L'U.S. Men's Clay Court Championships 2006 è stato un torneo di tennis giocato sulla terra rossa. È stata la 96ª edizione del U.S. Men's Clay Court Championships, che fa parte della categoria International Series nell'ambito dell'ATP Tour 2006. Si è giocato al Westside Tennis Club di Houston in Texas negli Stati Uniti dal 10 al 17 aprile 2006.
Campioni Singolare
Mardy Fish ha battuto in finale Jürgen Melzer con il punteggio di 3–6, 6–4, 6–3.
Doppio
Michael Kohlmann / Alexander Waske hanno battuto in finale Julian Knowle / Jürgen Melzer con il punteggio di 5–7, 6–4, [10–5].
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