第97回東京箱根間往復大学駅伝競走（だい97かいとうきょうはこねかんおうふくだいがくえきでんきょうそう）は、2021年（令和3年）1月2日から1月3日まで開催された97回目の東京箱根間往復大学駅伝競走（箱根駅伝）である。
今大会の特徴 新型コロナウイルスによる影響 新型コロナウイルス (COVID-19) の感染拡大により2020年出雲駅伝中止などの影響が出ていたが、関東学連は11月5日、日本陸連の指針に従って参加者の健康チェックなどの感染対策を行った上で、予定通りの開催を決定。但し、感染拡大状況の更なる悪化や、2020年4月から5月にかけて日本国政府から発令された改正・新型インフルエンザ等対策特別措置法32条1項に基づく緊急事態宣言が再発令された場合は、大会を中止する可能性がある事を示唆していた箱根駅伝は予定通り開催 応援自粛を要請、中止の可能性も - 日本経済新聞 2020年11月5日。
また関東学連は12月1日、感染拡大防止の為、沿道での応援の自粛を呼びかける声明を発表箱根駅伝の応援に関するお願い - 箱根駅伝公式サイト 2020年12月1日。そのため、「応援したいから、応援にいかない。」のキャッチコピーも用いられた。これに伴い、スタート・フィニッシュ地点及び各中継所での各種イベントは中止。1月2日芦ノ湖と1月3日大手町での号外配布と読売新聞東京本社・報知新聞社による小旗配布も中止された。
スポンサーロゴの掲載解禁 2020年に世界陸連の広告規定が変更されたことに伴って日本陸連が制定したルールに則り、今大会から選手のユニフォーム（シャツ・パンツ）にスポンサーロゴの掲載が認められるようになった（面積40 cm2以内、かつ幅5 cm以内）。今大会では関東学生連合を除く参加20校中13校のユニフォームにスポンサーロゴが掲載された。
以下は今大会でスポンサーロゴの提供を受けた大学とスポンサー先の一覧である。順位は今大会の総合順位を反映。
駒澤大学：日能研 創価大学：創友会大学の卒業生組織（同窓会）。 東洋大学：健康ミネラルむぎ茶（伊藤園） 青山学院大学：妙高市 東海大学：山王総合設備管理業。 早稲田大学：提供なし 順天堂大学：提供なし 帝京大学：提供なし 國學院大学：ASAGAMI（アサガミ）総合物流サービス業。 東京国際大学：提供なし 明治大学：サトウのごはん（サトウ食品） 中央大学：提供なし 神奈川大学：提供なし 日本体育大学：提供なし 拓殖大学：陸上部支援会・学友会後援会 城西大学：新田ゼラチン 法政大学：YUSEI（郵生）ビルメンテナンス業。 国士舘大学：SUZUKI 山梨学院大学：山梨中央銀行 専修大学：アマタケ食品製造業。 関東学生連合：提供なし
実施日程 往路：2021年1月2日 8:00スタート 大手町（スタート） - 鶴見 - 戸塚 - 平塚 - 小田原 - 箱根町芦ノ湖駐車場入口（ゴール） 復路：2021年1月3日 8:00スタート 箱根町芦ノ湖駐車場入口（スタート） - 小田原 - 平塚 - 戸塚 - 鶴見 - 大手町（ゴール)
区間 総距離 217.1 km中継所中継所繰り上げ時間往路(107.5 km) （スタート）大手町・読売新聞ビル前大手町 8時00分 往路スタート第1区大手町 - 鶴見 21.3 km -鶴見中継所先頭通過から10分後第2区鶴見 - 戸塚 23.1 km戸塚中継所先頭通過から10分後第3区戸塚 - 平塚 21.4 km平塚中継所先頭通過から15分後第4区平塚 - 小田原 20.9 km小田原中継所先頭通過から15分後第5区小田原 - 箱根町 20.8 km -（往路ゴール／復路スタート）箱根町・芦ノ湖駐車場入口箱根町 8時00分 復路スタート復路 (109.6 km)第6区箱根町 - 小田原 20.8 km -小田原中継所先頭通過から20分後第7区小田原 - 平塚 21.3 km平塚中継所先頭通過から20分後第8区平塚 - 戸塚 21.4 km戸塚中継所先頭通過から20分後第9区戸塚 - 鶴見 23.1 km鶴見中継所先頭通過から20分後第10区鶴見 大手町 23.0 km - 大手町（ゴール）
給水地点往路復路 1区 (給水なし) 2区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近) 3区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近) 4区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近) 5区 - 2ヶ所 (7.1km地点、15.8km地点) 6区 (給水なし) 7区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近) 8区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近) 9区 - 2ヶ所 (10km付近、14.4km付近) 10区 - 2ヶ所 (10km付近、15km付近)
参加大学 第96回大会の上位10校（シード校）と予選会通過校10校、これにオープン参加の関東学生連合チームを合わせた全21チームが参加。前回出場校では、前回まで18年連続で出場していた中央学院大学の他、筑波大学と日本大学が予選会で敗退となった。城西大学と山梨学院大学が2年ぶりに、専修大学が7年ぶりに出場権を獲得した。
シード校（10校）No.大学名前回順位出場回数(シード権)1青山学院大学 前年1位13年連続 26回目 (11年連続)2東海大学前年2位8年連続 48回目 (6年連続)3國學院大學前年3位5年連続 14回目 (2年連続)4帝京大学前年4位14年連続 22回目 (3年連続)5東京国際大学前年5位4年連続 5回目 （初）6明治大学前年6位3年連続 62回目 (5年ぶり)7早稲田大学前年7位45年連続 90回目 (2年ぶり)8駒澤大学前年8位55年連続 55回目 (2年連続)9創価大学前年9位2年連続 4回目 （初）10東洋大学前年10位19年連続 79回目 (15年連続)予選会通過校（10校）No.大学名前回順位出場回数予選成績11順天堂大学前年14位10年連続 62回目 予選1位12中央大学前年12位4年連続 94回目 予選2位13城西大学第95回 20位2年ぶり 16回目 予選3位14神奈川大学前年16位11年連続 52回目 予選4位15国士舘大学前年19位5年連続 49回目 予選5位16日本体育大学前年17位73年連続 73回目 予選6位17山梨学院大学第95回 21位2年ぶり 34回目 予選7位18法政大学前年15位6年連続 81回目 予選8位19拓殖大学前年13位8年連続 42回目 予選9位20専修大学第90回 21位7年ぶり 69回目 予選10位連合チーム21関東学生連合オープン参加(前年19位相当) ※ナンバーカードの数字はNo.1 - No.10が前年順位、No.11 - No.20は予選会順位の順。
出場選手 区間エントリー選手No. / 大学名区間エントリー選手（No. / 選手名,学年,年齢）1青山学院大学 往路1区1𠮷田 圭太2区2中村 唯翔3区15湯原 慶吾4区16佐藤 一世5区5竹石 尚人復路6区6髙橋 勇輝7区7近藤 幸太郎8区8岩見 秀哉9区14飯田 貴之10区10中倉 啓敦補欠・交代選手11神林 勇太12新号 健志13松葉 慶太9横田 俊吾3大澤 佑介4脇田 幸太朗 2東海大学 往路1区11塩澤 稀夕2区2名取 燎太3区15石原 翔太郎4区4佐伯 陽生5区5西田 壮志復路6区6川上 勇士7区12本間 敬大8区14濵地 進之介9区9長田 駿佑10区13竹村 拓真補欠・交代選手1市村 朋樹7佐藤 俊輔10米田 智哉8中嶋 貴哉3田中 康靖16吉井 来斗 3國學院大学 往路1区15藤木 宏太2区2中西 大翔3区11臼井 健太4区12河東 寛大5区5殿地 琢朗復路6区6島﨑 慎愛7区13徳備 大輔8区8伊地知 賢造9区9高嶌 凌也10区14木付 琳補欠・交代選手3石川 航平4藤村 遼河7田川 良昌10木下 巧1門田 秀利16中西 唯翔 4帝京大学 往路1区1小野寺 悠2区2星 岳3区3遠藤 大地4区12中村 風馬5区5細谷 翔馬復路6区6三原 魁人7区7寺嶌 渓一8区8鳥飼 悠生9区9橋本 尚斗10区11山根 昂希補欠・交代選手10増田 空4新井 大貴13森田 瑛介14北野 開平15山田 一輝16小野 隆一朗 5東京国際大学 往路1区15丹所 健2区14イェゴン・ヴィンセント3区3内田 光4区4宗像 聖5区5荒井 雄哉復路6区13芳賀 宏太郎7区11佐伯 涼8区8熊谷 真澄9区9加藤 純平10区12杉崎 翼補欠・交代選手7善田 修平10川畑 昇大6林 優策2ルカ・ムセンビ1三浦 瞭太郎16村松 敬哲 6明治大学 往路1区1児玉 真輝2区2加藤 大誠3区11小袖 英人4区16櫛田 佳希5区12鈴木 聖人復路6区6前田 舜平7区13手嶋 杏丞8区8大保 海士9区14富田 峻平10区10長倉 奨美補欠・交代選手3村上 純大5樋口 大介7丸山 幸輝9小澤 大輝15漆畑 瑠人4金橋 佳佑 7早稲田大学 往路1区15井川 龍人2区2太田 直希3区13中谷 雄飛4区4鈴木 創士5区5諸冨 湧復路6区6北村 光7区11宍倉 健浩8区8千明 龍之佑9区16小指 卓也10区14山口 賢助補欠・交代選手7半澤 黎斗12吉田 匠3菖蒲 敦司10室伏 祐吾1辻 文哉9向井 悠介 8駒澤大学 往路1区15白鳥 哲汰2区2田澤 廉3区11小林 歩4区4酒井 亮太5区16鈴木 芽吹復路6区6花崎 悠紀7区7花尾 恭輔8区13佃 康平9区9山野 力10区12石川 拓慎補欠・交代選手3青柿 響10神戸 駿介8伊東 颯汰14唐澤 拓海1加藤 淳5円 健介 9創価大学 往路1区1福田 悠一2区2フィリップ・ムルワ3区15葛西 潤4区12嶋津 雄大5区13三上 雄太復路6区16濱野 将基7区11原富 慶季8区8永井 大育9区9石津 佳晃10区10小野寺 勇樹補欠・交代選手7横山 魁哉4吉田 悠良5森下 治14緒方 貴典3山森 龍暁6鈴木 渓太10東洋大学 往路1区1児玉 悠輔2区2松山 和希3区15前田 義弘4区4𠮷川 洋次5区5宮下 隼人復路6区6九嶋 恵舜7区12西山 和弥8区13野口 英希9区9小田 太賀10区10清野 太雅補欠・交代選手11大澤 駿7蝦夷森 章太8腰塚 遥人14久保田 悠月3村上 太一16佐藤 真優11順天堂大学 往路1区1三浦 龍司2区2野村 優作3区3伊豫田 達弥4区16石井 一希5区5津田 将希復路6区11清水 颯大7区7小島 優作8区15西澤 侑真9区9鈴木 尚輝10区12原田 宗広補欠・交代選手6矢野 直幹10吉岡 智輝13真砂 春希14牧瀬 圭斗8近藤 亮太4人見 隆之12中央大学 往路1区14千守 倫央2区2森 凪也3区16吉居 大和4区12三須 健乃介5区5畝 拓夢復路6区6若林 陽大7区7中澤 雄大8区13三浦 拓朗9区9手島 駿10区11川崎 新太郎補欠・交代選手10加井 虎造4池田 勘汰8園木 大斗1助川 拓海15伊東 大翔3井上 大輝13城西大学 往路1区1砂岡 拓磨2区2菊地 駿弥3区13菅原 伊織4区11梶川 由稀5区5山本 唯翔復路6区6野村 颯斗7区7藤井 正斗8区16新井 颯人9区15宮下 璃久10区14雲井 崚太補欠・交代選手4熊谷 奨12貴田 勇斗3堀越 大地10山本 樹9山中 秀真8小島 拓14神奈川大学 往路1区1呑村 大樹2区11井手 孝一3区3川口 慧4区12西方 大珠5区5北﨑 拓矢復路6区6宇津野 篤7区7落合 葵斗8区13安田 響9区16高橋 銀河10区15佐々木 亮輔補欠・交代選手2小林 篤貴4鈴木 玲央8小林 政澄14横澤 清己10巻田 理空9菊池 夏規15国士舘大学 往路1区1山本 龍神2区2ライモイ・ヴィンセント3区15清水 拓斗4区14木榑 杏祐5区5孝田 拓海復路6区12曽根 雅文7区13荻原 陸斗8区8清水 悠雅9区9三代 和弥10区16綱島 辰弥補欠・交代選手11杉本 日向6鈴木 大介7中西 真大4島村 広大3長谷川 潤10加藤 直人16日本体育大学 往路1区1藤本 珠輝2区2池田 耀平3区3岩室 天輝4区12福住 賢翔5区5村越 凌太復路6区6菅沼 隆佑7区13森下 滉太8区14大内 宏樹9区9野上 翔大10区10名村 樹哉補欠・交代選手11大内 一輝4岡嶋 翼7亀田 優太朗8嶋野 太海15佐藤 慎巴16盛本 聖也17山梨学院大学 往路1区1新本 駿2区2森山 真伍3区3島津 裕太4区12ポール・オニエゴ5区5星野 一平復路6区12日影 優哉7区7木山 達哉8区8篠原 楓9区9遠藤 悠紀10区10渡邊 晶紀補欠・交代選手11荒井 祐人4瀬戸 祐希13坪井 海門6矢島 洸一15松倉 唯斗16伊東 大暉18法政大学 往路1区11鎌田 航生2区2河田 太一平3区3松本 康汰4区13清家 陸5区5古海 航復路6区6須藤 拓海7区7田辺 佑典8区8糟谷 勇輝9区14川上 有生10区15中園 慎太朗補欠・交代選手1宗像 直輝12久納 碧4徳永 裕樹9中光 捷10奥山 智広16稲毛 崇斗19拓殖大学 往路1区1合田 椋2区16ジョセフ・ラジニ3区3新井 遼平4区4佐藤 広夢5区11石川 佳樹復路6区14佐々木 虎太郎7区15吉村 陸8区8江口 清洋9区9竹蓋 草太10区13工藤 翼補欠・交代選手5山﨑 晃志郎12青柳 拓郎10関根 大地6兒玉 陸斗7桐山 剛2吉原 遼太郎20専修大学 往路1区1高瀬 桂2区11茅野 雅博3区13金久保 遥4区4国増 治貴5区5野下 稜平復路6区6南 里樹7区7成島 航己8区16水谷 勇登9区9辻 海里10区15服部 友太補欠・交代選手2木村 暁仁12大石 亮3栗江 倫太郎14佐々木 詩音10南 美空翔8吉岡 拓哉21関東学生連合 往路1区1難波 天2区2河村 悠3区3小島 慎也4区16中山 凜斗5区5杉浦 慧復路6区6大川 歩夢7区7小坂 友我8区8高槻 芳照9区14町田 康誠10区10松川 雅虎補欠・交代選手11梶山 拓郎12前山 晃太郎13厚浦 大地9新田 颯15菊地 駿介4村上 航大 色付きは当日メンバー変更を表す。（／） 名前末尾の(括弧内の数字)は学年と年齢を表す。 外国籍の選手は名前(英字表記)の後に国籍を記載。 は駅伝主将、は副主将を表す。
概要
出雲駅伝が開催中止となった中、前回優勝の青学大に、全日本大学駅伝で6年ぶりに優勝した駒大、前回2位・全日本でも2位となった東海大、青学大を抑えて全日本3位に入った明大の4校が優勝候補に挙げられた。しかし、青学大はエースの岸本大紀が故障の影響でエントリーできなかった他、前回9区区間賞の主将・神林勇太も大会直前に疲労骨折が判明し、区間エントリーから外れるなど苦しい展開となった。
往路 1区 エントリー変更は東海大・國學院大・東国大・早大・駒大・中大・法大の7チーム。
最初の1kmは3分33秒と近年稀に見るスローペースで幕を開け、東海大・塩澤稀夕や國學院大・藤木宏太が仕掛け一旦ペースが上がったものの、再び3分を超えるペースに戻る。
14km過ぎで山梨学大のルーキー・新本駿と国士大のルーキー・山本龍神が、15km手前で専大・高瀬桂が集団から遅れ始める。ペースの上げ下げが激しく、六郷橋で集団がばらけ始め、最後は塩澤と法大・鎌田航生が競り合い、鎌田が残り1kmでスパートを掛けて塩澤を引き離し、そのままトップで襷リレー。法大は第76回大会の徳本一善以来となる1区区間賞を獲得した。塩澤は5秒差の2位、15秒差の3位で創価大・福田悠一、連覇を狙う青学大・𠮷田圭太は18秒差の6位、東洋大・児玉悠輔は24秒差の9位、3000m障害日本人学生歴代1位の記録を持つ順大のスーパールーキー・三浦龍司は31秒差の10位、前回大会区間2位だった藤木は32秒差の12位、優勝候補である駒大のルーキー・白鳥哲汰は47秒差の15位、明大のルーキー・児玉真輝は1分06秒差の16位で襷リレー。
最下位の山梨学大までは2分06秒差とここ10年としては最も少ないタイム差となった。
2区 エントリー変更は神奈川大・拓大・東国大・専大の4チーム。
東海大・名取燎太が1.4kmで法大・河田太一平を抜いてトップに立つが、トップと47秒差の14位で襷を受けた東国大のイェゴン・ヴィンセントと3位集団から抜け出した創価大のフィリップ・ムルワが猛追し、9.5km付近で名取をかわしてトップに浮上。次第にムルワを引き離したヴィンセントは区間2位となった国士大のライモイ・ヴィンセントに1分以上の差をつけ、1時間05分49秒で前回大会で東洋大・相澤晃が記録した区間記録を8秒更新する走りを見せ、大学史上初めて戸塚中継所をトップで襷リレー。
2位争いは、ムルワが追い上げる名取と日体大・池田耀平を振り切りトップと59秒差で襷リレー。東海大・日体大と続き東洋大のルーキー・松山和希が区間4位の走りで5位に。拓大のジョセフ・ラジニ前回は「ラジニ・レメティキ」の名前でエントリーしていたが、今回から「ジョセフ・ラジニ」にエントリー名を変更している。が順位を5つ上げ6位に。1区15位と出遅れた駒大は、田澤廉が7つ順位を上げ8位に浮上。一方、青学大・中村唯翔は4位集団の中で走っていたものの、保土ヶ谷付近で集団から遅れ、トップ東国大と2分13秒差の13位に。田澤・池田と同じく1万m27分台を持つ早大・太田直希も区間13位と振るわずトップ東国大と2分差の10位に転落。トップで襷リレーした河田は序盤からペースが上がらず最後はフラフラの状態になり、区間19位と大ブレーキ。16位まで順位を落とした。
3区 エントリー変更は創価大・東海大・東洋大・駒大・城西大・早大・国士舘大・青学大・國學院大・明大・中大・専大の12チーム。
東海大のルーキー・石原翔太郎がスタートから突っ込んでいく走りを見せ、11.5km付近でトップの東国大・内田光を抜き去り区間賞の走りで第83回大会以来14年振りに平塚中継所をトップで襷リレー。34秒差の2位に、区間3位の走りをした創価大・葛西潤、56秒差の3位に区間2位の走りをした駒大・小林歩、内田は区間9位に終わり東国大はトップ東海大と1分差の4位に後退した。
前年従来の区間記録を更新した帝京大・遠藤大地が区間4位と貫禄を見せ8人抜いて6位に浮上。一方、青学大は順位こそ11位に上げたものの、2区の中村に続いて湯原慶吾が区間14位と振るわずトップ東海大と3分55秒差、10位日体大とは1分19秒差となり総合連覇に黄色信号が灯った。この区間で唯一1万m27分台を持つ早大・中谷雄飛が区間6位と本来の走りができず順位を2つしか上げられず、5000mU20日本記録保持者である中大のルーキー・吉居大和も区間15位に終わり、18位から順位を上げられなかった。
4区 エントリー変更は創価大・帝京大・順大・神奈川大・日体大・青学大・國學院大・城西大・国士舘大・法大・明大・中大・山梨学大・関東学生連合の14チーム。
前回10区で区間新記録を出した創価大・嶋津雄大が5.6km付近で東海大のルーキー・佐伯陽生をかわすと、その後はトップを快走。最後は腿を攣りながらも区間2位の走りで2位・駒大に1分42秒の差をつけ大学史上初めて小田原中継所をトップで襷リレー。区間3位の走りをした早大・鈴木創士が2分03秒差の3位に入り、そこから40秒以内に東国大・東洋大・東海大・順大・帝京大が続々襷リレーをし、トップ創価大から3分以内に8校がひしめく接戦となった。トップで襷を受けた佐伯は嶋津に抜かれた後から失速し区間19位に沈み、6位まで順位を落とした。
シード権争いでは青学大のルーキー・佐藤一世が区間4位の走りで10位に浮上、11位日体大とは1分以上の差を付けた。小田原中継所では9位神奈川大・西方大珠が襷リレーの際中継所手前で転倒するアクシデントがあったが、無事にタスキを繋いだ。
専大は国増治貴が区間最下位と失速するが、繰り上げまであと22秒というところで辛くも襷リレーした。
因みに、区間賞は19位を走る山梨学大のポール・オニエゴが獲得したが、下位から順位を上げずに区間賞を獲得したのは第84回大会4区の国士大・阿宗高広以来の珍事となったただし、オープン参加の関東学生連合の中山凛斗を序盤で抜いている。。
5区 エントリー変更は創価大・駒大・拓大・明大の4チーム。
『仮想5区』ともいえる激坂最速王決定戦で優勝した創価大・三上雄太が区間2位と実績を裏切らない好走を見せて逃げ切り、出場4回目にして初の往路優勝を果たした。なお、創価大は区間賞無しでの往路優勝であり、この記録は第78回大会の神奈川大以来となる。
前回区間新記録を打ち立てた東洋大・宮下隼人は区間3位ながらも2分14秒差の2位、駒大のルーキー・鈴木芽吹は宮下に終盤まで喰らい付き、区間4位の走りで2分21秒差の3位、帝京大・細谷翔馬は大学史上初めてとなる5区区間賞を獲得する走りを見せ、2分31秒差の4位。王座奪還を目指す東海大・西田壮志は今年も区間7位に甘んじ、3分27秒差の5位。以下、東国大・順大・神奈川大・國學院大・拓大の順でゴール。一方3位で襷を受けた早大のルーキー・諸冨湧が区間19位とブレーキしシード圏外の11位に、留年して5区に出走した青学大・竹石尚人も足の痙攣で数回立ち止まるなどペースが上がらず区間17位のブレーキで青学大は7分35秒差の12位と、第87回大会以来10年ぶりに往路2桁順位に。明大も1区の遅れを取り戻せず7分55秒差の14位に終わり、共に優勝は絶望的になった。
シード権争いは7位順大から15位日体大まで3分07秒、10位拓大から17位国士大まで2分47秒と、一つのミスも許されない混戦となった。
また下位チームの健闘もあったため、復路での一斉スタートは、中大・山梨学大・学生連合・専大の4チームのみにとどまった。
向かい風が吹いていた影響で、学生連合・専大以外のチームが5時間40分を切った一方、5時間30分を切ったのは往路優勝した創価大だけであった（前回大会は12位の中央学院大学までが5時間30分を切っていた）。
復路 6区 エントリー変更は創価大・東国大・順大・拓大・国士舘大・山梨学大の6チーム。
トップでスタートした創価大・濱野将基は、区間7位の安定した走りで小田原中継所をトップで襷リレーするが、創価大と2分21秒差の3位でスタートした駒大の3年生・花崎悠紀が6区歴代3位の57分36秒で区間賞を獲得し2位に浮上。創価大との差を1分08秒まで縮める。一方、2位でスタートした東洋大・九嶋恵舜は区間14位と振るわず4位まで後退する。
シード権争いは、12位でスタートした青学大・髙橋勇輝が区間3位の好走でシード圏内の10位に浮上した一方、10位でスタートした拓大・佐々木虎太郎が区間18位のブレーキで14位に後退。また、4位でスタートした帝京大・三原魁人はレース序盤に右足甲を骨折した影響で区間最下位に沈み、11位早大と17秒差の9位まで転落する。
7区 エントリー変更は創価大・東海大・東洋大・東国大・國學院大・早大・明大・拓大・国士舘大・日体大の10チーム。
創価大・原富慶季が区間2位の好走で、2位駒大・花尾恭輔との差を1分51秒に広げる。
3位争いは600m付近で東海大・本間敬大に東洋大・西山和弥が追い付き並走となるが、9.2km付近で本間が西山を突き放し、東洋大に46秒差をつけて3位で襷リレー。しかし、トップ創価大とは4分26秒差に広がり、東洋大も創価大とは5分12秒の大差がついた。7位で襷を受けた東国大・佐伯涼が原富の記録を2秒抑えて区間賞を獲得し、5位に浮上した。
シード権争いは、青学大・近藤幸太郎が佐伯と4秒差の区間3位の力走で7位にジャンプアップ。一方、6位で襷を受けた神奈川大・落合葵斗は区間17位のブレーキでシード圏外の11位に転落し、早大・宍倉健浩が区間8位の走りで神奈川大と24秒差の10位に浮上した。
8区 エントリー変更は駒大・東海大・東洋大・順大・神奈川大・城西大・日体大・中大・専大の9チーム。
創価大・永井大育がトップを守るも、駒大・佃康平が区間4位の走りでその差は1分29秒まで縮まった。一方、東洋大・野口英希は区間2位の好走で3位に浮上し、青学大・岩見秀哉も区間3位の走りで5位に浮上した。3位で襷を受けた東海大・濵地進之介は区間15位と振るわず4位に後退。
シード権争いはさらに熾烈になり、明大・大保海士が、区間記録まであと10秒に迫る1時間03分59秒のタイムで区間賞を獲得し12位に浮上、同タイムの9位で襷リレーした早大・帝京大との差を1分08秒まで縮める。
前回に続き、戸塚での繰り上げはなかった。
9区 エントリー変更は青学大・早大・神奈川大・明大・城西大・法大・関東学生連合の7チーム。
前回9区区間6位の成績を収めている創価大・石津佳晃が、区間記録まであと13秒に迫る歴代4位のタイムで快走し、鶴見中継所をトップで襷リレー。石津は自身初の区間賞獲得となった。駒大・山野力は区間6位に留まり、創価大との差は3分19秒に大きく広がった。
中位争いでは、青学大・飯田貴之が区間2位の好走。東海大・長田駿佑をかわし4位に浮上した｡
シード権争いは、権太坂で國學院大・早大・帝京大の8位集団が形成された後、國學院大・高嶌凌也が脱落。高嶌は18km過ぎで11位明大・富田峻平に一度は追いつかれるが、20km手前で高嶌が富田を突き放し、前を行く東国大・加藤純平を捉え9位で襷リレー。10位東国大と11位明大の差は僅か38秒。8位順大まで広げても2分以内の差で最終10区を迎えることになった。11位で襷を受けた神奈川大・高橋銀河は区間最下位に沈み、15位まで転落。10位東国大とは4分以上の差がつきシード権争いから脱落した。
鶴見中継所では、山梨学大・専大が繰り上げスタートとなった。山梨学大は予選落ちとなった前回を挟み4回連続で鶴見繰り上げとなった。
10区 エントリー変更は駒大・東海大・帝京大・早大・順大・國學院大・東国大・中大・城西大・神奈川大・拓大・法大・国士舘大・専大の14チーム。
創価大・小野寺勇樹は大量リードで無理をする必要はなく遅めのペースで走り始めるが、次第に体が重くなり、「ペースを落とさないように踏ん張ろうとしても力が入らない。どうしたら良いのか分からなくなり、頭の中は『やばい、やばい』とパニック状態だった」『箱根逆転負けのランナー 創価大陸上競技部駅伝部』毎日新聞2021年12月19日付19面記事と失速。駒大・石川拓慎がハイペースで猛追し、13km過ぎの新八ツ山橋で1分57秒差、田町の16.5km地点では1分17秒差、御成門の18.1km地点では47秒差と距離が進むにつれ一気に差が縮まった。そして、20.9km過ぎで石川が小野寺を一気に抜き去り、52秒の差を付けて駒大が第84回大会以来13年ぶり7回目の総合優勝を果たした。また、石川は区間賞を獲得した。なお、10区での逆転優勝は第77回大会の順大以来20年ぶり、往路3位からの逆転優勝は第63回大会の順大以来34年ぶり（往路3位以下とした場合は第82回大会の亜大以来15年ぶり）、全中継所1位通過無しでの総合優勝は第62回大会の順大以来35年ぶりの記録となった。
駒大に抜かれた時に反応できず、ふらつきながらゴールし担架で運ばれた小野寺だったが、創価大は第96回大会に続いて大学史上最高成績を大幅に更新して総合2位となった。東洋大は清野太雅が一時、青学大・中倉啓敦に逆転されるが、残り2km地点で清野が再逆転し、3位で2年ぶりのベスト3入り。往路12位と出遅れた青学大は、区間賞こそなかったものの、2年ぶり6回目の復路優勝で総合4位まで盛り返した。往路・復路・総合の優勝校が全て違う大学となったのは第95回大会（総合・東海大、往路・東洋大、復路・青学大）以来2年ぶり9例目である。王座奪還を狙った東海大は復路10位と伸びず、総合5位に終わった。早大・順大・帝京大の6位争いはスパート勝負になり、早大・山口賢助が抜け出し6位に、その4秒後の7位に順大、9秒後の8位に帝京大が続いた。早大は2年連続のシード、順大は2年振りのシード、帝京大は4年連続のシード獲得となった。予選会1位の順大は7位で、予選会からの出場校では唯一シードを獲得した。國學院大は木付琳が区間3位の走りで9位でゴールし3年連続でシードを獲得した。帝京大・國學院大は大学内の連続シード獲得記録を更新した。