320px|thumb|全貌（静岡県富士宮市より）
富士山（ふじさん）は、日本の活火山である日本の活火山で3000 mを超えるのは、富士山・御嶽山・乗鞍岳の3つである。。標高は3775.56 m国土地理院の最新の衛星測位で、基準点（三角点）を測量した結果、3775.56 mで5 cm高かったことが判明した（2024年12月25日）。、山体の最高地点は3776.12 mで剣が峰の最高地点の標高。、日本最高峰（剣ヶ峰）日本が玉山（新高山）のある台湾を領有していた時期を除く。の独立峰で、その優美な風貌は日本国外でも日本の象徴として広く知られている。山梨県（富士吉田市、南都留郡鳴沢村）と静岡県（富士宮市、富士市、裾野市、御殿場市、駿東郡小山町）に跨る。
数多くの芸術作品の題材とされ芸術面のみならず、気候や地層など地質学的にも社会に大きな影響を与えている。懸垂曲線の山容を有した玄武岩質成層火山で構成され、その山体は駿河湾の海岸まで及ぶ。
古来霊峰とされ、特に山頂部は浅間大神が鎮座するとされたため、神聖視された。噴火を沈静化するため律令国家により浅間神社が祭祀され、浅間信仰が確立された。また、富士山修験道の開祖とされる富士上人により修験道の霊場としても認識されるようになり、登拝が行われるようになった。これら富士信仰は時代により多様化し、村山修験や富士講といった一派を形成するに至る。現在、富士山麓周辺には、観光名所が多くある他、夏季シーズンには富士登山が盛んである。
日本三名山（三霊山）、日本百名山『日本百名山』 深田久弥（著）、朝日新聞社、1982年、、pp.269-272、日本の地質百選に選定されている。また、1936年（昭和11年）には富士箱根伊豆国立公園に指定されている。その後、1952年（昭和27年）に特別名勝、2011年（平成23年）に史跡、さらに2013年（平成25年）6月22日には関連する文化財群とともに「富士山-信仰の対象と芸術の源泉」の名で世界文化遺産に登録された。
名称
thumb|right|国際宇宙ステーションから見た春の富士山
語源 富士山についての最も古い記録は『常陸国風土記』における「福慈岳」という語であると言われている。他にも多くの呼称が存在し、不二山もしくは不尽山（例）「田子の浦ゆ うち出でて見れば真白にぞ 不尽の高嶺に雪はふりける」山部赤人 （『万葉集』）。「不二」は「日本最高峰の並ぶものの無い」の意とされる。他に「布士」や「布自」の字を当てている書籍もあった。と表記する古文献もある。また、『竹取物語』における伝説もある。「フジ」という長い山の斜面を表す大和言葉から転じて富士山と称されたという説もある。近代以降の語源説としては、宣教師バチェラーは、名前は「火を噴く山」を意味するアイヌ語の「フンチヌプリ」に由来するとの説を提示した。しかし、これは囲炉裏の中に鎮座する火の姥神を表す「アペフチカムイ」からきた誤解であるとの反論があるフチ＝フンチは「火」ではなく「老婆」の意味である。。その他の語源説として、マレー語説、マオリ語説幻の富士山神話、原ポリネシア語説がある。
明確に「富士山」と表記される過程においては駿河国に由来するとするものがあり - 富士吉田市歴史民俗博物館（2004年3月31日）、記録としては都良香の『富士山記』に「山を富士と名づくるは、郡の名に取れるなり」とある。
富士山にちなむ命名 富士山が日本を代表する名峰であることから、日本の各地に「富士」の付く地名が多数存在している。富士山麓では静岡県に富士市や富士宮市、富士郡、山梨県に富士吉田市や富士河口湖町、富士川町（静岡県庵原郡にもあった町名である〈富士市に編入されている〉）がある。他によくあるものとして富士山が見える場所を富士見と名づけたり（例：埼玉県富士見市）、富士山に似ている山（主に成層火山）に「富士」の名を冠したりする例（信濃富士など）がある。日本国外に移住した日本人たちも、居住地付近の山を「○○富士」と呼ぶことがある。
全国各地には、別称を含めて少なくとも340座といわれる「富士」と名の付く山があり、それらを「郷土富士」と呼ぶ。
地名以外にも「富士」を冠した名称は多く存在する。
また、異名として「芙蓉峰」（ふようほう）「富嶽」（ふがく）ともいう。
小惑星 は富嶽にちなんで命名された。
理化学研究所・計算科学研究センターが擁するフラッグシップスーパーコンピュータ「富岳」は、富士山の最高峰としての性能の高さと、すそ野の広さとしての汎用性の象徴として命名された。
富士山の標高 富士山は独立峰でよく目立ち、日本の最高峰であることからその高さが注目されてきた。福田履軒が観測する以前の認識としては、『月刈藻集』に「直立25町」（2750 m）、『塵塚物語』に「96町あり」（1万560 m）と諸説見られた磯田道史『日本史の内幕 戦国女性の素顔から幕末・近代の謎まで』（中公新書、2017年）p.233.。
標高計測の歴史 以下は、江戸時代からの富士山の標高計測の経緯であるデータ2、4/4ページ 企画展「富士山」、地図と測量の科学館、国土交通省国土地理院、2013年7月12日-9月23日。
明治初期までに測量された富士山の高さ +時代測定年測定者測定法または器械結果/m備考江戸時代1727福田履軒（福は示偏）三角法3895.1『明治以前日本土木史』によれば、測定者は、福田履軒（福は示偏）、高さは3885.96 m となっている土木学会、明治以前 日本土木史、p.1491、1973年2月5日第3刷、岩波書店。1803伊能忠敬三角法3927.71826シーボルトセキスタント3793セキスタント：六分儀1834内田恭象限儀、占気筒3475.71860オールコック気圧計4322※測定法は＜鈴木、1998＞による1860ファガン39871860ウィリアム気圧計3266※測定法は＜鈴木、1998＞による1860ルビェー35181860クニッピング気圧計3729明治時代1874スチュワートオムニメートル37691874フェントン37721874ファーブルブラントン37681880中村精男、和田雄次気圧計3823メンデンホール・田中館愛橘らの富士山頂重力測定と同時に実施1880野尻武助上記の再計算3812温度の補正が異なる1880チャップリン三角測量3787.21880ライン3745.51880シュット3766.41880ミルン3882.31887参謀本部三角測量および平板測量3778 箱岩英一（2003年）:「地質ニュース」pp.23-30、2003年10月 による。
※鈴木弘道（1998年）:「Height of Mountains」、1998年9月
最新の標高 標高として言及されるものには、次の2つがある。
三角点の標高（3775.56 m） 山岳の標高としてよく引用される。それは主な山岳の最高地点近くに三角点が設置されて、その標高が精度良く（cm単位で）計測されており、かつ国土地理院の2万5千分1地形図に標高値が記載されているからであるただし、地形図上に印刷されている標高値は小数以下1桁で示されている。。しかし三角点は近傍の山岳との見通しや設置位置の安定性を重視して設置されることから、山岳の最高地点に設置されるとは限らない日本の主な山岳標高（調査概要） 国土地理院。
富士山では、剣ヶ峰にある二等三角点「富士山」の高さが3775.56 mである。2014年4月1日付け標高改定前の数字は3775.63 mであった。
山体の最高標高 (3776.12 m) 三角点の高さが必ずしも山岳の最高標高とは限らないことから、最高標高の数値が別途に計測されることがある。例えば、国土地理院は日本の主要な1003の山岳について「日本の主な山岳標高」として公表している日本の山岳標高一覧（1003山） 国土地理院。最高標高の地点は岩体の高さなどであって、必ずしも三角点の標高とは限らないため、「日本の主な山岳標高」での山岳標高の表示は1 m単位となっている。この「日本の主な山岳標高」によれば、富士山の高さは3776 mであり、その位置は35度21分39秒 138度43分39秒である。
2014年時点の富士山の最高地点は、剣ヶ峰にある二等三角点「富士山」の位置から北へ約12 m のところにある岩の頂上であり、二等三角点との比高は0.61 m である。したがって、この岩の標高は、3776.12 mとなり、これが富士山、および日本の最高標高である2等三角点「富士山」の標高は3775.51 mである（注：この数値は2014年4月1日現在）。最高地点はこの三角点から北へ約12 mのところにある岩の頂上であり、その高さは、三角点より0.61 mだけ高い（この0.61 mの数値は1991年の観測）。全国で100年以上潮位を測る 高さってなんだろう?（その2）、ページ7/7、国土地理院、2019年3月12日、「現在の三角点の標高は再計算により、3775.51 mです。なお、富士山の最高地点は、三角点の北側の岩の上で、三角点より61 cm高い3776.12 mです。」。
他山の標高 玉山（台湾）- 日本統治時代は新高山と呼ばれ、当時の日本最高峰であった。標高3952 m。 雪山（台湾）- 日本統治時代は次高山と呼ばれ、当時の日本で2番目に高い山であった。標高3886 m。 北岳 - 現在の日本で2番目に高い山。標高3193 m。 御嶽山 - 日本で2番目に高い火山。日本で2番目に高い独立峰とも見なされる。標高3067 m。 日和山 - 日本で最も低い山。標高3 m（かつて日和山は標高6.05 mあったが、2011年3月の東日本大震災の津波で削られて、標高3 mになった）。 天保山 - 日本で2番目に低い山。標高4.53 m。2011年3月の東日本大震災までは、日本一低い山であった。 エベレスト - 世界最高峰。標高8848 m。 K2 - 世界で2番目に高い山。標高8611 m。パキスタンのカラコルム山脈にある。
地質学上の富士山 thumb|富士山の構造図 thumb|富士山周辺の地形図 地質学上の富士山は典型的な成層火山であり、この種の火山特有の美しい山体を持つ。 現在の富士山の山体は、大きく分けて下記の4段階の火山活動によって形成されたものだと考えられている。 先小御岳（せんこみたけ）火山 小御岳（こみたけ）火山 古富士（こふじ）火山 新富士（しんふじ）火山 この中で先小御岳が最古であり、数十万年前の更新世にできた火山である。東京大学地震研究所が2004年4月に行ったボーリング調査によって、小御岳の下にさらに古い山体があることが判明した。安山岩を主体とするこの第4の山体は「先小御岳」と名付けられた富士火山の活動の総合的研究と情報の高度化 - 東京大学 火山噴火予知研究推進センター （アーカイブ版）。
古富士は8万年前頃から1万5千年前頃まで噴火を続け、噴出した火山灰が降り積もることで、標高3000 m弱まで成長した。山頂は宝永火口の北側1–2 kmのところにあったと考えられている。
2009年10月に、GPSによる富士山の観測で地殻変動が確認された。これは1996年4月の観測開始以来初めてのことである。この地殻変動により最大2 cmの変化が現れ、富士宮市 - 富士吉田市間で約2 cm伸びた。これはマグマが蓄積している（活火山である）表れとされている「地殻変動：噴火予知連、富士山で最大2センチ観測--96年来初」 毎日新聞、2009年10月6日。
プレートの観点からは、ユーラシアプレート外縁部で、北アメリカプレートまたはオホーツクプレートと接するフォッサマグナ（すぐ西に糸魚川静岡構造線）に南からフィリピン海プレートが沈み込む位置であり（ほぼ、相模トラフと駿河トラフおよび伊豆・小笠原・マリアナ島弧を陸上に延長した交点）、3個のプレートの境界域（三重会合点）となっている。富士山下で沈み込んでいるフィリピン海プレートのさらに下に太平洋プレートが沈み込んでおり、富士山のマグマは、東日本にある島弧火山と同様に太平洋プレートに由来するものである富士火山地質図 -産総研地質調査総合センター、2017年3月閲覧。富士山の火山上の特徴には、側火山が非常に多いこと静岡大学火山防災センター、2020年8月閲覧、日本の火山のほとんどが安山岩マグマを多く噴出しているのに対し、富士山は玄武岩マグマを多く噴出することがある。
富士山頂 thumb|山頂火口を上空より thumb|富士山の眺め。その1、飛行機の窓から見た富士山。その2、ズームイン。その3、新幹線の窓から見た富士山。 thumb|山頂火口
山頂には火口（お鉢）がありこれを「大内院」と呼ぶ。これを囲むように位置する8つの峰を八神峰と呼ぶ。火口の南西側に最高点の剣ヶ峰があり二等三角点（点名は、富士山。標高3775.51 m 2014年4月1日改算）、火口の北側には二等三角点（点名は、富士白山。標高3756.23 m 2014年4月1日改算）が設置されている。火口の構造は、国土地理院によると、最深部の標高が3538.7 m、火口の深さは約237 m、山頂火口の直径は780 m、火口底の直径は130 mとある「富士山」の火山基本図を刊行 - 国土地理院（2002年7月29日）。 #富士山の山頂も参照
宝永山 thumb|right|宝永山と宝永噴火口 宝永山（ほうえいざん）は宝永4年（1707年）の宝永大噴火で誕生した側火山（寄生火山）である。富士山南東斜面に位置し標高は2693 mである。宝永山の西側には巨大な噴火口が開いている。これらを間近で見ることができる登山コースも整備されている。
側火山群 富士山には宝永山のほか70以上の側火山があり、鑵子山（かんすやま）、浅黄塚、腰切塚、東臼塚、平塚などがある。
以下は富士山の主な側火山と標高である（標高は資料により違いがある）。
大室山（標高1,300 m） 長尾山（標高1,424 m） 片蓋山（標高1,468 m） 弓射塚（標高1,570 m） 伊賀殿山（標高1,490 m） 野頭山（標高1,510 m） 二ツ塚（標高1,492 m） 西剣（標高1,570 m） 臼山（標高1,720 m） 椹山（標高1,630 m） 氷山（標高1,553 m） 幸助丸（標高1,870 m） 八軒山（標高1,770 m） 桟敷山（標高1,800 m） 大平山（標高2,100 m） 丸山（標高1,700 m） カタボッコ（標高1,290 m） 東剣（標高1,649 m） 天神山（標高1,430 m） 塒塚（標高1,598 m） 犬涼み山（標高1,206 m） 奥庭（標高2,180 m） 焼山（標高1,660 m） 小富士（標高1,906 m） 二ツ塚第一丘（標高1,926 m） 二ツ塚第二丘（標高1,802 m） 荊塚（標高1,651 m） 浅黄塚（標高1,575 m） 桧塚（標高1,390 m） 西臼塚（標高1,293 m） 西黒塚（標高1,470 m） 平塚（標高1,495 m） 腰切塚（標高1,474 m） 赤塚（標高1,374 m） 鑵子山（標高1,306 m）
源流の河川 源流となる以下の河川は4水系に区分され、すべて太平洋へ流れる。 相模川 酒匂川 黄瀬川（狩野川水系） 潤井川、芝川（富士川水系）
富士山と火山活動 富士山の噴火
最終氷期が終了した約1万1千年前、古富士の山頂の西側で噴火が始まり、溶岩を大量に噴出した。この溶岩によって、現在の富士山の山体である新富士が形成された。その後、古富士の山頂が新富士の山頂の東側に顔を出しているような状態となっていたと見られるが、約2500–2800年前、風化が進んだ古富士の山頂部が大規模な山体崩壊（「御殿場岩なだれ」）を起こして崩壊した。
新富士の山頂から溶岩が噴出していたのは、約1万1千年前–約8000年前の3000年間と、約4500年前–約3200年前の1300年間と考えられている。山頂部からの最後の爆発的噴火は2300年前で約50年ぶりに富士山の地質図を全面改定 産業技術総合研究所 地質調査総合センター 2016年7月15日、これ以降は山頂部からの噴火は無いが、長尾山や宝永山などの側火山からの噴火が散発的に発生している。
延暦19年 – 延暦21年（800年 ‐ 802年）に延暦噴火（『日本紀略』、要約すると、「富士山が自ら燃え、夜も火の光が照らし、雷灰が落ち、山下の川水は紅色になった」とある）、貞観6年（864年）に青木が原溶岩を噴出した貞観大噴火が起きた。最後に富士山が噴火したのは宝永4年（1707年）の宝永大噴火で、噴煙は成層圏まで到達し、江戸では約4センチメートルの火山灰が降り積もった。また、宝永大噴火によって富士山の山体に宝永山が形成された。その後も火山性地震や噴気が観測されており、今後も噴火の可能性が残されている。
噴火の年代が考証できる最も古い記録は、『続日本紀』に記述されている、天応元年（781年）に富士山より降灰があったくだりである。平安時代初期に成立した『竹取物語』にも、富士山が作品成立の頃、活動期であったことを窺わせる記述がある。平安時代の歴史書『日本三代実録』には貞観大噴火の状況が迫力ある文体で記載され、平安時代中期の『更級日記』には、富士山の噴気や火映現象を表した描写がある。
宝永大噴火についての記録は、新井白石による『折りたく柴の記』をはじめとした文書、絵図等により多数残されている。その後も、噴煙や鳴動の記録は多く残されているが、記述から見て短期間かつ小規模な活動で終わったものと推測される。
宝永大噴火以来300年にわたって噴火を起こしていないこともあり、1990年代まで小学校などでは富士山は休火山と教えられていた。しかし先述の通り富士山にはいまだ活発な活動が観測されており、また気象庁が休火山という区分を廃止したことも重なり、現在は活火山に区分されている。
2013年7月20日、産業技術総合研究所は、1999年から約15年分の踏査データや地質調査データをまとめ富士火山地質図第2版（Ver.1）として発表し地質調査総合センター研究資料集 no. 592、2016年には修正加筆が終了した。同時に、溶岩が流れ出す規模の噴火は過去2000年間に少なくとも43回あったとしている。
山体崩壊の発生 地震および噴火活動にともなう山体崩壊（岩屑（がんせつ）なだれ）が発生年代が不明確なものも含めて南西側に5回、北東側に3回、東側に4回の計12回起きたとされている小山真人：富士山の山体崩壊 - 静岡大学防災総合センター 静岡大学教育学部総合科学教室 小山真人研究室 ※東京新聞に掲載（2012年10月31日）。また、直下に存在が示唆されている活断層の活動によるマグニチュード7クラスの地震による崩壊も懸念されている。 主な発生歴 約2900年前（御殿場泥流）：東斜面で大規模（約18億 m3）な山体崩壊 静岡大学防災総合センター 静岡大学教育学部総合科学教室 小山真人研究室 が発生し、泥流が御殿場周辺から東へは足柄平野へ、南へは三島周辺を通って駿河湾へ流下。山体崩壊の発生原因は不明。 1331年の元弘地震 に伴い発生 地震予知連絡会 会報 第46巻。 明治24年（1891年）の濃尾地震 に伴い発生明治24年(1891)地震動による崩壊 静岡大学防災総合センター 静岡大学教育学部総合科学教室 小山真人研究室。
災害対策 火山噴火予知連絡会 - 富士山のみに限定するものではないが、日本の火山活動についての検討を実施する。状況に応じて見解を発表するが、噴火の日時を特定して発表することはない。定例会は年3回実施されるが、噴火時には随時開催される。2000年10月に富士山の低周波地震が増加した際は、ワーキンググループが設置され、富士山に関する基礎データの収集・整理、監視体制の検討、火山情報発信の方法などが集中的に検討された。 内閣府はウェブサイト「富士山の火山防災対策富士山の火山防災対策 内閣府」を開設して、富士山ハザードマップ検討委員会などの情報を提供している。 富士直轄砂防事業 - 国土交通省富士砂防事務所は、大沢崩れを源にして発生する大規模な土石流から下流の保全対象を守る砂防事業を実施中。 山梨県と静岡県は「富士山噴火時避難ルートマップ」を作成した静岡県 富士山火山防災対策 静岡県山梨県 富士山噴火時避難ルートマップ。 静岡市市長の田辺信宏は2016年1月22日の定例記者会見で、市消防航空隊が2013年、富士山で滑落した登山者を救助中にヘリコプターから落下させ、この登山者が死亡した事故を受け、再発防止策として、市消防局がヘリで救助できる山の高さに3200 mと上限を設けたことを明らかにしたヘリ救助上限、3200メートルの山…静岡市長。
地殻変動の観測 政府系機関（防災科学技術研究所、気象庁、国土地理院、産業技術総合研究所）や自治体（山梨県富士山科学研究所）及び大学（東京大学地震研究所）などにより観測が行われている。 国土地理院：地磁気観測点地磁気連続観測(観測所) - 国土地理院が、鹿野山測地観測所、水沢測地観測所および江刺観測場に設置されている。また、山頂にはGPSの電子基準点。 気象庁観測所富士山 観測点配置図 - 気象庁：地震計（山頂、御殿場口8合目、吉田口6合目、鳴沢塒塚東、太郎坊）、傾斜計（太郎坊）、空振計（太郎坊、上井出）、GSP（太郎坊）、望遠カメラ（萩原） 防災科学技術研究所火山活動連続観測網VIVA ver.2 富士山 - 防災科学技術研究所： 火山活動可視情報化システム(VIsualization system for Volcanic Activity)
噴出物災害などへの対策 国土交通省中部地方整備局富士砂防事務所が静岡県、山梨県と連携して火砕流、溶岩流などの火山活動に伴う災害を防ぐための調査・検討を実施。ハザードマップを作成している富士山火山ハザードマップ - 富士宮市役所。しかし、山体崩壊を想定したハザードマップは2012年時点では未作成である。 中央防災会議が東京など首都圏への火山灰降下を想定した対策の検討を2018年に開始した「富士山火山灰対策を検討／交通などの影響 最小限に／中央防災会議」『日本経済新聞』朝刊2018年9月12日（社会面）2018年9月12日閲覧。。
富士山と気象
富士山での気象観測 かつて気象庁東京管区気象台が富士山頂剣ヶ峯に設置していた気象官署が富士山測候所である。現在は富士山特別地域気象観測所となっており、自動気象観測装置による気象観測を行っている。
気象現象 山体に強風が吹くと砂が巻き上げられ、周辺の自治体に降ることがある。2010年12月15日には、神奈川県の西部から南部にかけて黒い砂が積もり、その状況から富士山の砂が巻き上げられ、西風に乗り降り積もったと考えられると報道された「謎の黒砂、富士山から?」 朝日新聞（2010年xx月17日付、朝刊39頁）。 富士山の「初冠雪」は甲府地方気象台が観測・発表している。これとは別に、雲などに遮られず「誰もがきれいだと実感できる降雪」を判断基準とした「初雪化粧」を、富士山北麓にある山梨県富士吉田市の富士山課が独自に宣言している晴れて富士山「初雪化粧」『朝日新聞』夕刊2017年10月26日。 富士山北麓の一部地域（現在の山梨県富士吉田市など）では、富士山の標高2600 m付近に現れる農鳥（のうとり）（鳥の形に見える残雪）の出現する時期によって、農作物の豊作・凶作を判断する言い伝えがある。 富士山では山岳波が発生することもあり、航空機の墜落事故も起きている（英国海外航空機空中分解事故など）。それゆえ、現代の航空関係者の間では、富士山の近くを飛ぶ時は要注意というのが常識となっており、特に「晴れた富士山には近づくな」が合言葉となっている。晴れて大気が乾燥している時は、雲から山岳波の存在に気づくことができず、知らぬ間に山岳波の中に入ってしまう可能性があるからである。
富士山麓の自然環境 富士山麓の天然記念物として、「富士山原始林及び青木ヶ原」（天然記念物：1926年2月24日指定、2010年3月8日追加指定・名称変更）、「富士風穴」（天然記念物：1929年12月17日指定）などがある。
伏流水 thumb|right|白糸の滝（静岡県）
富士山に降った雨や雪は、長い年月をかけ伏流水として地下水脈を流れ湧き出てくる。最も高い地点から湧き出す湧水として確認されている例は標高1670 m（富士宮口二合目付近）とされ、その他山麓を帯状に分布している。富士山麓における湧水の総湧出量は1968年で1日あたり154万 m3以上だという。しかし、近年湧出量の減少が確認されている例がある。 地域名称南東麓柿田川（日本三大清流）、小浜池南麓吉原湧泉群西麓湧玉池（特別天然記念物）、白糸の滝（国指定の名勝および天然記念物）、猪之頭湧泉群北麓忍野八海（国指定の天然記念物）
また、一部で駿河湾や富士五湖の西湖（水深25 m付近）で湧出があるとされている。
富士山を源とする伏流水を利用し、周辺地域で製紙業や医薬関連の製造業などの工業が活発に行われている。また、富士山の伏流水はバナジウムを豊富に含んでいるため、ミネラルウォーターとしてペットボトル詰めされ、販売されている。
溶岩洞窟 thumb|right|西湖コウモリ穴入口 富士山麓周辺には大小100以上の溶岩洞窟が形成されている。
その中でも総延長2139 mの三ツ池穴（静岡県富士宮市）は溶岩洞窟として日本一の長さを誇る。また、山麓周辺で最大規模の溶岩洞窟として西湖コウモリ穴（山梨県南都留郡富士河口湖町）があり、国の天然記念物に指定されている。その他、鳴沢氷穴（山梨県南都留郡鳴沢村）も国の天然記念物に指定されている。
植生 富士山は標高は高いが、日本の他の高山に比較すると高山植物などの植生に乏しい。これは富士山が最終氷期が終了した後に山頂から大規模な噴火が繰り返したために山の生態系が破壊され、また独立峰であるため、他の山系からの植物の進入も遅れたためである。しかし、宝永山周辺ではいくらか高山植物が見られる。山の上部ではタデ科オンタデ属のオンタデ（御蓼）、山腹ではキク科アザミ属のフジアザミ（富士薊）が自生している『日本の高山植物（山渓カラー名鑑）』山と渓谷社、1988年、、pp. 107, 502。中部山岳地帯の高山の森林限界の上にはハイマツ帯が広がっているのが通例であるが、富士山にはハイマツ帯は欠如し、その代替にカラマツ林が広がっている。
気候 ケッペンの気候区分では、富士山はツンドラ気候（ET）に属する。
年平均気温は-5.9℃である。平年値では猛暑日が0.0日、真夏日が0.0日、夏日が0.0日、熱帯夜が0.0日、真冬日が209.1日、冬日が273.1日となっている富士山（平年値）。また、10月から5月にかけて日平均気温が氷点下となっている。
気象庁により気象観測が行われている日本の観測所気象庁（地点の選択）としては、最も平年値の気温が低く、日本最寒の観測所となっている。
冬季は、近年でも-35℃を下回る気温が観測され、2023年1月25日に-36.1℃を観測している富士山（年ごとの値）。
極値富士山（観測史上1～10位の値）観測値観測年月日日最高気温17.8℃1942年8月13日日最低気温-38.0℃1981年2月27日
人間との関わりの歴史 thumb|right|富士山本宮浅間大社
古代