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La seconda stagione di Spider-Man - L'Uomo Ragno è andata in onda negli Stati Uniti dal 1995 al 1996 ed è composta da 14 episodi.
In inglese la stagione è nota col titolo Neogenic Nightmare (letteralmente Incubo neogenico) e i suoi episodi, diversamente da quelli della stagione precedente, sono tutti collegati da una sottotrama comune.
Gli episodi Ossessione neogenica e La vendetta del mutante costituiscono un intreccio narrativo con la serie animata Insuperabili X-Men, ufficialmente ambientata nello stesso universo di Spider-Man - L'Uomo Ragno.
Curiosamente in italiano gli episodi dal quinto all'ottavo sono stati accomunati dall'unico titolo La vendetta del mutante, nonostante il primo dei quattro episodi fosse quasi completamente slegato dai successivi, essendo invece il seguito diretto del precedente, Ossessione neogenica.
Nº st. Nº tot. Titolo Titolo originale Prima TV Stati Uniti 1 14 I Perfidi Sei The Insidious Six 9 settembre 1995 2 15 La battaglia dei Perfidi Sei Battle of the Insidious Six 16 settembre 1995 3 16 L'Uomo Acqua Hydro-Man 23 settembre 1995 4 17 Ossessione neogenica The Mutant Agenda 30 settembre 1995 5 18 La vendetta del mutante Mutants' Revenge 7 ottobre 1995 6 19 La vendetta del mutante - Seconda parte Morbius 28 ottobre 1995 7 20 La vendetta del mutante - Terza parte Enter the Punisher 4 novembre 1995 8 21 La vendetta del mutante - Quarta parte Duel of the Hunters 11 novembre 1995 9 22 Il cacciatore di vampiri Blade, the Vampire Hunter 18 novembre 1995 10 23 Il vampiro immortale The Immortal Vampire 25 novembre 1995 11 24 La Tavola del Tempo - Prima parte Tablet of Time 3 febbraio 1996 12 25 La Tavola del Tempo - Seconda parte Ravages of Time 10 febbraio 1996 13 26 La vendetta di Toomes Shriek of the Vulture 17 febbraio 1996 14 27 L'incubo dell'Avvoltoio The Final Nightmare 24 febbraio 1996
I Perfidi Sei Titolo originale: The Insidious Six Prima TV Stati Uniti: 9 settembre 1995
Per via dei salvataggi dell'Uomo Ragno sul "suo territorio", Kingpin viene deriso dai suoi colleghi criminali, e perciò decide di istituire il gruppo dei Perfidi Sei, composto dal Camaleonte, lo Scorpione, Mysterio, Shocker, Rhino e il Dottor Octopus. I sei danno parecchio filo da torcere all'Uomo Rango, soprattutto perché quest'ultimo ha dei problemi coi propri superpoteri, che svaniscono in continuazione, motivo per cui il supereroe decide di farsi fare delle analisi da Curt Connors. Successivamente il Dottor Octopus riesce ad attirare a sé May, la zia di Peter, facendole credere che suo nipote sia stato ricoverato in una clinica, e lasciano a Peter un messaggio nel quale dicono di far sì che l'Uomo Ragno, con cui sospettano sia in contatto, vada da loro, nel caso in cui voglia rivedere sua zia sana e salva. Il supereroe arriva quindi a destinazione, dovendo affrontare i sei criminali.
Basato su: The Amazing Spider-Man Annual serie 1 n. 1 (in Italia L'Uomo Ragno serie 1 n. 14)
La battaglia dei Perfidi Sei Titolo originale: Battle of the Insidious Six Prima TV Stati Uniti: 16 settembre 1995
I Perfidi Sei riescono a smascherare l'Uomo Ragno, tuttavia, dato che aveva perso i suoi poteri, credono semplicemente che Peter si sia travestito da Uomo Ragno non essendo riuscito a trovare quello vero. Dopo aver fatto andar via zia May dalla clinica, i criminali vanno sul tetto di un palazzo dove, secondo quanto dice Peter, lui incontrerebbe l'Uomo Ragno a mezzanotte. Peter riesce a travestirsi da supereroe senza farsi vedere, attaccando i suoi nemici. In tutto ciò l'eroe riesce anche a salvare Silvermane, un criminale che era stato preso di mira da Kingpin. Dopo l'insuccesso, i Perfidi Sei decidono di abbandonare il loro capo e di andarsene ognuno per la propria strada. Più tardi l'Uomo Ragno va da Connors a chiedere i risultati delle analisi, per scoprire che la mutazione che l'ha trasformato in passato nel supereroe che è non è ancora finita, e che perciò potrebbe trasformarsi in qualcosa di non umano.
Basato su: The Amazing Spider-Man serie 1 n. 12 (L'Uomo Ragno serie 1 n. 10) e The Amazing Spider-Man Annual serie 1 n. 1 (L'Uomo Ragno serie 1 n. 14)
L'Uomo Acqua Titolo originale: Hydro-Man Prima TV Stati Uniti: 23 settembre 1995
A New York si verificano numerosi furti di oggetti preziosi. Il colpevole è Morrie Bench, alias Hydro-Man, l'ex ragazzo di Mary Jane Watson (la ragazza che frequenta Peter). Hydro-Man ha il superpotere di trasformarsi in acqua, e il suo intento è di convincere Mary Jane a ricominciare ad avere una relazione con lui e, per convincerla, ha rubato i gioielli in modo da dimostrarle ciò che ora può fare per lei. Mentre l'Uomo Ragno si scontra con lui, Mary Jane riesce ad attirare Morrie sul tetto di un palazzo, dove finisce presto per evaporare. L'Uomo Ragno non è tuttavia convinto che sia morto, date le proprietà di transizione di fase dell'acqua.
Basato su: The Amazing Spider-Man serie 1 n. 212 (L'Uomo Ragno serie 2 n. 42)
Ossessione neogenica Titolo originale: The Mutant Agenda Prima TV Stati Uniti: 30 settembre 1995
Per risolvere i suoi problemi riguardo alla mutazione, l'Uomo Ragno decide di andare dal professor Charles Xavier nella sua scuola, che è segretamente la base degli X-Men, un gruppo di supereroi mutanti. Dopo la sua richiesta di aiutarlo a tornare normale, gli X-Men non lo vedono di buon occhio, dato che loro sono invece convinti che non ci sia nulla di male nell'essere un mutante. Tuttavia uno di loro, Henry McCoy, soprannominato Bestia, parla a tu per tu con l'Uomo Ragno e, rendendosi conto che la sua mutazione non è naturale come la loro, decide di aiutarlo e gli consiglia perciò di andare a una conferenza tenuta dal dottor Herbert Landon, che sta studiando proprio le mutazioni genetiche. Peter va alla conferenza, ma Landon viene attaccato da Hobgoblin, venendo però salvato provvidenzialmente dall'Uomo Ragno. Landon tuttavia fa rapire Bestia, in quanto i suoi studi lo hanno in realtà portato alla creazione di una sostanza che causa la morte dei mutanti (allo scopo di "purificare" la specie umana), e ha intenzione di sperimentarla su Bestia. L'Uomo Ragno si scontra poi con Hobgoblin, che gli rivela il piano di Landon, senza tuttavia che il supereroe gli creda. Quest'ultimo viene tuttavia raggiunto da Wolverine, un X-Man parecchio aggressivo, convinto che sia lui il rapitore di Bestia.
Basato su: Spider-Man - The Mutant Agenda n. 1 (Marvel miniserie n. 15)
Note: questo è il primo di due episodi che costituiscono un intreccio narrativo con la serie animata Insuperabili X-Men. Il titolo italiano sembra derivare dalla traduzione di Neogenic Nightmare, titolo dell'intera stagione.
La vendetta del mutante Titolo originale: Mutants' Revenge Prima TV Stati Uniti: 7 ottobre 1995
L'Uomo Ragno e Wolverine decidono di allearsi per salvare Bestia, andando perciò da Landon e scoprendo così che ciò che aveva detto Hobgoblin era vero. I due riescono a liberare McCoy, ma Landon, che stava inseguendo Hobgoblin, finisce per entrare in una vasca colma della sostanza per uccidere i mutanti. Non essendo un mutante non muore, ma finisce per trasformarsi in una creatura che ha ben poco di umano, e che ha bisogno di assorbire energia elettrica per sopravvivere. Landon finisce così per uscire allo scoperto e assorbire l'elettricità della città. L'Uomo Ragno e gli X-Men uniscono così le forze, riuscendo a far regredire Landon a una forma più umana, pur rimanendo parzialmente mutato.
Basato su: Spider-Man - The Mutant Agenda serie 1 nn. 2 e 3 (Marvel miniserie n. 15)
Note: questo è il secondo episodio che fa da intreccio narrativo con la serie Insuperabili X-Men. Il titolo italiano deriva da un errore di traduzione dato che Mutants' Revenge significa "La vendetta dei mutanti" e non "La vendetta del mutante" (che sarebbe Mutant's Revenge, con l'apostrofo in posizione differente). Nell'episodio sono infatti presenti più di un mutante.
La vendetta del mutante - Seconda parte Titolo originale: Morbius Prima TV Stati Uniti: 28 ottobre 1995
L'Uomo Ragno chiede aiuto a Mariah Crawford, che riesce a creare quello che potrebbe essere l'antidoto per la sua mutazione, non essendo tuttavia sicura dei risultati. Nonostante lei preferirebbe aspettare per vedere gli effetti della sostanza, l'Uomo Ragno insiste per prenderne ugualmente una fiala da ingerire successivamente, in quanto teme di potersi trasformare in un mostro da un momento all'altro. Più tardi, di notte, Michael Morbius, il nuovo ragazzo di Felicia Hardy, conduce degli esperimenti utilizzando dei pipistrelli vampiri, allo scopo di trovare la cura per una malattia che ha colpito il suo villaggio d'origine, che sembra sia causata proprio da tali animali. Uno dei pipistrelli viene tuttavia colpito dal raggio di un ricombinatore neogenico assieme a un campione del sangue di Peter (che Michael aveva precedentemente rubato), e successivamente morde Morbius. Quest'ultimo finisce così per acquisire un'enorme forza fisica e la capacità di levitare, finendo però per assumere l'aspetto di un vampiro, divenendo inoltre assetato di plasma, che riesce a risucchiare alle persone tramite le mani. Morbius si scontra poi con l'Uomo Ragno, che scopre la sua vera identità e, appena sorge il sole, riacquista il suo aspetto normale. Peter decide poi di assumere la sostanza datagli da Mariah, che però, anziché guarirlo, finisce invece con l'accelerare la sua mutazione, facendogli crescere quattro arti superiori in più.
Basato su: The Amazing Spider-Man serie 1 nn. 101 e 102 (L'Uomo Ragno serie 1 nn. 102 e 103)
Nota: il titolo italiano, derivato da quello de La vendetta del mutante, non ha in realtà alcun collegamento con l'episodio.
La vendetta del mutante - Terza parte Titolo originale: Enter the Punisher Prima TV Stati Uniti: 4 novembre 1995
Dopo che Morbius, ricoverato in ospedale, fugge dalla finestra volando, l'Uomo Ragno viene sospettato di averlo rapito, così Frank Castle, detto il Punitore, un uomo armato che si occupa di catturare criminali, parte alla sua ricerca. L'Uomo Ragno intanto si fa prelevare del sangue da Mariah sperando che lei possa trovare una cura per la sua mutazione, e successivamente insegue Morbius. Durante l'inseguimento il supereroe viene tuttavia preso di mira dal Punitore. Mentre quest'ultimo lo sta seguendo, la mutazione dell'Uomo Ragno raggiunge il culmine, trasformandolo in un enorme ragno umanoide.
Basato su: The Amazing Spider-Man serie 1 nn. 101, 102 e 129 (L'Uomo Ragno serie 1 nn. 102, 103 e 149)
Nota: il titolo italiano, derivato da quello de La vendetta del mutante, non ha in realtà alcun collegamento con l'episodio.
La vendetta del mutante - Quarta parte Titolo originale: Duel of the Hunters Prima TV Stati Uniti: 11 novembre 1995
La creatura in cui si è trasformato l'Uomo Ragno, che lui non riesce a controllare, viene soprannominata "Ragno Uomo", e comincia a causare panico tra i cittadini. Mariah riesce a creare quello che sembrerebbe essere un antidoto per la mutazione e per poterlo somministrare al supereroe chiede aiuto a Sergei, che gli dà la caccia. Anche il Punitore parte al suo inseguimento, ma Mariah lo convince a non fare del male al Ragno Uomo, riuscendo poi a somministrargli l'antidoto e a farlo tornare normale.
Note: l'episodio non è propriamente basato su una storia a fumetti, tuttavia la trasformazione dell'Uomo Ragno nel Ragno Uomo si basa su quella presente su Marvel Fanfare serie 1 n. 2 (Speciale X-Men n. 2). Il titolo italiano, derivato da quello de La vendetta del mutante, non ha in realtà alcun collegamento con l'episodio.
Il cacciatore di vampiri Titolo originale: Blade, the Vampire Hunter Prima TV Stati Uniti: 18 novembre 1995