È laureato all'Università d'arte Musashino. Ha cominciato la carriere di mangaka disegnando 4 koma, ma deve la sua fama al manga di fantascienza, Eden: It's an Endless World!, che scrive e disegna. A questo alterna storie brevi, raccolte in antologie.
Serie Eden: It's an Endless World! (1997–2008). Pubblicato da Kōdansha in 18 volumi. In Italia è uscito per Panini Comics. Meltdown (メルトダウン) (2002–in corso). Pubblicato da Kōdansha. Inedito in Italia. Hantei Shiai Jōtō! (判定試合上等!) (2006–in corso). Pubblicato da Kōdansha. Inedito in Italia. All Rounder Meguru (オールラウンダー廻) (2008–2016). Pubblicato da Kōdansha in 19 volumi. In Italia è uscito per Panini Comics. Soft Metal Vampire (2016-in corso). Pubblicato da Kōdansha. In Italia è stato annunciato da Panini Comics.
Storie autoconclusive Racconti brevi Volume 1 (1996–1997) contiene 3 storie: Il corvo, la ragazza e lo yakuza, Sicuramente diventerà una ragazza carina, Per noi che non crediamo in dio. Racconti brevi Volume 2 (1996–2000) contiene 4 storie: Hang, Liceale del 2000, Stazione, Boys Don't Cry.
Bibliografia "Endo Hiroki" in A-Z MANGA. Guida al fumetto giapponese, (a cura di) Davide Castellazzi, Coniglio Editore, 2004, ISBN 88-88833-08-0. Danilo Santoni, Uno sguardo alla fine del mondo, in IntercoM. Altri progetti
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