が家へ戻った文彦に対し、長く続いた戦いの中でも怒りや憎しみに囚われず平和を守り抜いた父への心からの感謝と称賛を贈った。 平和を取り戻した人類が再生と復興への道を歩み始める中、再び自分の命の使い道を見つけるために島から出て世界を見て回ることを決意。甲洋のアバドンと共にマークアレスで島の仲間たちに見送られながら青空へと飛び立ち、物語は幕を閉じた。 【評価】 『アニメージュ』の企画「第28回アニメグランプリ」では「男性キャラクター部門」で第31位にランクインした。 皆城 総士（みなしろ そうし） 声 - 喜安浩平 誕生日：2131年12月27日 / 星座：山羊座 / 血液型：A型 / 身長・体重：173cm・61kg/ 好きな物：コーヒー、チェス、クラシック音楽 / 家族構成：父・皆城公蔵、妹・皆城乙姫 【1期】 指揮管制システムであるジークフリードの搭乗者。一騎の幼馴染で乙姫の兄。責任感が強く寡黙な少年。成績優秀だが、愛想がないことと大人びた性格もあって、同世代の仲間に対しても上から目線の趣があり、周囲からは孤立しがち。言葉足らずで不器用な性格が災いして誤解を受けることが多いものの、実は仲間想いでナイーブ。幼少期に一騎から受けた傷で左目を失明している。 島の子供たちの中で唯一、島の外の世界の現実と惨状を知る。竜宮島のコアである乙姫の兄であることもあり、島を守ることに大きな責任を感じ、冷徹で頑なな態度を見せる。 自然受胎も可能だったが、瀬戸内ミールの因子そのものを移植させるため、人工子宮に移され誕生した。天才症候群の兆候により、複数の人間の思考や感情を並列に処理できる頭脳を持つ。他の子供と異なり、既に遺伝子の段階から免疫系レベルまで融合しているので、高いコード形成率と同時に強い同化耐性も持ち合わせておりプロトタイプのジークフリードシステム一体型ファフナー(エーギル・モデル・ゼロファフナー)でも18時間は耐久できるとされていた。、分離統括型である現在のジークフリード・システムへの親和性・耐性も高い。 幼少時代にフェストゥムの因子による同化衝動に襲われ、一緒にいた一騎を同化しようとするが、一騎の咄嗟の反撃で左目を負傷・失明するが、この出来事によって人としての自我を取り戻す。この経験が、「人間・皆城総士」という根源的なアイデンティティの獲得の絶対条件となっており、そのためファフナーへの搭乗時に、機体との一体化によって左目が見えてしまうことに耐えられず、ジークフリード・システムでの指揮担当者としての訓練を受けることとなる。 パイロットたちの心の動きを見透かし、またファフナー搭乗による同化現象の進行＝死への恐怖にさらされているパイロットたちに対して人知れず負い目を感じており、時としてパイロットに冷徹で過酷な命令を安全圏から下す自分自身にも歯痒さを感じている。 終盤で島の中枢部に侵攻したフェストゥムによって、搭乗したジークフリード・システムごと北極に連れ去られる。同化によって心に侵食されつつも抗い、人類軍による北極ミール攻略戦、および竜宮島による蒼穹作戦の中でイドゥンから戦術の情報を与えるよう命じられた際にフェストゥム側へも多大な犠牲を強いる「消耗戦」の情報を与える事でフェストゥムに痛みを教えることを「祝福」として与え、人類軍、竜宮島陣営の勝利に寄与する。 マークザインにより拘束が解かれたことによりクロッシングが復旧。群れが崩壊したことにより、北極ミール・ポラリスが宇宙へ逃げ、地球に向かっている新たなミールと合流しようとしている事を一騎たちに伝え、一騎のマークザインの同化でマークジーベンのドラゴントゥースを強化し、増幅したザインのエネルギーを送って発射して攻撃するよう指示、真矢の照準・狙撃によりポラリスの破壊に成功する。蒼穹作戦完了後輸送機により回収され島への帰途へ就くが、狂乱状態に陥ったイドゥンが駆るマークニヒトにマークザインが捕えられてしまい、一騎と共に輸送機を降りて戦う事を指示。一騎と二人でフェストゥムの世界、存在と無の地平線の間際に落とされるが、フェストゥムの側に居た甲洋の助けで存在の側へ引き上げられ、マークニヒトの封印に成功する。マークザイン単機で北極に取り残された一騎に島へ帰還するための指示を出し軌道に乗せるが、フェストゥムに受けた同化により肉体のほとんどが失われていること、このままフェストゥムの世界へ旅立つことを一騎に告げ、必ず再び自らの存在を作り出して帰還する事を誓った後、マークザインの手の中でジークフリードシステムもろとも結晶化し、砕け散る。 【RIGHT OF LEFT】 僚の後輩で生徒会書記。ノートゥングモデルの起動実験を行うが、機体との一体化によって見えないはずの左目が見えることが「フェストゥムとしての自分」への変化の想起につながり、それによる恐怖と拒絶反応から生じる心理的ガーベッジによって対数スパイラル形成に支障が生じ、起動に失敗する。このためジークフリード・システムへの搭乗を公蔵に命じられ、前線で戦えないことに歯がゆさを感じている。 【劇場版】 肉体を失い、残った精神だけが甲洋とミョルニアに保護されフェストゥムの世界を揺蕩いながらも一騎とのクロッシングを保ち続けており、それによりマークザインの中に同化されたマークニヒトの封印を保っていた(それにより一騎の肉体に負荷が掛かり続けており、治療の効果が思わしくない原因となっていた)。「空がきれいだ」という思考により自我に目覚め対話をしてきたスフィンクス型フェストゥムに『来主操』という名を与え、砕かれた北極ミールから分化した操のミールからは隠され彼の庇護の元で肉体を修復されながら目覚めを待っていた。だがその群れが人類軍の核攻撃で壊滅し、傷ついた操のミールが生み出した新たな群れのフェストゥムの一体が竜宮島を攻撃した後、群れの特使として人間の姿で島へ訪れた操を通して一騎と史彦に、痛みと憎しみに染まった操のミールにマークニヒトが奪われる事、日野美羽こそが対話の切り札である事を伝えこれは操とつながっているミールに自分の存在を晒す危険な行為であり、操は必死に止めていた。、第二次蒼穹作戦への足掛かりを作った。 戦いが終わり、自らのミールと共鳴し竜宮島と一騎を守った操の意識が途絶えるのと入れ替わりに帰還。一騎との再会を果たし、自分の帰る場所を守り抜いてくれた感謝を伝えた。 【EXODUS】 来主操によって再生された肉体は人間のものとして機能しており、かつて失明していた左目も見えるようになり、それによる心理的な負荷も克服している（ファフナー搭乗への障害がなくなった）。