Biografia Natìo di Catania, era figlio di RodrigoRodrigo Paternò (1409-1477), ambasciatore di Catania (1451), nove volte giurato di Catania e di Bona Orioles dei Baroni di San Pietro. Apparteneva alla linea dei baroni del Pantano Salso della famiglia Paternò.
L'8 gennaio 1479 Sisto IV lo elesse vescovo di Malta. Venne consacrato a Roma nella chiesa di San Lorenzo in Lucina dal cardinale Giovanni Battista Zeno, coadiuvato da Marco, arcivescovo di Colossi, e Giuliano Maffei, vescovo di Bertinoro.
Innocenzo VIII lo elevo arcivescovo il 6 luglio 1489, trasferendolo alla sede metropolitana di Palermo, dove morirà nel 1511.
Secondo numerose fonti fu creato cardinale da Giulio II, ma egli era troppo vecchio e poco dopo se ne morì senza ricevere il galero; inoltre fu tre volte presidente del Regno.
Genealogia episcopale La genealogia episcopale è: Cardinale Giovanni Battista Zeno Arcivescovo Giovanni Paternò, O.S.B.
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