Le elezioni comunali in Toscana del 1999 si tennero il 13 giugno, con ballottaggio il 27 giugno.
Risultati Provincia di Arezzo Arezzo
Cortona
San Giovanni Valdarno
Sansepolcro
Provincia di Firenze Bagno a Ripoli
Borgo San Lorenzo
Calenzano
Campi Bisenzio
Castelfiorentino
Certaldo
Empoli
Fiesole
Firenze
Fucecchio
Lastra a Signa
Pontassieve
San Casciano in Val di Pesa
Scandicci
Sesto Fiorentino
Provincia di Grosseto Follonica
Provincia di Livorno Cecina
Collesalvetti
Livorno
Piombino
Rosignano Marittimo
Provincia di Lucca Capannori
Massarosa
Provincia di Pisa Pontedera
San Giuliano Terme
San Miniato
Provincia di Pistoia Monsummano Terme
Montecatini Terme
Provincia di Prato Prato
Provincia di Siena Colle di Val d'Elsa
Poggibonsi
Toscana 1999