Il Japan Open Tennis Championships 2006 è stato un torneo di tennis giocato sul cemento. È stata la 34ª edizione dell'evento, che fa parte dell'International Series Gold nell'ambito dell'ATP Tour 2006 e della categoria Tier III nell'ambito del WTA Tour 2006. Si è giocato all'Ariake Coliseum di Tokyo, in Giappone, dal 2 all'8 ottobre 2006.
Campioni Singolare maschile
Roger Federer ha battuto in finale Tim Henman con il punteggio di 6–3, 6–3
Singolare femminile
Marion Bartoli ha battuto in finale Aiko Nakamura con il punteggio di 2–6, 6–2, 6–2
Doppio maschile
Ashley Fisher / Tripp Phillips hanno battuto in finale Paul Goldstein / Jim Thomas con il punteggio di 6–2, 7–5
Doppio femminile
Vania King / Jelena Kostanić Tošić hanno battuto in finale Chan Yung-jan / Chuang Chia-jung con il punteggio di 7–6(2), 5–7, 6–2
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