El Biotren es un sistema de ferrocarril metropolitano suburbano chileno, que cubre parte del Gran Concepción. Brinda servicio a las comunas de Concepción, Talcahuano, Hualpén, San Pedro de la Paz, Coronel, Chiguayante y Hualqui. Es parte del Transporte Público Metropolitano de Concepción.

Fue inaugurado en 1999, siendo remodelado por Ferrocarriles del Sur en 2005 y administrado por la Gerencia Zonal del Biobío de la Empresa de los Ferrocarriles del Estado (EFE) hasta septiembre de 2006. En ese entonces, se reestructuraron las gerencias de esa empresa y empezó a formar parte del Sistema de Transporte Integrado de Concepción, Biovías. Desde mayo de 2008, es administrado por EFE Sur, empresa filial de EFE.

Historia

Primeros años (1999-2004) El Biotren se puso en marcha el 1 de diciembre de 1999. En un principio solo contaba con tres estaciones y dos paraderos (I generación): El Arenal, Los Cóndores, Estación Central de Concepción, Chiguayante y Valle del Sol. Para el funcionamiento se reacondicionaron cuatro automotores japoneses de la serie AEL.

En 2001 se terminaron los nuevos paraderos (II generación) y empezó a operar el Taller Ferroviario Hualqui. Las estaciones inauguradas el 2001 fueron Lorenzo Arenas, Pedro Medina, Manquimávida y Hualqui. Quedó pendiente el tramo a Puerta Los Leones, la combinación con buses y la doble vía Chiguayante - La Leonera. Luego llegaron dos automotores AES.

En 2003 se construyó la estación Plaza el Ancla. Luego se construyeron las vías hacia dicha estación y se electrificaron hasta el cruce La Unión. Finalmente la estación no entraría en operaciones, construyéndose el 2005 a 400 metros la Estación Mercado.

Proyecto Biovías y creación de la línea 2 (2004-2013) El 5 de enero de 2004 se presentó Biovías, el Sistema de Transporte Integrado del Gran Concepción, que incluyó la renovación del Biotren.

Se solicitó a Ferrocarriles Suburbanos de Concepción S.A. la licitación de las obras. Por otro lado, la Empresa de los Ferrocarriles del Estado incluyó obras en su proyecto de seguridad ferroviaria y en sus Contratos de Provisión de Infraestructura Ferroviaria (CPIF) del Proyecto Zona Centro (PZC) y del Proyecto Señalización, Electrificación y Comunicaciones (SEC).

thumb|left|100px|Símbolo del Biotren entre 2005 y 2013. El relanzamiento del Biotren ocurrió el 24 de noviembre de 2005, fecha en que con presencia del Presidente de la República de ese entonces, Ricardo Lagos, se inauguraron estaciones de tercera generación de la línea 1 (Mercado, Hospital Las Higueras, Estación Universidad Técnica Federico Santa María y Leonera, este último reemplazando a la antigua Estación Valle del Sol), junto con la nueva Estación Concepción ubicada a unos metros del antiguo edificio, y la línea 2 que conecta Concepción con San Pedro de la Paz hasta el sector Lomas Coloradas con su estación homónima. Además, se estrenó la nueva imagen corporativa del Biotren con una flecha en círculo, que perduró hasta el 2013 y que hasta el día de hoy las estaciones reacondicionadas o construidas el 2005 mantienen.

En 2005 ocurrió un recambio de equipos en las vías, siendo automotores UT 440 españoles los nuevos ferrocarriles que llegaron al servicio. Se reformaron tres UT 440 del servicio Metrotrén y quedaron siete automotores reformados renombrados como UT440MC (Modelo Concepción). Aunque los UT440MC y los UT440 son estéticamente diferentes, mecánicamente son iguales.

Si bien los UT440MC solo habían sido destinados al Biotren, estos automotores prestaron servicio también en el servicio Metrotrén, de igual manera que los UT440 de Metrotrén prestaron servicio ocasional al Biotren.

El 1 de mayo de 2008, Ferrocarriles Suburbanos de Concepción S.A. asume la administración del servicio de pasajeros Biotren.

Iniciativa de soterrar la línea férrea en Concepción En junio de 2009, se aprobó el soterramiento de la línea férrea de Biotren en Concepción desde Av. Los Carrera hasta Av. Esmeralda, lo que implica la construcción de un túnel de 1055 metros de longitud a 7,5 metros de profundidad en la ribera norte del Biobío. Con esto se iba a llamar a licitación para el estudio a mediados de 2010 y la ejecución de las obras se tenía proyectada para 2011."Túnel de 1 kilómetro y 67 mil millones se requieren para soterrar línea férrea". Diario El Sur, jueves 25 de junio de 2009, Concepción, Chile. Sin embargo, el terremoto de Chile de 2010 cambió los presupuestos, descartándose el soterramiento como prioridad. Aun así, la idea se mantuvo en el inconsciente colectivo, y en 2014 volvió a surgir dicho plan tras el conflicto de los vecinos de la población Aurora de Chile (aledaña a la línea) con las autoridades por el proyecto de prolongación de la Av. Chacabuco para conectarla con su puente homónimo sobre el río Biobío que, en principio, sería por viaducto elevado. Sin embargo, frente al tema, las autoridades revaluaron dicha situación y propusieron como solución que Av. Chacabuco fuese a ras de suelo mientras que la línea de tren se soterraría.Gobierno Regional del Biobío - Comisión de Ciudad y Territorio sesionará en Concepción por temas Mercado y Ribera Norte 2

Si bien posteriormente el Gobierno Regional financió en 2017 un estudio para ver el soterramiento de la línea férrea en Concepción, el presidente de EFE Eric Martin señaló en 2023 que la iniciativa no era prioritaria para la empresa, aunque no estaba “muerta”. Aunque el soterramiento es anhelado como una forma de incorporar la ciudad al Río Biobío, se ha señalado que de realizarse podría complicar el movimiento de los trenes de carga y de pasajeros.

Cambio de imagen y extensión a Coronel (2013-2021) thumb|left|Logotipo de Biotren entre 2013 y 2021.

Cambio de imagen En 2013, la Empresa de los Ferrocarriles del Estado realiza un cambio de imagen corporativa general unificando todas sus filiales bajo la misma imagen corporativa, lo que implicó un cambio de imagen y colores al Biotren. No obstante ello, se mantuvo dentro del nuevo logo, el anterior representado por la flecha en círculo.

El mismo año, FESUB S.A. llevó a cabo el proyecto del aumento de las frecuencias en Línea 2. Se construyó una nueva estación con dos andenes en el sector de Michaihue, específicamente en la esquina de Av. Michaihue y en la Ruta 160, así como nuevos desvíos para el cruce de trenes. Además se construyeron nuevos andenes en la estación Juan Pablo II (andén norte) y en Lomas Coloradas (oriente). En los primeros días de septiembre del mismo año, las frecuencias en las mañanas aumentaron de 30 minutos a 18 minutos.

En febrero del 2014 comienza a operar de manera parcial la nueva Estación Alborada de la línea 2, la primera estación construida después del relanzamiento del Biotren en 2005, la cual es inaugurada oficialmente el 6 de marzo de 2014; y que se emplaza en la intersección de la Ruta CH-160 y la avenida Michaihue, acceso al sector homónimo de la comuna de San Pedro de la Paz. Luego, en enero de 2017, se inaugura también en la comuna sampedrina la estación El Parque de la línea 2, ubicado frente al cementerio "Parque San Pedro" y al centro comercial Arauco Premium Outlet San Pedro.

En mayo de 2015 Ferrocarriles del Sur (Fesur) presentó los estudios realizados para la construcción de un servicio ferroviario subterráneo en Concepción, el cual considera 9 estaciones desde la estación Concepción hasta la Universidad del Bío Bío y que presentaba una rentabilidad social positiva; sin embargo el proyecto no fue considerado como urgente.

Durante la cuenta pública de junio de 2019 del presidente Sebastián Piñera anunció las intenciones de extender el servicio desde la estación de Coronel hasta Lota y desde la estación de Concepción hasta Penco, esto además sumado con la construcción de un nuevo puente ferroviario sobre el río Bíobío.

Extensión a Coronel thumb|right|250px|Estación Coronel, 2018 En junio de 2007, se llamó a licitación para el estudio de la extensión del Biotren hasta Coronel.Diario El Sur; 2007. "Alcalde pide plazos EFE adjudica estudio para extender el Biotrén a Coronel". En: Diario El Sur, miércoles 6 de junio de 2007 Concepción, Chile.

En febrero de 2013 se anuncia la extensión de la línea 2 hasta Coronel, en mayo del mismo año se anunció la adjudicación de los trabajos de ingeniería del proyecto, y en septiembre se realizó la licitación de obras.

El 29 de febrero de 2016 comenzó a funcionar el servicio Coronel-Concepción, lo cual significó una ampliación de la línea 2 en 17 km, con siete nuevas estaciones. Ello se tradujo en ahorros de tiempo de viaje de hasta una hora. El ministro de Transportes y Telecomunicaciones anunció, el 1 de abril de 2016, que tras el fin de la etapa de marcha blanca, los trenes que hagan el recorrido de 23 km entre Concepción y Coronel tendrán una frecuencia de 15 minutos y no cada media hora. También anunció que los siguientes dos proyectos del Biotren serán el reemplazo del actual puente ferroviario sobre el río Biobío, que data del , y el soterramiento de la vía, para llegar al centro de Concepción.El Mercurio de Santiago, 02 de abril 2016, cuerpo C, pp. 14. Para marzo de 2017, tenía un uso de 19 mil pasajeros diarios.

Modernización de la flota, colapso de la línea 2 y cambios en infraestructura (2021-actualidad) izquierda|miniaturadeimagen|301x301px|Interior de uno de los trenes incorporados al Biotren el año 2021

Modernización de la flota En 2021, entraron en operación 9 automotores eléctricos de tres coches de la empresa CSR Sifang, que en octubre de 2018 ganó la licitación internacional para dotación de 12 nuevas máquinas para la red ferroviaria chilena. Los nuevos trenes ―automotores SFE― llegaron en distintos periodos de 2021, y entraron en operaciones durante septiembre y octubre del mismo año.

A comienzos de 2022, con el relajo de medidas en la etapa posterior del pandemia de Covid-19 que incluía el regreso de los estudiantes a la presencialidad, sumado colapso vial de la Ruta CH-160, inicia a operar el servicio «Expreso San Pedro» el 28 de febrero, el cual entregará cobertura exclusiva a las estaciones Cardenal Raúl Silva Henríquez, Lomas Coloradas, El Parque, Costamar, Alborada, Diagonal Biobío y Juan Pablo II, todas estas pertenecientes a la línea 2 del Biotren, dentro de la comuna de San Pedro de la Paz. Los servicios se prestan de lunes a viernes en horarios acotados. Con el correr de los meses se habilitó una variante de este servicio de doble sentido entre Intermodal Coronel y Juan Pablo II.

Aún con el nuevo servicio, Biotren se vio colapsado debido al aumento de pasajeros que utilizan el servicio de la línea 2, aumentando de 32 mil a 37 mil pasajeros. El 18 de marzo EFE anuncia que se añadirán dos nuevos servicios: desde estación Cristo Redentor a estación Concepción y desde Concepción a Coronel.

El masivo uso del servicio desde la segunda parte de la pandemia, no hizo disminuir los altos niveles de congestión vehicular en el Gran Concepción, por lo que EFE Sur informó que entre el 17 a 19 de agosto de 2022 se incorporan otros tres servicios adicionales en la línea 1 entre las estaciones de Concepción y Chiguayante.

El jueves 9 de noviembre de 2023, Biotren llegó a récord de pasajeros en un mismo día con 48.724 pasajeros, superando los 45.000 que es el tope máximo operacional de pasajeros. Ante ello, EFE Sur analiza la implementación de "trenes dobles", aumentando de tres a seis carros para aplacar la alta cantidad de pasajeros, lo que conllevaría a la ampliación de los actuales andenes que hoy están diseñados para los trenes de tres vagones.

Cortes del antiguo puente ferroviario miniaturadeimagen|322x322px|Puente ferroviario antiguo (a la izquierda) y el nuevo puente ferroviario en construcción (a la derecha) el 26 de junio de 2023, durante el Temporal que afectó el centro sur de Chile ese fin de semana.