『ゼルダの伝説 時のオカリナ』（ゼルダのでんせつ ときのオカリナ、英題：The Legend of Zelda: Ocarina of Time）は、1998年11月21日に任天堂が発売したNINTENDO 64用アクションアドベンチャーゲーム。アメリカでは同年11月23日、ヨーロッパでは同年12月11日に発売。
概要 ゼルダの伝説シリーズでこれまで用いていた2D見下ろし型視点から転換したシリーズ初の3D作品で、第三者視点と主観視点を併用しながら奥行きのある空間内で戦闘や謎解きを行う。歴代作品に登場した怪物・ガノンの変身前にあたる人間の姿の「ガノンドロフ」や、多様な人種・種族が本作で初登場し、以降のシリーズ作品にも設定が反映されている。また本作では、それまでの3Dゲームで付きものだったカメラワークや操作性の問題の解決策として、第三者視点のまま敵や特定の対象物に自動で照準を合わせながら行動できる「Z注目システム」や、様々な特殊アクションを状況に応じて自動で判別し1つのボタンのみで実行できるシステムなどを搭載している。
これら本作の革新性は高く評価され、第3回CESA大賞（現・日本ゲーム大賞）大賞や、第2回文化庁メディア芸術祭 デジタルアート〔インタラクティブ〕部門 大賞など数多くの賞を受賞した（詳細は「評価」を参照）。
直接の続編に『ゼルダの伝説 ムジュラの仮面』がある。2011年6月には、ニンテンドー3DS用に全面的にリメイクされた『ゼルダの伝説 時のオカリナ 3D』が、2026年11月5日には、Nintendo Switch 2専用ソフトとして、再リメイクされた『ゼルダの伝説 時のオカリナ』が発売予定。
システム 謎解きとアクションというゲームシステムの根幹はそのままにインターフェースを完全に3Dに置き換え、「草や岩を持ち上げて投げる」「ヒビの入った壁を爆弾で壊して進む」など従来作品同様のアクションを3Dでも実現した。ライフの数は最初は3つで最大20。本作ではハート（体力）が0になるとゲームオーバーとなり、タイトル画面に戻るか、セーブした状態からやり直すことができる。また、デスマウンテン火口の灼熱地帯や水中ではリンクの残りハートの数によって制限時間が決まり必ず偶数秒であり、残りハート数1つにつき8秒。例えばハート3つなら24秒である。、時間が切れるとゲームオーバーになる。魔力ゲージはデスマウンテン登山道の大妖精の泉から使用できるようになる。なお、セーブファイルをロードする際に出る数字は、ゲームオーバーの回数を示しているN64のみ。3DSの場合はセーブした日時を表記する。。通貨単位は「ルピー」。
Z注目システム プレイヤーが対象となる物体（ナビィが対象に移動、かつマーカーが表示される）を任意にロックオンし、対象物に対して確実に接近や離脱をしたり、移動しつつ矢などの飛び道具を目標へ確実に狙いを付けることを可能としたシステムである。
従来の3Dアクションゲームでは敵に攻撃を当てるために細かい照準補正を必要とし、正面に向くカメラワークによりプレイヤーキャラクターを適切な位置に動かすことそのものを難しく感じるプレイヤーもいたことから、その対応策として考案されたもので、対象が隠れることが無いようにカメラワークも斜めや横側などに回り込むようにセミオートで補正されるため、プレイヤーキャラクターの位置の把握や敵との間合いを取ることが容易となる。
このシステムによって、3Dアクションの難点とされていたカメラワークと操作性の問題が大きく改善され、以後多くの3Dアクションゲームに類似したシステムが搭載された。
ストーリー ハイラルのコキリの森に住む少年リンクは、コキリ族のパートナーとなる妖精を自分だけが持っていないことを森の仲間に馬鹿にされつつも平和な日々を送っていた。
そんなある日のこと、リンクのもとに妖精ナビィが訪れ、コキリ族の守護神「デクの樹サマ」が危機に落ちていることを知らせにやってくる。デクの樹サマを苦しめていた魔物を退治したリンクは、命尽き果てていくデクの樹サマから森の精霊石を授けられ、ハイラルで「神に選ばれし姫」を探すように言い残された。
遺言に従ってナビィと共に森を旅立ち、ハイラル城でゼルダ姫と出会ったリンクは、彼女から魔盗賊ガノンドロフの野望と精霊石の秘密を聞かされる。ガノンドロフは聖地に眠る「トライフォース」を得るため、その地への扉を開くために必要な「精霊石」を探しているのだという。
リンクはガノンドロフの野望を阻止するため、彼より先に精霊石を集めて聖地への扉を開こうとする。ところが、扉の鍵である「マスターソード」を引き抜いた途端、リンクの身体が封印されてしまう。リンクの身体はマスターソードに触れるには幼すぎたのである。
7年後、封印の末に大人に成長したリンクは封印が解かれ目覚める。しかし、ハイラルは既に「力のトライフォース」を得たガノンドロフの手に落ちていた。光の賢者ラウルとシーカ一族の末裔シークから、ガノンドロフを倒すためには伝説の賢者の力が必要であると聞かされたリンクは、賢者たちの協力を得るため、マスターソードを手に再び冒険に旅立つのであった。
登場人物 一部の登場人物の名前（ラウル、ルト、サリア、ミド、ナボール、ダルニア）は『リンクの冒険』の街の名前から採られている。
主要人物 リンク （Link） 声 - 瀧本富士子（少年期） / 檜山修之（青年期） 本作の主人公。コキリの森に住む少年。名前はゲーム開始時に変更可能だが、デフォルトの名前に従って本稿では「リンク」とする。 周りのコキリ族とは違い自分の妖精を連れていなかったが、森の守り神であるデクの樹サマから妖精が遣わされる。後に自身がコキリ族ではなくハイリア人であると知らされ、ハイラルの運命を背負うために森を後にする。冒険の中で辿り着いた時の神殿でマスターソードを抜いて七年間の眠りについたことで「時の勇者」として覚醒し同時に「勇気のトライフォース」を継承、以降はマスターソードを「時の神殿」にある「時の台座」に抜き差しすることで大人時代と子供時代を行き来しながら冒険を繰り広げる。 年齢に関しては劇中で触れられていないが、攻略本「時のオカリナ百科」に掲載されたスタッフコメントにて「リンクは8歳と15歳を行き来している」と述べられている。 ナビィ （Navi） 声 - 水橋かおり デクの樹サマから遣わされリンクのもとにやってきた妖精。光球に羽根が生えたような外見をしている。リンクの冒険に同行し、戦闘や謎解きをサポートする。 ゼルダ姫 （Princess Zelda） 声 - 水沢潤 ハイラルの王女。幼少期には予知夢でガノンドロフの企みをいち早く察知し、その野望の阻止をリンクと誓い合うが、後にガノンドロフの魔の手が迫り乳母のインパと城を脱出、その際にリンクに「時のオカリナ」を託す。 ガノンドロフ （Ganondorf） 声 - 長嶝高士 ゲルド族の盗賊の男。ハイラル全土を手中に収める野望を抱いている。ハイラル国王に忠義を示して近づいた後にクーデターを起こしてハイラル城を制圧、後に聖地へ侵入し手にした「力のトライフォース」の力で魔王となる。その後、残りのトライフォースを得ようとゼルダ姫を誘拐しリンクと戦いを繰り広げるが敗北し、最後は「力のトライフォース」の力を暴走させ怪物体のガノンとなる。 デクの樹サマ （Great Deku Tree） コキリの森の奥に聳える巨大な樹の精霊で、コキリ族の生みの親であり、リンクの育ての親でもある。森の守り神として長年コキリの森を守ってきたが、悪しき者の呪いにより命が尽きる寸前にリンクを呼び出し、ハイラルを救う勇者としての運命を告げると共に森の精霊石を託して静かにその生涯を終える。 エポナ （Epona） ロンロン牧場で飼育されている栗毛の仔馬。音楽が好きで、特に「エポナの歌」を好む。子供時代に出会ったリンクと仲良くなり、後に大人になった彼と再会して以降はリンクの相棒となる。 ケポラ・ゲボラ （Kaepora Gaebora） 子供時代のリンクの行く先々に現れ助言を与える巨大なフクロウ。。 ラウル （Rauru） 遙か昔に時の神殿を造った光の賢者。肉体は滅びたが、時の神殿内部の異空間「賢者の間」にその魂が生き続けており、いろいろな動植物に姿を変えることができる。マスターソードにより7年間封印されていたリンクに時の勇者としての使命を告げて自身も光の賢者として力を貸す。
ハイリア人 （Hylian） ハイラルに住む一般的な人々。エルフのように耳が長く尖っているが、これは神の声を聴くためとされるゲーム内キャラクターのセリフ（子供時代の城下町）。 マロン （Malon） 声 - 水沢潤 ロンロン牧場で働く少女。エポナと仲が良く、歌を歌うのが好きで、日中牧場に行くと歌っている姿を見ることができる。ゴシップストーンによれば、いつか馬に乗った王子様が迎えにくると思っている。 タロン （Talon） 声 - 長嶝高士 マロンの父で、ロンロン牧場の経営者。のんびりとした性格で温厚な人物だが怠け癖があり、しょっちゅう居眠りをしている。7年後の世界で再訪問すると、従業員だったインゴーに牧場を乗っ取られ、カカリコ村で寝てばかりの怠惰な暮らしをしているが、あるイベントを経てインゴーが改心すると牧場主に復帰する。復帰後はインゴー同様に心を入れ替え、牧場の仕事に精を出すようになった。 インゴー （Ingo） 声 - 長嶝高士 ロンロン牧場の従業員。横柄な態度の野心家で、ぐうたらな経営者（タロン）のせいで彼よりずっと働かされている自分の立場に納得していない。7年後にはガノンドロフの手助けでロンロン牧場を乗っ取るが、後にリンクにエポナを奪われたことで改心した。 名前の由来は頑固で思いやりのない「因業」にもかかっているとされる。 ダンペイ （Dampé） 声 - 長嶝高士 カカリコ村の墓地の墓守。昼は寝ており、夜になると墓地で穴掘りツアーを開催しているが、大人時代には亡くなっており、幽霊となった自身にレースを挑んで勝つと「フックショット」が貰える。 みずうみ博士 （Lake Scientist） ハイリア湖畔にみずうみ研究所を構える博士。湖に流れ着く変なものと水を混ぜ合わせる研究をしている。また、視野が非常に広く、見てないようでも後ろの状況も見通すことができる。
コキリ族 （Kokiri） コキリの森に住む子供の姿をした一族。一人ひとりが自分の妖精を連れている。コキリ族は大人にならない種族なので7年経っても子供のままである。森に住んでいる者は森から出ると命を落とすと言われているが、エンディングでは森の外にあるロンロン牧場にいるのが確認できる。語尾に「ジャラ」と付くコキリ訛りが存在するが、滅多に聞くことはできない。 サリア （Saria） 声 - 水沢潤 リンクの幼馴染である少女。森の聖域の最深部にあるお気に入りの切り株の場所を頻繁に訪れオカリナを奏でている。コキリの森から旅立つリンクに「妖精のオカリナ」を手渡し、後に森に帰ってきたリンクに「サリアの歌」を教える。7年後は森の賢者として覚醒し、リンクに同じ世界には住めないと伝えると共にいつまでも友達でいることを約束する。 ミド （Mido） コキリ族のガキ大将で、コキリ族のボスを自称。普段から妖精を持たないリンクをからかっており、デクの樹サマの許に向かうリンクの邪魔をするが、内心ではリンクを友達だと思っており、7年経っても彼の帰りを待ち続けている。 ファド （Fado） 髪の毛を二つに結んだ「フフフ」という笑い方が特徴的であるコキリ族の少女。コキリの森に入った親方の息子の末路を見届けて大人リンクに「密猟者のノコギリ」を渡す。
ゴロン族 （Goron） デスマウンテンの地下で生活を営む岩のような体躯とつぶらな瞳が特徴である山の一族。性格は非常に温厚で、語尾は「ゴロ」（子供の時は「コロ」）である。ドドンゴの洞窟で取れる岩を主食とし、特上ロース岩が大好物。
ダルニア （Darunia） 声 - 長嶝高士 ゴロン族の族長で、大昔に邪竜ヴァルバジアを封印したゴロンの英雄の子孫。ドドンゴの洞窟の事件解決をきっかけにリンクを兄弟分として認め炎の精霊石を与える。7年後は炎の賢者として目覚め、いつまでもリンクと兄弟であることは変わらないと告げる。 ゴロンキッド ダルニアの息子。リンクがキングドドンゴを倒した後に生まれてリンクと同じ名前（プレイヤーが主人公に付けた名前）を授かっており、ドドンゴを倒した英雄であるリンクに強い憧れを抱いている。 ダイゴロン （Biggoron） 声 - 長嶝高士 デスマウンテンの頂上にいる刀鍛冶の巨大なゴロン族。キングゾーラの昔からの友人でもある。彼の作る刀は絶対に刃こぼれしない逸品である。 チュウゴロン （Medigoron） 声 - 長嶝高士 ダイゴロンの弟。兄ほどではないが、巨大な身体をしている。ゴロンシティにいて、兄と同じく鍛冶の仕事をしているが、彼自身の作った刀はしばらく使用すると刃こぼれしてしまう。
ゾーラ族 （Zora） 太古よりハイラルの水源を守ってきたジャブジャブ様を守り神として崇める一族。魚のような姿をしており、水への適応力に優れている。基本的に理知的で、礼儀正しい性格であり、王族は語尾に「ゾラ」と付く独特の口調で話す。
ルト （Ruto） 声 - 水沢潤 ゾーラ族の姫で、キングゾーラの一人娘。横柄な言葉遣いをするが、優しい一面もある。ジャブジャブ様のお腹でリンクと出会い、リンクにゾーラのエンゲージリングである水の精霊石を与える。7年後には一族の危機を救うべく水の神殿へ向かった末に水の賢者として目覚め、リンクに対して変わらぬ愛を告げ一族を助けてくれたというシークにお礼を言うように頼む。 キングゾーラ （King Zora XVI） 声 - 長嶝高士 本名は「キングゾーラ・ド・ボン16世」。ゾーラ族の王で、ダイゴロンの昔からの友人。他のゾーラ族より遥かに巨大な体躯で、動くのが億劫なためにいつも王座に腰掛けている。
シーカー族 （Sheikah） 代々、ハイラル王家を影から支えたとされる闇の一族。 インパ （Impa） 声 - 瀧本富士子 ゼルダ姫の乳母として仕え、学問や武術を教える。シーカー族の最後の生き残りで、カカリコ村の創設者でもある。7年後には闇の神殿で闇の賢者として目覚め、リンクにゼルダのことを託す。 シーク （Sheik） 声 - 水沢潤 シーカー族の生き残りを自称する謎の青年。忍者のような俊敏なさを持つ。ハープを使った演奏でリンクの行く先々で不思議なメロディーを授ける。 カカリコ村の井戸からボンゴ・ボンゴが復活した際にリンクと共闘するが、二人とも敵わず打ちのめされてしまっている。
ゲルド族 （Gerudo） 盗賊を生業とする砂漠の民。ほぼ女性のみで構成され、100年に一人生まれるという男性が一族の王となる。ゲルドの女性は時々ボーイハントをしにハイラル城下町に行くことがあるという。 ナボール （Nabooru） 声 - 神宮司弥生 ゲルド族の長。気が強く、姉御肌な性格。少年時代のリンクの前で双子の魔女ツインローバにさらわれた後に洗脳を施され、全身鎧の敵「アイアンナック」の姿で7年後のリンクと対峙する。後に洗脳が解けて魂の賢者として覚醒し、リンクに魂のメダルを託す。 コウメ、コタケ （Koume, Kotake） 声 - 神宮司弥生 ゲルド族の双子の魔女で、ガノンドロフの育ての親。コウメは炎の魔法、コタケは氷の魔法を使い、合体すると双方の魔法を操る巨大な若い女性の姿「ツインローバ」となる（詳細はボスの項を参照）。 『大乱闘スマッシュブラザーズ for Nintendo 3DS』以降のシリーズ作品では、対戦ステージ「ゲルドの谷」に登場し、本作同様に、炎の魔法、氷の魔法を使う。
モンスター モンスターとは、フィールドやダンジョンなど、ほとんど場所を問わずに数多く遭遇する。ここでは主なモンスターを解説する。 デクババ 食虫植物型のモンスター。枯れかけていて上を向きながら回転するタイプと、近づくと噛み付いてくるタイプの2種類ある。前者は攻撃してこないが、一定時間で再び生えてくる。頭部を攻撃して倒すとデクの実を、茎部を攻撃して倒すとデクの棒を得られる。 スタルチュラ 天井から降りてくる巨大なクモ型モンスター。背面はドクロ形の硬い甲殻に覆われている。 大スタルチュラ 大きなスタルチュラ。正面からの攻撃が効かない以外スタルチュラとほとんど変わらない。 スタルウォール ツタや壁にへばりついている小さいスタルチュラ。近づくと体が紫に変色し突進してくる。 黄金のスタルチュラ ハイラル各地に100匹存在する、金色に輝くスタルチュラ。壁にへばりついているものがほとんどで、大きさから見てもスタルチュラというよりはむしろ色違いのスタルウォールである。 夜行性であり、ダンジョンや洞窟内に生息している場合が多い。その場から動かず攻撃もしてこないが、触れるとダメージを受ける。倒すと印を残し、これを取らないと復活する。Z注目はできない（印は可能）。 やわらかい土の中が好きであり、ゴシップストーンのメッセージより、やわらかい土の中でムイムイが成長した姿であると思われる。 スタルチュラハウスの家族が言う「呪いのクモ」とはこの黄金のスタルチュラのことであり、一定数倒す毎に家族達の呪いが解け元の姿に戻っていく。大人時代で退治した結果も、何故か子供時代のスタルチュラハウスでも反映される。 キース コウモリ型のモンスター。体当たりで攻撃する。派生種として、炎に包まれた「ファイアキース」と、冷気に包まれた「アイスキース」がいる。 ビーモス 柱に回転する頭部がついた一つ目のモンスター。リンクを視界に捉えるとビームを発射して攻撃する。倒すと頭部が弾け飛び爆発する。なお、このモンスターのみリンクの近くにいても敵接近時のBGMが流れない。 オクタロック タコ型のモンスター。水上から石を飛ばして攻撃してくる。常に水上におり、近づくと水中に潜ってしまう。 ライクライク 筒状の軟体生物。ゆっくりと近づき、接近してきたリンクに身体を伸ばし口で飲み込もうとする。触れると丸呑みにされた後、装備していた店売りの盾や服が剥ぎ取られた状態で吐き出される。奪われた装備は、一定時間以内に撃破することで取り戻すことが可能。 フォールマスター 手首だけのモンスター。ダンジョン内の特定の場所で突然天井から降ってくる。捕まるとダンジョンの入り口まで戻されてしまう。 フロアマスター 外見はフォールマスターに酷似している。強力な威力を持つ体当たりで攻撃し、斬られると3体に分裂する。分裂後は、自らの体を再生するためリンクに飛びついて体力を奪い取ろうとする。 デクナッツ タネを吐いて攻撃する。近づくと地面に潜って隠れようとし、追い詰めるとヒントを言って逃げる。タネ袋をくれるものもいる。 アキンドナッツ 攻撃方法はデクナッツと同じだが、攻撃すると「参ったッピ」と言いアイテムを販売する。ただし通常のショップで買うよりも多少値が張る場合が多い。 オコリナッツ 攻撃方法はデクナッツやアキンドナッツに準拠するが、三回連続でタネを吐き、倒しても何も起こらない。 ウルフォス オオカミ型のモンスター。旋回するように動き、前足で攻撃および防御を行う。 スタルベビー 骸骨のモンスター。子供時代の夜のハイラル平原で無数に出現する。朝日や水を苦手とし、横斬りで斬ると首が飛び、動きが緩慢になる。倒し続けると大型種が出現するが、強さは変わらない。 テクタイト アメンボの様なモンスターだが、設定上はカニ。飛び跳ねながら襲いかかってくる。赤テクタイトと青テクタイトがおり、青テクタイトは水上を移動できる。 ドドンゴ ドドンゴの洞窟に生息する、2本足の恐竜型モンスター。炎を吐き、方向転換の際には尻尾で攻撃してくる。攻撃力は高めだが動きは鈍い。倒されると爆発する。 ベビードドンゴ ドドンゴの幼体。足が無く、ツチノコのような外見をしている。成体と違って動きが素早く、地面から集団で襲い掛かる。ドドンゴと同じく倒されると爆発する。 ポウ この世を恨んで死んでいった人々の魂の塊。ハイラル平原に現れるものと墓地に現れるものの2種類がある。どちらも倒すと魂が残り、ビンに詰めることができる。 ビッグポウ ハイラル平原に出現する、大きなポウ。全部で10体おり、エポナで特定の場所を通った時にのみ出現する。現れた瞬間に逃走を始めるため、徒歩では接近することさえできない。ポウ同様魂をビンに詰めることができる。この魂を集めている人物がいる。 リーデット 生ける屍。生き物の体液を食物とする。ゆっくり歩けば目の前を通っても大きな音を立てない限り気づかれることはないが、見つかると睨みによって動きを封じられ、ゆっくりリンクに近づいてきて、捕まると体力を減らされ続ける。オカリナで「太陽の歌」を奏でると動きを止められる。動きは緩慢で、倒されるとしばらくした後土に還る。 王家の墓穴の他、大人時代の城下町にも徘徊しているが、大乱闘スマッシュブラザーズシリーズに登場するフィギュアの説明文では正体は「住民は各地に避難しているため、単に人の姿をしただけの魔物と思われる」「たまたま人間の形に似ている土くれの怪物」とされている。 攻略本「時のオカリナ百科」のスタッフの会話では「各地にある聖域の影響で犬たちが変異した」と冗談めかして話している。また同著には「ボンゴボンゴが井戸の底で生み出した。もしくはボンゴボンゴと一緒に井戸の底に封印された」とされている。 ギブド リーデットがミイラ化したもの。炎で燃やすとリーデットになる。リーデットと同様に「太陽の歌」で動きを止めることができる。 リーバ 砂漠の砂の中から出現し攻撃してくる。倒し続けると紫色の大型種が登場する。 グエー カラス型のモンスター。リンクめがけて突進してくる。倒し続けると大型種が登場する。鳴き声は「グエー」。 アヌビス 魂の神殿の番人。リンクが動く方向と逆方向に移動し、剣を抜くと炎を吐く。 アモス 石像のモンスター。触れたり、攻撃を加えることで動き出し、倒されると暴れながら爆発する。本物ではないただの石像もある。 シャープ&フラット 音楽家兄弟の幽霊。生前はハイラル王家に仕え、長年の研究の成果をガノンドロフに横取りされかけた。 幽霊四姉妹の次女ジョオ、三女ベス、末妹エイミー 森の神殿を守る幽霊の姉妹。ジョオとベスは絵の中を行き来し、エイミーはブロックパズルに自分の姿を隠している。ダメージを与えるか注目すると透明になり、この間は攻撃が効かない。 リザルフォス 最初に登場する中ボス。剣を装備したトカゲ型のモンスターで、機敏に動きながら剣で斬りつけてくる。2体同時に登場することがある。防具を持たないため耐久力はそれほど高くなく、大人時代は一般モンスターとして登場する。 スタルフォス 剣と盾を装備したシリーズ常連のガイコツ剣士。森の神殿と氷の洞窟（裏）では中ボスとして登場する。盾を構えこちらの様子をうかがいつつ、二段攻撃やジャンプ斬りなどの剣技で攻撃する。2体同時に登場することもあるが、2体目を倒すのに時間を掛けすぎると1体目が復活してしまう。 ダイナフォス リザルフォスに似た恐竜型のモンスター。槍のような大剣を装備し能力的にはリザルフォスを上回るが、やはり防具は持たず、動きもあまり変わらない。 アイアンナック 鎧を纏い、中ボスでは最大の攻撃力と体力を誇る。攻撃されるまでは椅子に座ったまま動かない。 動きは鈍いが大斧による攻撃は強力で、盾を構えていても防ぎきれない。ある程度ダメージを与えると腹部の外装が外れて俊敏な動きを見せるようになる。
中ボス 一般のモンスターに比べ防御するなど知能が高い。各ダンジョンの要所に配置され、戦闘開始前には部屋の扉が閉まる。
ダイオクタ ジャブジャブ様のお腹に登場。巨大なオクタロック。石を発射するオクタロックとは異なり、巨体を活かした体当たりで攻撃する。 四姉妹幽霊の長女メグ 森の神殿に登場。次女、三女、末妹を倒すと出現する。 分身を3体出現させ、本体を含めた4体で襲いかかってくる。 フレアダンサー 炎の神殿に登場。炎の衣を纏っているが、本体は小さい。纏った炎は攻撃に使われるとともに装甲の役目も果たしている。 ホワイトウルフォス 氷の洞窟に登場。白くて一回り大きなウルフォス。 ダークリンク 声 - 檜山修之 水の神殿に登場。主人公の影。プレイヤーが名前を変更した場合は「リンク」の部分がそれに対応したものに変わる。 ダークリンクの体力はリンクの体力を基準に設定される。体の色は最初は半透明だが、戦闘が長引くにつれて黒くなり、攻撃が激しくなる。 デドハンド 井戸の底と闇の神殿に登場。地面から無数に伸びた腕で、本体は地下に隠れている。手がリンクを捕らえると地上に現れ噛み付いてくる。ダンジョンにより腕の数は異なる。腕は倒せるものの再生する。 ゲルドの盗賊 スタルフォスと似た戦い方をする敵。盗賊団に捕まっている大工と会話すると出現する。武器は2本の彎刀で、熟練の剣技を攻撃にも防御にも使う。回転斬りを食らうと一撃で倒され、牢屋に入れられてしまう。4回勝利するとリンクをゲルドの仲間として認める。 アイアンナック 魂の神殿に登場。赤い全身鎧を身につけた騎士で、中身は洗脳されたナボール。魂の神殿のボス部屋直前で戦うことになる。攻撃力は普通のアイアンナックと同じだが、耐久力が増している。
ボス そのステージで入手した武器を駆使することで倒せる場合が多い。キングドドンゴとヴァルバジアのみ他のボスとは異なる専用のBGMが流れる。3DS版では、大人時代でオカリナメロディーの「光のプレリュード」を覚えた後で、リンクの家のベッドを調べると、一度戦ったボスと再戦ができる。 甲殻寄生獣ゴーマ （こうかくきせいじゅうゴーマ） デクの樹サマの呪いの根源である巨大な一つ目の魔物。天井にのぼると卵を産み、卵からは幼生ゴーマが産まれる。 卵を産むことと、海外版では「Queen Gohma」となっていることからメスと考えられる。 猛炎古代竜キングドドンゴ （もうえんこだいりゅうキングドドンゴ） ドドンゴの洞窟の主である巨大なドドンゴ。四肢が発達しており、炎を吐いたり転がったりして攻撃する。口に入ったものは何でも食べる習性をもつ。 電撃旋回虫バリネード （でんげきせんかいちゅうバリネード） ジャブジャブ様に寄生している巨大な寄生虫。数体のバリ（電気クラゲのようなモンスター）に本体を守らせている。攻撃時にはバリを展開し、回転させながら電撃を放ってくる。 異次元悪霊ファントムガノン （いじげんあくりょうファントムガノン） 森の神殿のボス。ガノンドロフにより闇の世界から召喚された、ガノンドロフの幻影。 馬に跨り、絵に出入りしつつ部屋中に稲妻を放つ。馬が倒された後は、空中を漂いつつ右手に持った槍から光弾を放ち攻撃する。また、稀に槍を構え突撃してくる。 灼熱穴居竜ヴァルバジア （しゃくねつけっきょりゅうヴァルバジア） 炎の神殿のボス。かつてゴロンの英雄に退治された邪竜だが、ガノンドロフが復活させ、ゴロン族を喰らわせることで他の部族への見せしめにしようとした。 攻撃方法は、極めて威力の高い火炎を吐く、噛み付く、天井から岩を降らせるなど。顔の部分が非常に硬く、並みの武器ではダメージを与えられない。 姫川明によるコミカライズ版では、当初子竜として城下町で売られていたところを子供リンクが買い取り仲良くしていたものの、七年後の世界でガノンドロフによって邪竜に変えられリンクと対決するという設定になっている。 水棲核細胞モーファ （すいせいかくさいぼうモーファ） 水の神殿のボス。本体は小さな核で、水の触手を操り攻撃してくる。触手に巻き付かれると締め付けられながら振り回され、大きなダメージを受けてしまう。 暗黒幻影獣ボンゴボンゴ （あんこくげんえいじゅうボンゴボンゴ） 闇の神殿のボス。インパにより井戸の底に封印されていたが、彼女の力が弱まったことで封印が解けた。カカリコ村を襲撃し、シークとリンクを倒した後に闇の神殿の最深部に逃げ込む。