Nato a Aultgowrie (vicino a Inverness) in una famiglia povera nella contea di Ross, studiò filosofia all'università di Edimburgo ed ottenne il PhD in archeologia classica a Vienna. Operò nel Mediterraneo occidentale a cavallo tra l´Ottocento e il Novecento, conducendo varie indagini, tra cui quelle di Phylakopi a Milo e Cnosso a Creta. Condusse quattro campagne di scavo in Sardegna, tra il 1906 e il 1909, interessandosi ai suoi aspetti preistorici.
Inoltre aveva scritto sui nuraghi: Voes (Nule), S'Aspru (Benetutti), Arule (Nule), Aiga (Abbasanta), Ludosu (Bultei).
Di Tombe dei giaganti: Imbertighe (Borore), Goronna (Paulilatino), S'Altare de Logula (Sarule), Castigadu s'altare (Macomer- Borore), Tomba dei giganti di Sas Presones (Bultei), S'ena de sa Vacca (Olzai) e di dolmen: Dolmen di Sa Coveccada (Mores), Monte Maone (Benetutti), Tanca sas Bogadas (Birori), Dolmen Su Coveccu (Bultei).
Opere Cretan Palaces and the Aegean Civilization, in The Annual of the British School at Athens Vol. 11 (1904/1905), pp. 181-223, British School at Athens, 1905 The dolmens, Tomb of the Giants, and Nuraghi of Sardinia (I dolmen, le tombe di giganti e i nuraghi della Sardegna), in West European Relations, 1907, ristampato in Mem. Mon., vol. II, fasc.3, 1-31, 1908 Dolmens, Tombs of the Giants and the Nuraghi of Sardinia, Papers of the British School at Rome, vol. V, 2, London, 1910 Dolmens and Nuraghi of Sardinia (I dolmen e i nuraghi della Sardegna), P.B.S.R., vol. VI, London, 1913
Bibliografia Nicoletta Momigliano: Duncan Mackenzie: A Cautious Canny Highlander, In: Bulletin of the Institute of Classical Studies. Band 40, Supplement 63, 1995, S. 163–168, doi:10.1111/j.2041-5370.1995.tb02106.x N. Momigliano: Duncan Mackenzie and the Palestine Exploration Fund. In: Palestine Exploration Quarterly. Band 128, 1996, S. 139–170, doi:10.1179/peq.1996.128.2.139 N. Momigliano: Duncan Mackenzie. A cautious canny highlander & the palace of Minos at Knossos. Institute of Classical Studies, School of Advanced Study, University of London, London 1999, ISBN 0-900587-83-0 Giacobbe Manca, Archeologia di Sardegna. L’isola Selvaggia e Duncan Mackenzie, Dolianova, Editore GRAFICA DEL PARTEOLLA, 2023 ISBN 9788867912964
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