thumb|Naturstyrelsens kontorer i Haraldsgade på Nørrebro.
Miljøministeriet blev etableret i 1971 som Ministeriet for Forureningsbekæmpelse, ledet af Jens Kampmann. Det fik først sin nuværende betegnelse i 1973. Energiområdet, som havde sit eget ministerium i perioden 1979 – 1994, har været tæt tilknyttet miljøministeriet. I 1994 kom energien direkte ind under ministeriet, der skiftede navn til Miljø- og Energiministeriet, og ved regeringsskiftet i 2001 blev energien som sagsområde flyttet ud under en række andre ministerier; den måske største andel, energilovgivningen, havnede i Økonomi- og Erhvervsministeriet. Ved regeringsomdannelsen i 2005 blev energiområdet underlagt Transport- og Energiministeriet. I 2007 blev energiområdet underlagt det nyoprettede Klima- og Energiministerium.
Ved regeringsskiftet i 2015 blev ministeriet lagt sammen med ministeriet for fødevarer, landbrug og fiskeri under navnet Miljø- og Fødevareministeriet. Miljø- og fødevareminister blev Eva Kjer Hansen (V) og fra februar 2016, efter Kjers afgang (pga. den såkaldte gyllegate), forhenværende uddannelses- og forskningsminister Esben Lunde Larsen (V)
Struktur Miljøministeriet omfattede dels et departement, dels en række styrelser og institutioner: Miljøstyrelsen Kystdirektoratet Center for Koncernforvaltning (nedlagt i 2008) Natur- og Miljøklagenævnet (oprettet pr 1. januar 2011) En sammenlægning af de to tidligere nævn Miljøklagenævnet og Naturklagenævnet
I forbindelse med Universitetsreformen blev DMU flyttet fra Miljøministeriet til Aarhus Universitet. I forbindelse med Regeringen Anders Fogh Rasmussen III's tiltræden blev GEUS flyttet til det nyoprettede Klima og Energiministerium.
Ministerliste NavnFraTilTitelPartiJens Kampmann19711973Minister for offentlige arbejder og forureningsbekæmpelseSocialdemokratietHelge Nielsen19731973MiljøministerHolger Hansen19731975VenstreHelge Nielsen19751977Bolig- og miljøministerSocialdemokratietSvend Jakobsen19771977Niels Matthiasen19771978MiljøministerIvar Nørgaard19781980Erik Holst19801982Christian Christensen19821988MiljøministerKristeligt FolkepartiLone Dybkjær19881990Radikale VenstrePer Stig Møller19901993Det Konservative FolkepartiSvend Auken19932001SocialdemokratietMiljø- og energiministerHans Christian Schmidt20012004MiljøministerVenstreConnie Hedegaard20042007Det Konservative FolkepartiTroels Lund Poulsen20072010VenstreKaren Ellemann20102011Ida Auken20112014Socialistisk FolkepartiKirsten Brosbøl20142015SocialdemokratietEva Kjer Hansen20152016Miljø- og fødevareministerVenstreEsben Lunde Larsen20162018Jakob Ellemann-Jensen20182019Lea Wermelin20192022Miljøminister (Og minister for ligestilling fra 29. august 2024)SocialdemokratietMagnus Heunicke2022 -
Eksterne henvisninger Miljøministeriets hjemmeside