El club Académicos de Atlas fue un equipo filial del Atlas Fútbol Club, que jugó en la Liga de Nuevos Talentos de la Segunda División de México.
Historia Iniciaron su historia en la Tercera división mexicana; donde consiguió ascender tras coronarse campeón sobre el América Acoxpa, en la Segunda división mexicana ganó su derecho de participar en la primera división "A" a partir de la siguiente temporada. Sin embargo el Atlas decidió mandar al equipo a la ciudad de Hermosillo, Sonora; a petición del gobernador del estado Eduardo Bours, donde lograron llegar a la semifinal de ese torneo, siendo eliminados por el Puebla FC en un empate global. Para el torneo de Apertura 2006, el equipo de Coyotes se mandó a la ciudad de Zapotlanejo, volviéndose a llamar Académicos. Para el siguiente torneo el equipo volvió a cambiar de sede ahora quedandonse en el municipio de Tonalá siendo Académicos de Tonalá.
El 2 de abril de 2016 disputó su último partido en contra de Correcaminos UAT, tras terminar el Clausura 2016, la liga anunció cambios en el formato del torneo y por este motivo "Académicos" desapareció, quedando Atlas Premier como único equipo filial de Atlas en la Segunda División.
Palmarés Torneos oficiales Segunda División de México Campeón (2): Apertura 2004, Clausura 2005. Subcampeón (1): Apertura 2006. Campeón de Campeones de la Segunda División de México Campeón (1): 2004-2005. Liga de Nuevos Talentos Campeón (2): Clausura 2012, Apertura 2012. Subcampeón (1): Independencia 2010. Copa de la Liga de Nuevos Talentos Subcampeón (1): Clausura 2014. Campeón de Campeones de la Liga de Nuevos Talentos Campeón (2): 2011-12, 2012-13. Tercera División de México Campeón (1): Invierno 2001.
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