Il Lima Challenger 1999 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 1999. Il torneo si è giocato a Lima in Perù dal 18 al 24 ottobre 1999 su campi in terra rossa.
Vincitori Singolare
Juan Ignacio Chela ha battuto in finale Jiří Vaněk con il punteggio di 6–2, 7–5.
Doppio
Pablo Albano / Martín García hanno battuto in finale Mariano Hood / Sebastián Prieto con il punteggio di 7–6, 3–6, 6–3.
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