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Gli episodi speciali della seconda serie di Doctor Who (2005-2022) vengono prodotti, sin dal 2005, al fine di riempire il vuoto tra una stagione e quella successiva. Si tratta di episodi della normale durata di una puntata (circa 60 minuti) o mini-episodi pubblicati solitamente sul web.
In Italia vengono trasmessi unicamente gli episodi speciali dalla durata di 60 minuti. Jimmy ha trasmesso gli speciali dal 24 dicembre 2006 al 12 ottobre 2008, interrompendosi con Il viaggio dei dannati; in chiaro sono stati trasmessi dal 29 gennaio 2011 al 24 febbraio 2019 su Rai 4. Lo speciale natalizio del 2015 I mariti di River Song è stato per la prima volta pubblicato su Netflix prima del passaggio televisivo, il 15 aprile 2016. Dal 2023 vengono pubblicati su Disney+ come nel resto del mondo in contemporanea con il Regno Unito, saltando però quattro episodi speciali trasmessi nel frattempo.
Episodi di 60 minuti Gli episodi speciali di 60 minuti vengono trasmessi durante alcune festività o in occasione di ricorrenze particolari su BBC One: Il 25 dicembre di ogni anno viene trasmesso un episodio speciale a tema natalizio: L'invasione di Natale, La sposa perfetta, Il viaggio dei dannati, Un altro Dottore, La fine del tempo (prima parte), Un canto di Natale, Il Dottore, la vedova e l'armadio, I pupazzi di neve, Il tempo del Dottore, L'ultimo Natale, I mariti di River Song, Il ritorno del dottor Mysterio, C'era due volte e The Church on Ruby Road. Tra il 2008 e il 2010 sono stati trasmessi cinque episodi speciali, che narrano l'uscita di scena del Decimo Dottore, collocandosi tra la quarta e la quinta stagione della nuova serie: Un altro DottoreChe rientra anche nella categoria degli episodi natalizi., Il pianeta dei morti, L'acqua di Marte, La fine del tempo (prima parte) e La fine del tempo (seconda parte). Il giorno del Dottore, episodio speciale per i 50 anni dalla nascita della serie, è stato trasmesso in contemporanea il 23 novembre 2013 in 94 paesi nel mondo, in televisione e nei cinema, entrando nel Guinness dei primati. Il 1º gennaio 2019, 2021 e 2022 è stato trasmesso un episodio speciale di capodanno: Propositi, Revolution of Daleks e Eve of Daleks. Nel 2022 sono stati trasmessi tre episodi speciali, che narrano l'uscita di scena del Tredicesimo Dottore: Eve of DaleksChe rientra anche nella categoria degli episodi di Capodanno, Legend of the Sea Devils e The Power of the Doctor. Quest'ultimo celebra anche il centesimo anniversario della BBC.
Mini-episodi I mini-episodi, dalla durata di pochi minuti, vengono presentati solitamente come prologhi agli episodi della serie e pubblicati sul web o, comunque, al di fuori della normale programmazione televisiva: Per la serata di beneficenza Children in Need, in onda ogni anno sulla BBC, sono stati prodotti i mini-episodi Born Again (2005), Time Crash (2007), The Great Detective e Vastra Investigates (2012). Per l'edizione del 2011 è stato invece mandato in onda uno sketch in cui Matt Smith (nei panni del Dottore) parla rivolto alla telecamera. I mini-episodi Space e Time sono stati invece presentati alla serata di beneficenza Comic Relief del 2011. Nei cofanetti DVD della quinta, sesta e settima stagione sono invece contenuti gli episodi Meanwhile in the TARDIS, Night and the Doctor, The Inforarium, P.S., Rain Gods e Clara and the TARDIS. Durante la seconda, sesta, settima e nona stagione sono stati pubblicati su vari siti web numerosi mini-episodi, che facevano da prologo ad alcuni episodi della stagione: la serie dei Tardisodes per la seconda stagione, The Impossible Astronaut prequel, The Curse of the Black Spot, A Good Man Goes to War prequel, Let's Kill Hitler prequel e The Wedding of River Song prequel per la sesta stagione, Asylum of the Daleks Prequel, The Making of the Gunslinger, The Bells of Saint John - A Prequel, She Said, He Said e Clarence and the Whispermen per la settima stagione, Prologue e The Doctor's Meditation per la nona stagione, e The Doctor, The Widow and the Wardrobe Prequel, The Battle of Demon's Run - Two Days Later, La notte del Dottore e L'ultimo giorno per gli episodi speciali della settima stagione. Il mini-episodio Attack of the Graske è un mini-episodio interattivo registrato dal punto di vista dello spettatore, che impersona un compagno di viaggio del Dottore. Il mini-episodio Music of the Spheres è stato trasmesso in occasione del Doctor Who Prom del 2008, ed è composto sia da parti pre-registrate, che da parti riprese direttamente all'evento, in cui intervengono direttamente gli spettatori.
Cronologia degli episodi Titolo originale Titolo italiano Prima TV UK Prima TV ItaliaTra la 1ª e la 2ª stagione Born Again 18 novembre 2005 The Christmas Invasion L'invasione di Natale 25 dicembre 2005 24 dicembre 2006Attack of the Graske 25 dicembre 2005 Durante la 2ª stagione Tardisodes 1º aprile - 1º luglio 2006 Tra la 2ªe la 3ª stagione The Runaway Bride La sposa perfetta 25 dicembre 2006 6 luglio 2008Tra la 3ª e la 4ª stagione Time Crash 16 novembre 2007 Voyage of the Damned Il viaggio dei dannati 25 dicembre 2007 12 ottobre 2008Tra la 4ª e la 5ª stagione Music of the Spheres 27 luglio 2008 The Next Doctor Un altro Dottore 25 dicembre 2008 19 marzo 2011 Planet of the Dead Il pianeta dei morti 11 aprile 2009 21 marzo 2011 The Waters of Mars L'acqua di Marte 15 novembre 2009 22 marzo 2011 The End of Time: Part One La fine del tempo (prima parte) 25 dicembre 2009 23 marzo 2011 The End of Time: Part Two La fine del tempo (seconda parte) 1º gennaio 2010 24 marzo 2011Durante la 5ª stagione Meanwhile in the TARDIS (il primo dopo l'episodio L'undicesima ora,
il secondo dopo l'episodio Carne e pietra) DVD Tra la 5ª e la 6ª stagione A Christmas Carol Un canto di Natale 25 dicembre 2010 9 aprile 2011 Space 18 marzo 2011 Time 18 marzo 2011 Durante la 6ª stagione The Impossible Astronaut prequel 25 marzo 2011 The Curse of the Black Spot prequel 30 aprile 2011 A Good Man Goes to War prequel 28 maggio 2011 Let's Kill Hitler prequel 15 agosto 2011 The Wedding of River Song prequel 24 settembre 2011 Night and the Doctor DVD Tra la 6ª e la 7ª stagione Death Is the Only Answer 1º ottobre 2011 The Doctor, the Widow and the Wardrobe Prequel 6 dicembre 2011 The Doctor, the Widow and the Wardrobe Il Dottore, la vedova e l'armadio 25 dicembre 2011 23 febbraio 2012 Good As Gold 24 maggio 2012 Pond Life 27-31 agosto 2012 Nella prima parte della 7ª stagione Asylum of the Daleks Prequel 2 settembre 2012 The Making of the Gunslinger 16 settembre 2012 The Inforarium DVD P.S. DVD Tra la prima e la seconda parte della 7ª stagione The Great Detective 16 novembre 2012 Vastra Investigates 17 dicembre 2012 The Battle of Demon's Run - Two Days Later 25 marzo 2013The Snowmen I pupazzi di neve 25 dicembre 2012 20 giugno 2013Nella seconda parte della 7ª stagione The Bells of Saint John - A Prequel 23 marzo 2013 Rain Gods DVD Clara and the TARDIS DVD She Said, He Said 11 maggio 2013 Clarence and the Whispermen 26 maggio 2013 Tra la 7ª e l'8ª stagione The Night of The Doctor La notte del Dottore 16 novembre 2013 DVD The Last Day L'ultimo giorno 21 novembre 2013 DVD The Day of the Doctor Il giorno del Dottore 23 novembre 2013 23 novembre 2013 The Time of the Doctor Il tempo del Dottore 25 dicembre 2013 25 dicembre 2014Tra l'8ª e la 9ª stagioneLast ChristmasL'ultimo Natale 25 dicembre 2014 24 dicembre 2015Durante la 9ª stagione Prologue 11 settembre 2015 The Doctor's Meditation 15 settembre 2015 Tra la 9ª e la 10ª stagione The Husbands of River Song I mariti di River SongChiamato a volte Il marito di River Song da Rai 4. 25 dicembre 2015 2 maggio 2016 The Return of Doctor Mysterio Il ritorno del dottor Mysterio 25 dicembre 2016 25 dicembre 2017Tra la 10ª e l'11ª stagione Twice Upon a Time C'era due volte 25 dicembre 2017 11 febbraio 2018Tra l'11ª e la 12ª stagioneResolutionPropositi1º gennaio 201924 febbraio 2019Tra la 12ª e la 13ª stagioneRevolution of the Daleksinedito1º gennaio 2021ineditoDopo la 13ª stagioneEve of the Daleksinedito1º gennaio 2022ineditoLegend of the Sea Devilsinedito17 aprile 2022ineditoThe Power of the Doctorinedito23 ottobre 2022inedito
Born Again Diretto da: Euros Lyn Scritto da: Russell T. Davies Tipo di speciale: Mini-episodio (durata: 7 minuti), inserito all'interno della maratona benefica Children in Need del 2005. Trama Rose è atterrita e sconvolta dalla rigenerazione del Dottore appena avvenuta, al punto che non riesce a credere che si tratti della medesima persona. Il Dottore, appena cambiato, riesce a provarle però di ricordare tutto il loro trascorso fin dalla prima frase che si sono scambiati. Rose è combattuta ma ancora molto restia nel dare confidenza al Dottore, questo spinge il Signore del Tempo ad invertire la rotta del TARDIS e a riportare la giovane compagna a casa. Ad un tratto però sembra che qualcosa non vada, il Dottore inizia ad avere spasmi e a liberare energia residua del Vortice del Tempo. Rose è terrorizzata mentre il TARDIS accelera verso la Terra della vigilia di Natale pilotato da un Dottore che sembra stare impazzendo. Cast: David Tennant (Il Dottore), Billie Piper (Rose Tyler)
L'invasione di Natale Titolo originale: The Christmas Invasion Diretto da: James Hawes Scritto da: Russell T. Davies Tipo di speciale: Speciale natalizio 2005. Trama Un satellite viene spedito nello spazio per un esperimento, ma viene catturato da un'astronave aliena appartenente ai Sycorax, che vogliono tentare la conquista della Terra. Il Primo Ministro, Harriet Jones, tenta di entrare in contatto con il Dottore per avere aiuto, ma quest'ultimo è irreperibile a causa della sua recente rigenerazione che lo ha lasciato senza forze. Rose cerca di guarirlo a casa sua insieme a Jackie, ma, dopo l'attacco di alcuni robot, decide che è meglio rintanarsi nel TARDIS. Lei e Mickey trascinano il Dottore ancora incosciente nel TARDIS, il quale viene però teletrasportato sull'astronave aliena, dove erano entrati anche Harriet Jones e alcuni suoi collaboratori. Lì tentano di convincere i Sycorax a fermarsi, ma essi si fanno beffe di loro, uccidendo alcuni dei collaboratori della Jones. Prima che uccidano anche gli altri il Dottore si risveglia e sfida a duello il capo dei Sycorax. Durante il combattimento l'alieno taglia una mano al Dottore che, essendo ancora in fase di rigenerazione, è eccezionalmente in grado di farne ricrescere una nuova, vincendo così il combattimento e obbligando gli alieni alla rinuncia del pianeta. Ma una volta tornati sulla Terra, Harriet Jones manda l'ordine al Torchwood di distruggere l'astronave con un'arma aliena in loro possesso; il Dottore, vedendo la nave distrutta, si infuria e trova il modo di far perdere alla donna il suo potere. Cast: David Tennant (Il Dottore), Billie Piper (Rose Tyler), Camille Coduri (Jackie Tyler), Noel Clarke (Mickey Smith), Penelope Wilton (Harriet Jones), Adam Garcia (Alex), Daniel Evans (Danny Llewellyn), Sean Gilder (Leader dei Sycorax), Anita Briem (Sally Jacobs), Chu Omambala (Maggiore Blake), Sian McDowell (Sandra), Paul Anderson (Jason), Cathy Murphy (madre), Sean Carlsen (poliziotto), Jason Mohammad (annunciatore #1), Sagar Arya (annunciatore #2), Lachele Carl (annunciatrice)
Attack of the Graske Diretto da: Ashley Way Scritto da: Gareth Roberts Tipo di speciale: Mini-episodio interattivo, pubblicato sul sito web della BBC. Trama L'umanità sta per venire sostituita da dei duplicati alieni. Solo il Dottore ed il suo nuovo compagno di viaggio, nientemeno che lo spettatore stesso, potranno scongiurare questa minaccia. Cast: David Tennant (Il Dottore), Lisa Palfrey (mamma), Nicholas Beveney (papà), Mollie Kabia (ragazza), James Harris (ragazzo), Robin Meredith (nonno), Gwenyth Petty (nonna), Roger Nott (uomo anziano), Catherine Olding (donna giovane), Jimmy Vee (Graske), Ben Oliver (monello)
Tardisodes Diretto da: Ashley Way Scritto da: Gareth Roberts