__NOTOC__ La seconda ed ultima stagione di Stargate Universe è andata in onda dal 28 settembre 2010 al 9 maggio 2011 sul network statunitense Syfy.

In Italia è andata in onda sul canale satellitare AXN Sci-Fi dal 10 gennaio al 6 novembre 2011.

nºTitolo originaleTitolo italianoPrima TV USAPrima TV Italia 1 Intervention (Part 3) Intervento (Parte 3) 28 settembre 2010 10 Gennaio 2011 2 Aftermath Conseguenze 5 Ottobre 2010 17 Gennaio 2011 3 Awakening Risveglio 12 ottobre 2010 24 gennaio 2011 4 Pathogen Agente patogeno 19 ottobre 2010 31 gennaio 2011 5 Cloverdale Presenza aliena 26 ottobre 2010 7 febbraio 2011 6 Trial and Error Tentativi 2 novembre 2010 14 febbraio 2011 7 The Greater Good Fiducia 9 novembre 2010 21 febbraio 2011 8 Malice Astuzia 16 novembre 2010 28 febbraio 2011 9 Visitation Visite * 23 novembre 2010 7 marzo 2011 10 Resurgence (Part 1) Rinascita (Parte 1) 30 novembre 2010 14 marzo 2011 11 Deliverance (Part 2) Liberazione (Parte 2) 7 marzo 2011 4 settembre 2011 12 Twin Destinies La fine della Destiny * 14 marzo 2011 11 settembre 2011 13 Alliances Alleanze 21 marzo 2011 18 settembre 2011 14 Hope Speranza 28 marzo 2011 25 settembre 2011 15 Seizure Sequestro 4 aprile 2011 2 ottobre 2011 16 The Hunt La caccia 11 aprile 2011 9 ottobre 2011 17 Common Descent Verso la salvezza 18 aprile 2011 16 ottobre 2011 18 Epilogue Epilogo ** 25 aprile 2011 30 ottobre 2011 19 Blockade Assedio ** 2 maggio 2011 23 ottobre 2011 20 Gauntlet L'ultimo viaggio 9 maggio 2011 6 novembre 2011

Intervento (Parte 3) Titolo originale: Intervention (Part 3) Scritto da: Joseph Mallozzi - Paul Mullie Diretto da: Andy Mikita Trama La Destiny è ancora sotto il controllo dell'Alleanza Lucian, Telford e TJ son feriti e Kiva è moribonda. Scott e Greer riescono a proteggersi dalle radiazioni della pulsar rifugiandosi nel lato opposto della nave e si ricongiungono con Eli, si accorgono così che Chloe sta miracolosamente guarendo dalla ferita. Rush e Brody ragguagliano Eli e Chloe sui nuovi sviluppi: gli scudi della nave sono ora abbastanza forti da permettere il salto in FTL. Rush però ha un'altra idea: deviare la potenza dagli scudi in modo da minacciare i Lucians e costringerli a restituire il controllo della Destiny. TJ, che nel frattempo è priva di conoscenza, ha un'esperienza mistica: è tornata sul pianeta che gli alieni hanno costruito, e il suo bambino è con Caine al sicuro, ma presto scopre che deve riprendere il suo posto sulla nave (queste sono le regole stabilite dagli alieni costruttori del pianeta per permettere che il bimbo rimanga al sicuro). Young è costretto a far scendere l'equipaggio su di un vicino pianeta vivibile e a questo punto Rush mette in atto il suo piano ma Dannic, che nel frattempo ha preso il comando dato che Kiva è morta, non vuole cedere e fa sbarcare sul pianeta Varro e i suoi seguaci che sono contrari alle sue scelte, ma quando anche gli altri si rendono conto di non avere più alcuna possibilità Ginn, il loro ingegnere, uccide Dannic e accetta le condizioni di Rush che riprende il controllo della nave, e riporta i compagni di viaggio e i Lucians ribelli sulla Destiny. La nave dopo un breve salto nell'iperspazio, ne esce davanti ad una nebulosa che TJ, che intanto ha ripreso conoscenza, riconosce avendola vista nella sua esperienza.

Conseguenze Titolo originale: Aftermath Scritto da: Robert C. Cooper Diretto da: William Waring Trama Con i prigionieri Lucian a bordo le scorte diminuiscono velocemente e Rush, che tiene ancora nascosta la sua conoscenza dei segreti della Destiny, fa uscire la nave dall'iperspazio nei pressi di un pianeta abitabile per fare scorte di generi alimentari adducendo scuse secondo cui i motori FTL sono rimasti danneggiati dalla pulsar. Lo stargate del pianeta è però inattivo e Young organizza una squadra per recarsi sul pianeta con lo shuttle. Rush ha delle visioni della sua defunta moglie che lo guida attraverso le sue decisioni, ma, quando la navetta parte, gli appare Franklin che lo avverte che l'ingresso nell'atmosfera avrebbe potuto distruggere la navetta; Rush corre alla radio ma è troppo tardi. I motori dello shuttle vanno in avaria e Scott riesce a stento a compiere un atterraggio di fortuna, ma nello schianto Riley rimane incastrato tra le lamiere e TJ si rende subito conto che non ce la farà. Il resto della squadra trova lo stargate del pianeta sepolto e si attiva per rimetterlo in funzione prima che la Destiny torni in modalità FTL. Sulla nave intanto i Lucians sono divisi: alcuni di loro offrono informazioni strategiche, nella speranza di un trattamento migliore, altri organizzano una sommossa che fallisce. Young decide che, una volta che lo stargate del pianeta sarà in funzione abbandonerà lì tutti i Lucians. Telford però lo informa che ha usato le pietre di comunicazione per contattare il Comando Stargate ed ha ricevuto l'ordine di trattenere sulla nave un gruppo selezionato di prigionieri. Nel relitto TJ confessa a Riley la storia del suo viaggio sul pianeta alieno; la Dr.ssa Park, nei pressi, ascolta in lacrime. Il team rimette in funzione lo stargate e fa ritorno sulla Destiny per fare rapporto. Young sbarca per parlare con Riley, e chiede a TJ di lasciarli soli. I due uomini si confortano a vicenda ma quando Young saluta Riley quest'ultimo lo implora di mettere fine alle sue sofferenze; il Colonnello esaudisce il suo ultimo desiderio e lo soffoca. La squadra torna alla nave, cercando di rendere la vita nello spazio il più normale possibile. Rush è in preda al rimorso per l'accaduto e perseguitato dalle visioni di sua moglie, con la speranza di avere informazioni più utili dallo spettro di Franklin.

Risveglio Titolo originale: Awakening Scritto da: Joseph Mallozzi - Paul Mullie Diretto da: Andy Mikita Trama La Destiny esce dall'FTL in rotta di collisione con una nave simile che però si aggancia automaticamente ad essa iniziando il trasferimento di grandi quantità di dati, dai quali Eli scopre che la nave è una disseminatrice di stargate e Rush che ha abbastanza energia da comporre l'indirizzo della Terra e mandare a casa l'equipaggio. Young invia una squadra esplorativa, ma li attende una sorpresa: la presenza di alieni in capsule di stasi che si risvegliano all'arrivo del team; Rush ne trova uno apparentemente molto debole e chiama T.J. per visitarlo e dal ponte di comando cerca di trasferire l'energia della nave sulla Destiny dove, nel frattempo Chloe confida a T.J. che la ferita è quasi completamente guarita. Le tensioni rimangono alte tra i Young e Camile riguardo al trattamento dei prigionieri Lucian e anche se molti di loro sono collaborativi, l'aggressività di uno dei loro ufficiali sta facendo peggiorare le cose per tutti. Quando viene tentato di attivare lo stargate Rush viene colpito da un'arma a raggi e Eli scopre che l'energia che la nave disseminatrice stava inviando alla Destiny ha invertito la direzione e che la Destiny rischia di rimanere completamente a secco senza che lui possa farci niente. Telford si unisce alla squadra sulla nave e trova Rush stordito, mentre la ricognizione rivela la presenza di una dozzina di camere di stasi aliene aperte. Telford decide di rimanere sulla nave disseminatrice nel tentativo di reinvertire il flusso di energia e salvare la Destiny mentre quest'ultima si prepara al salto nell'iperspazio. Mentre la squadra ritorna sulla Destiny Rush scompare e quando Telford sta per invertire il flusso la nave disseminatrice si stacca. È stato Rush dal ponte di comando. La Destiny salta in modalità FTL e Telford resta bloccato sulla disseminatrice in balia degli alieni.

Agente patogeno Titolo originale: Pathogen Scritto da: Carl Binder Diretto da: Robert Carlyle Trama La mamma di Eli è malata, e questi deve correre sulla terra per vederla e si rende conto che lei non starà meglio finché non saprà che lui sta bene. Chloe incomincia a comportarsi in modo strano e viene trovata in stato confusionale in una delle stive, l'equipaggio comincia a pensare che gli alieni che l'avevano rapita l'hanno manipolata geneticamente. Young vuole metterla in quarantena ma Rush lo convince a lasciarla libera sotto attenta osservazione mentre lui, grazie alle conoscenze acquisite da Chloe sta facendo passi da gigante nell'apprendimento dei sistemi della nave, ma continua a mantenere segreta la maggior parte delle sue conoscenze della Destiny. Sulla terra Camille va a trovare Sharon ma per via della situazione il loro rapporto è molto teso e in più deve aiutare Eli per i suoi problemi con la madre. Young decide di dare ai Lucian la possibilità di integrarsi col resto dell'equipaggio in cambio informazioni sull'Alleanza ma Simeon si comporta in maniera inadeguata con la Dr.ssa Park e viene rinchiuso mentre Varron fa del suo meglio per mettere a posto le cose e ciò non lascia indifferente TJ. Fra Simeon e Greer è guerra aperta. Brody, Park e Young sospettano di Rush che, messo alle strette rivela che Chloe ha risolto una difficile equazione grazie alla quale è aumentato il suo controllo della nave e il Colonnello ordina la quarantena per Chloe. Camille intanto aiuta Eli facendo adoperare le pietre di comunicazione alla madre che così vede lo splendido lavoro compiuto dal figlio; la stessa Camille però non riesce a risolvere i propri problemi. Rush tenta un'ultima carta facendo usare l'interfaccia neurale della Destiny a Chloe nella speranza che il computer della nave elimini la parte aliena; Young e TJ a malincuore accettano.

Presenza aliena Titolo originale: Cloverdale Scritto da: Brad Wright Diretto da: Alex Chapple Trama La squadra si trova su un pianeta per fare scorte ma Matt viene infettato da un fungo alieno che gli provoca allucinazioni e cresce sempre di più nel suo braccio, tanto che, visti gli inutili tentativi di TJ, Rush propone di amputarglielo. Ma quando TJ fa una incisione guida nel braccio di Matt scopre che il suo sangue è viola ed è chiaro che l'infezione si è diffusa internamente, e l'amputazione può solo peggiorare la situazione. Matt in preda alle allucinazioni crede di essere a Cloverdale per il suo matrimonio con Chloe, Everett è suo padre, Greer il suo testimone, Eli il fratello di Chloe, TJ un paramedico, Rush il Reverendo e gli altri membri dell'equipaggio i paesani in festa per l'evento; anche in questo stato però Matt ha la netta sensazione che qualcosa non vada. La squadra si dirige verso lo stargate inseguita da altri funghi giganteschi; una volta giunti lì Greer organizza una barricata e la squadra si arma di lanciafiamme per fermare i funghi e cercare nel frattempo di salvare Matt prima che la Destiny riprenda il viaggio nell'iperspazio. Young ordina che il personale non necessario ritorni a bordo, non prima di essere accuratamente controllato per impedire che l'infezione contamini la Destiny; durante l'assalto anche Chloe viene attaccata ma non viene infettata e il segno dell'attacco scompare; ciò che le ha guarito la gamba ha attaccato l'infezione fungina rendendola immune. TJ decide di fare una trasfusione da Chloe a Matt. L'attivazione continua dello stargate tiene i funghi lontani negli ultimi attimi e una volta conclusa la trasfusione Matt si riprende e torna a bordo con Chloe e Greer ma il Colonnello Young impone la quarantena sia a Chloe che a Matt.

Tentativi Titolo originale: Trial and Error Scritto da: Joseph Mallozzi - Paul Mullie Diretto da: Andy Mikita Trama