U sezoni 1999./00. treći nogometni rang SR Jugoslavije činile su 6 srpskih skupina (Vojvodina, Beograd, Dunav, Morava, Niš i Timok) i jedna crnogorska skupina. Klubovi kosovskih Albanaca igrali su u prvenstvu koje nije bilo integrirano u jugoslavensko.
Srbija Srpska liga − Vojvodina
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Mladost Lukićevo 4030468637+49942. Budućnost B. Dvor 4028669526+69903. Elan Srbobran 40237106541+24764. Veternik Novi Sad 40225137449+25715. Srem S. Mitrovica 40217129758+39706. AIK Bačka Topola 40199126439+25667. Radnički Bajmak 40206146659+7668. Solunac Karađorđevo 40204166645+21649. Jedinstvo Kačarevo 40195167353+206210. Bačka B. Palanka 40187155344+96111. Begej Žitište 40178156052+85912. Inđija 40185176764+35913. Tekstilac Odžaci 40184185357−45814. Sutjeska B. Dobro Polje 40163215774−175115. Jedinstvo Vršac 40156195170−195116. Proleter Ravno Selo 401310176583−184917. Mladost Bački Jarak 40135225582−274418. Radnički Nova Pazova 40117224665−194019. Radnički Sombor 40810224383−403420. Zadrugar Lazarevo 4047293798−611921. Sloven Ruma 40333430124−9412 <small> Izvori:rsssf.orgfsgzrenjanin Mladost Lukićevo i Budućnost B. Dvor plasirali su se u Drugu ligu − Sjever Status je izgubilo devet posljednjih klubova
Srpska liga − Beograd
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Bežanija 3423836828+40772. Mladi Obilić 3424467030+4076Plasirao se, ali odustaje3. Rakovica 34151185038+12564. Polet Mirosaljci 34167114336+7555. Balkan Mirijevo 34148124235+7506. Grafičar 34138135340+13477. Voždovac 341211115248+4478. Trudbenik 341210124438+6469. Polet Beograd 34135164467−234410. Žarkovo 34126164846+24211. Dorćol 34119144140+14212. Crvena zvezda MML 34118153945−64113. Sinđelić 341011134049−94114. Mladenovac 34125174468−2439 (−2)15. BASK 34911145057−72216. Srem Jakovo 3498173250−183518. BSK Batajnica 34105193761−2435 Izvori: Bežanija i Rakovica plasirali su se u Drugu ligu − Sjever
Srpska liga − Dunav
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Jedinstvo Ub 38288210332+71922. Sloga Lipnički Šor 3827659331+62873. Mačva Bogatić 38217107242+30704. Mačva Šabac 38197126436+28645. Radnički Zorka Šabac 38196136049+11636. Železničar Smederevo 38195147951+28627. Sloga Petrovac 38179126038+22608. Ribnica Mionica 381612105746+11609. Gučevo Banja Koviljača 38157165437+175210. Borac Veliko Laole 38157164862−145211. Mladost Goša S. Palanka 38149154850−25112. VGSK V. Gradište 38172197183−125313. Jabučje 381310156667−14914. Karađorđe Mišar 3814519696904715. Napredak Nabrđe 38138176082−224716. Selevac 38135205083−334417. Radnički Koceljeva 38125214658−124118. Morava V. Plana 38118194461−174119. MIP Požarevac 3895244284−423220. Mladi radnik Radinac 38213518143−1257 Izvori: Jedinstvo Ub i Sloga Lipnički Šor plasirali su se u Drugu ligu − Zapad
Srpska liga − Morava
mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Zastava Kragujevac 3824866625+41802. Metalac Gornji Milanovac 38221246624+42783. Jedinstvo Užice 38187136039+21614. Šumadija Aranđelovac 38177146857+11585. Sevojno 381411135843+15536. Sloga Požega 381411135338+15537. Takovo Gornji Milanovac 38158155150+1538. Remont Čačak 381312135651+5519. Metalac Trgovački Kraljevo 38131213555505110. Badnjevac 38149155058−85111. Kraljevo Hajduk 3814816464605012. Karađorđe Topola 381213135448+64913. Polet Ljubić 38147174650−44914. FAP Priboj 38146184751−44815. Rudar Baljevac 38153206170−94816. Goč Vrnjačka Banja 38146185667−114817. Omladinac Zablaće 38138173850−124718. Vodojaža Grošnica 38145194165−244719. Polimlje Prijepolje 38135204089−494420. Gruža 38108203167−3638 Izvori: Zastava Kragujevac i Metalac Gornji Milanovac plasirali su se u Drugu ligu − Zapad
Srpska liga − Timok mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Rudar Bor 3827478626+6085Plasirao se, ali odustaje2. Napredak Kušiljevo 38244108041+39763. Župa Aleksandrovac 38198115934+25654. Kopaonik Brus 38204145859−1645. Majdanpek 38178136637+29596. Timok Zaječar 38176156749+18577. 14. oktobar Kruševac 38167154941+8558. SFS Borac Paraćin 38166166660+6549. Đerdap Kladovo 38157167061+95210. Juhor Obrež 38164185779−225211. Jagodina 38149155869−115112. Timočanin Knjaževac 38155185968−95013. Hajduk Veljko Negotin 38155185564−95014. Slatina 38148165869−115015. Sloga Despotovac 38155185366−135016. Cement Popovac 38147175564−94917. Policajac Bor 38138175168−174718. Morava Ćuprija 38143215681−254519. Putevi Zaječar 38123234678−323920. Borac Bivolje 3895244384−4132 Izvori: Napredak Kušiljevo plasirao se u Drugu ligu − Istok
Srpska liga − Niš mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Železničar Niš 3827569630+66862. Žitorađa 38228811635+81743. Radnički Pirot 381971210559+46644. Car Konstantin Niš 38195147646+30625. Sinđelić Niš 38194157156+15616. Jastrebac Blace 38185157152+19597. BSK Bujanovac 38176156159+2578. Dinamo Vranje 38168145749+8569. Radan Lebane 3818218636305610. Pukovac 38166163257−255411. Mladost Vinarce 38158155852+65312. Jedinstvo Bela Palanka 38165176265−35313. Progres Pirot 38165175768−115314. Svrljig 381410145452+25215. Jastrebac Niš 381410147073−35216. Vlasina 38156176274−125117. Pusta reka Bojnik 38155186679−135018. Radnik Surdulica 38145197282−104719. Koca Niška Banja 38752641120−792620. Morava Vladičin Han 38513231157−12616 Izvori: Železničar Niš i Žitorađa plasirali su se u Drugu ligu − Istok
Crna Gora mj. klub ut. pob. ner. por. gol+ gol- gr bod1. Iskra Danilovgrad 2819545513+42622. Zabjelo Podgorica 2815675128+3350 (−1)3. Crvena stijena Podgorica 28143113435−1454. Petrovac 28111074426+18435. Dečić Tuzi 28117103026+4406. Gusinje 2810993337−4397. Arsenal Tivat 281071136360378. Zora Spuž 28107113542−7379. Ribnica Podgorica 28106124245−33610. Rumija Bar 2871473027+33511. Kom Podgorica 28105133641−53512. Jezero Plav 28105132743−1634 (−1)13. Polimlje Murino 28104142849−2133 (−1)14. Bratstvo Cijevna 2895143643−73215. Cetinje 2855183460−2619 (−1)16. Gorštak Kolašin odustao od natjecanja Izvori: Iskra Danilovgrad i Zabjelo Podgorica plasirali su se u Drugu ligu − Jug U narednoj sezoni Crnogorska liga imala je 18 članova
Kosovo U Republici Kosovo prvenstvo je organizirano paralelno s prvenstvom SR Jugoslavije, a njime je upravljao FFK. Prvo prvenstvo nakon rata 1999./00. označava novu stranicu kosovskog nogometa. Ovo izdanje natjecanja počinje s 18 momčadi u Prvoj ligi, 25 momčadi podijeljenih u dvije skupine u Drugoj ligi i Trećoj ligi s 91 momčadi raspoređenih u 11 skupina. Prvak je bila KF Prishtina.Futbolli 1991-2011 20 vjet mëvetësim
Poveznice Prva liga SR Jugoslavije 1999./00. Druga liga SR Jugoslavije 1999./00. Kup SR Jugoslavije 1999./00.
Izvori
Vanjske poveznice Yugoslavia 1999/00 − RSSSF RAT, RASPAD SFR JUGOSLAVIJE, SANKCIJE Leagues of Yugoslavia (1999/00)
1999./00.