Insegnante a Monaco di Baviera, fu studioso di Protozoi, che riconobbe come unicellulari, e Artropodi.
Fu inoltre il primo a capire che l'uovo è la più grande cellula esistente. Nel 1883 divenne Socio Straniero dei Lincei.
Opere Karl Theodor Ernst von Siebold: Observationes de Salamandris et Tritonibus. 1828. Karl Theodor Ernst von Siebold: Beiträge zur Naturgeschichte der Wirbellosen Thiere. Danzig 1839. Karl Theodor Ernst von Siebold: Ueber die Band-und Blasenwürmer. 1854 Karl Theodor Ernst von Siebold: Wahre Parthenogenesis bei Schmetterlingen und Bienen. 1856. Karl Theodor Ernst von Siebold: Die Süsswasserfische Mitteleuropas. Leipzig 1863. Karl Theodor Ernst von Siebold: Beiträge zur Parthenogenesis der Arthropoden. 1871. Karl Theodor Ernst von Siebold, Hermann Stannius: Lehrbuch der vergleichenden Anatomie der Wirbellossen Thiere. Berlin 1845.
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