La República d'Estònia va obtenir la seva independència de l'Imperi Rus el 24 de febrer de 1918 i va establir relacions diplomàtiques amb nombrosos països a través de la seva adhesió a la Societat de Nacions. La incorporació forçosa d'Estònia a la Unió Soviètica el 1940 no va ser reconeguda per la major part de la comunitat internacional, i el servei diplomàtic estonià va continuar operant en alguns països.

Després de la restauració de la independència respecte a la Unió Soviètica, Rússia va ser una de les primeres nacions a tornar a reconèixer la independència d'Estònia (el primer país a fer-ho va ser Islàndia, el 22 d'agost de 1991). La prioritat immediata d'Estònia després de recuperar la seva independència va ser aconseguir la retirada de les forces russes (anteriorment soviètiques) del seu territori, la qual cosa es va completar l'agost de 1994. No obstant això, les relacions amb Moscou han continuat sent tenses, principalment perquè Rússia va decidir no ratificar el tractat fronterer que havia signat amb Estònia el 1999.

Tendències després de la independència esquerra|miniatura|270x270px|El president Toomas Hendrik Ilves i el president George W. Bush, a Estònia el 2006.

Des que va recuperar la seva independència, Estònia ha seguit una política exterior d'estreta cooperació amb les nacions d'Europa occidental. Els dos objectius polítics més importants en aquest àmbit han estat l'ingrés a l'OTAN i a la Unió Europea, assolits el març i el maig de 2004, respectivament. L'alineament internacional d'Estònia cap a Occident ha estat acompanyat d'un deteriorament generalitzat en les relacions amb Rússia, exemplificat recentment per la polèmica entorn de la reubicació del monument soviètic del Soldat de bronze de Tallin.

Estònia s'ha convertit en una ferma defensora de l'enfortiment de la integració europea. La decisió de participar en la preparació d'un impost a les transaccions financeres el 2012 reflecteix aquest gir en la política estoniana cap a la UE.

Un element clau en la reorientació d'Estònia després de recuperar la seva independència ha estat l'enfortiment dels llaços amb els països nòrdics, especialment Finlàndia i Suècia. De fet, els estonians es consideren a si mateixos un poble nòrdic, ja que són un poble finès-ugri com els finlandesos i no bàltic, basant-se en els seus vincles històrics amb Dinamarca i particularment amb Finlàndia i Suècia. El desembre de 1999, el llavors ministre d'Afers Exteriors d'Estònia (i president del país des del 2006), Toomas Hendrik Ilves, va pronunciar un discurs titulat «Estònia com a país nòrdic» a l'Institut Suec d'Aers Internacionals. El 2003, el Ministeri d'Afers Exteriors va organitzar també una exposició anomenada «Estònia: nòrdica amb un toc». El 2005, Estònia es va unir al Grup de combat Nòrdic de la Unió Europea. Així mateix, ha mostrat un interès continu a convertir-se en membre de ple dret del Consell Nòrdic.

Mentre que el 1992 Rússia representava el 92% del comerç internacional d'Estònia, actualment existeix una interdependència econòmica significativa entre Estònia i els seus veïns nòrdics: tres quartes parts de la inversió estrangera a Estònia provenen dels països nòrdics (principalment Finlàndia i Suècia), cap als quals Estònia dirigeix el 42% de les seves exportacions (en comparació amb un 6,5% a Rússia, un 8,8% a Letònia i un 4,7% a Lituània). D'altra banda, el sistema polític estonià, el seu tipus impositiu pla sobre la renda i el seu model no basat en un estat de benestar el distingeixen dels altres països nòrdics, i fins i tot de molts altres països europeus.

Controvèrsies internacionals Qüestions territorials entre Estònia i Rússia miniatura|La presidenta estoniana, Kersti Kaljulaid, amb el president rus, Vladímir Putin, a Moscou el 18 d'abril de 2019.

Després de la dissolució de la Unió Soviètica, Estònia esperava la devolució de més de 2.000 quilòmetres quadrats de territori que van ser annexats per Rússia després de la Segona Guerra Mundial el 1945. Aquestes terres annexades es trobaven dins de les fronteres estonianes reconegudes per Rússia al Tractat de Pau de Tartu de 1920. No obstant això, el govern de Borís Ieltsin es va desentendre de tota responsabilitat pels actes comesos per la Unió Soviètica.

Després de la signatura del tractat fronterer per part del ministre d'Afers Exteriors corresponent el 2005, aquest va ser ratificat pel govern i el president d'Estònia. La part russa va interpretar el preàmbul com una possible base per a futures reclamacions territorials per part d'Estònia, i Vladímir Putin va notificar que Rússia no acceptaria tal possibilitat. Les negociacions es van reprendre el 2012 i el tractat va ser signat el febrer de 2014. La ratificació encara està pendent.

Relacions internacionals Multilateral : Estònia va ingressar a la Unió Europea com a membre de ple dret l'1 de maig de 2004. : Estònia va ingressar a l'OTAN com a membre de ple dret el 29 de març de 2004.

Àfrica : Egipte va reconèixer Estònia per primera vegada el 1937 i la va tornar a reconèixer el 6 de setembre de 1991. : Etiòpia està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Brussel·les (Bèlgica). : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el setembre de 2012. : Estònia està acreditada davant del Marroc des de la seva ambaixada a Lisboa (Portugal). : Sud-àfrica està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Estocolm (Suècia).

Amèrica del Sud, del Nord i Central : Argentina està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia. : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el 5 de maig de 1999. : Bolívia està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Estocolm (Suècia). : Estònia està acreditada davant del Brasil des del seu Ministeri d'Afers Exteriors a Tallinn. : Estònia té una ambaixada a Ottawa. : Xile va reconèixer Estònia per primera vegada el 22 de setembre de 1921. Xile va tornar a reconèixer Estònia el 28 d'agost de 1991 i les relacions diplomàtiques entre ambdós països es van establir el 27 de setembre de 1991. El 2 de desembre de 2000 va entrar en vigor un acord d'exempció de visats entre Estònia i Xile. Ambdós països també tenen en vigor un Memoràndum de cooperació entre els Ministeris d'Afers Exteriors i s'estan preparant acords de cooperació cultural, turística i informàtica. : Colòmbia defineix Estònia com un aliat important i un actor clau en l'adhesió de Colòmbia a l'OCDE i la ratificació de l'Acord Comercial Colòmbia-Unió Europea. : Costa Rica no està acreditada davant d'Estònia. : Cuba està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia. : Estònia té una ambaixada a Washington D.C. i consolats generals a Nova York i San Francisco. : El Salvador està acreditat davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Estocolm, Suècia. : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el 19 d'abril de 1997. : Mèxic està acreditat davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Hèlsinki (Finlàndia) i manté un consolat honorari a Tallinn. : El Perú està acreditat davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Hèlsinki (Finlàndia) i manté un consolat honorari a Tallinn. : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el 23 de setembre de 2009. : Estònia no està acreditada davant de l'Uruguai. : Estònia no està acreditada a Veneçuela.

Oceania : Austràlia està acreditada davant d'Estònia a través d'una ambaixada a temps parcial a Tallinn des del 2018. : Estònia està acreditada davant de Nova Zelanda des de la seva ambaixada a Canberra (Austràlia). : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el 23 de gener de 2009. : Ambdós països van establir relacions diplomàtiques el 13 de març de 2015.

Àsia

Afganistan està acreditat davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Varsòvia (Polònia). Estònia està acreditada davant de l'Afganistan des del seu Ministeri d'Afers Exteriors a Tallinn.

Armènia està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Varsòvia (Polònia) i un consolat honorari a Tallinn. Estònia està acreditada davant d'Armènia des de la seva ambaixada a Tiflis (Geòrgia) i a través d'un consolat honorari a Erevan. A Estònia viuen uns 2000 descendents d'armenis. Ambdós països són membres de ple dret del Consell d'Europa.

Estònia va reconèixer la independència de l'Azerbaidjan el 20 de febrer de 1992. Les relacions diplomàtiques entre l'Azerbaidjan i Estònia estan establertes des del 20 d'abril de 1992. L'Azerbaidjan té una ambaixada a Tallinn. Estònia té una ambaixada a Bakú. Ambdós països són membres de ple dret del Consell d'Europa. : Cambodja està acreditada davant d'Estònia des de la seva ambaixada a Moscou (Rússia). : El juny de 2020, Estònia es va oposar obertament a la Llei de Seguretat Nacional de Hong Kong. : Ministeri d'Afers Exteriors d'Estònia sobre les relacions amb Geòrgia.

Europa País Inici de les relacions formalsNotes Albània està acreditada a Estònia per la seva ambaixada a Varsòvia, Polònia. Estònia està acreditada a Albània des de la seva ambaixada a Atenes, Grècia. Àustria va reconèixer Estònia el 26 de juny de 1921. Ambdós països van restablir les relacions diplomàtiques el 8 de gener de 1992. Àustria té una ambaixada a Tallinn. Estònia té una ambaixada a Viena. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea. Bielorússia té una ambaixada a Tallinn. Estònia té una ambaixada a Minsk. Bèlgica està acreditada a Estònia per la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia. Estònia té una ambaixada a Brussel·les. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea i de l'OTAN. Bòsnia està acreditada a Estònia per la seva ambaixada a Estocolm, Suècia. Estònia està acreditada a Bòsnia per la seva ambaixada a Budapest, Hongria.

Bulgària va reconèixer Estònia el 20 de maig de 1921 i va tornar a reconèixer Estònia el 26 d'agost de 1991. Bulgària està acreditada a Estònia per la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia i manté un consolat honorari a Tallinn. Estònia està acreditada a Bulgària per la seva ambaixada a Bucarest, Romania i té un consolat honorari a Sofia. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea i de l'OTAN. Croàcia està acreditada a Estònia per la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia. Estònia està acreditada a Croàcia des de la seva ambaixada a Praga, República Txeca. L'any 2000 els dos països van acabar mútuament amb els règims de visats per als ciutadans que viatjaven entre els dos estats. El setembre de 2015, el primer ministre d'Estònia Andrus Ansip va fer una visita d'estat a Croàcia en la qual va donar suport al país en el seu camí cap a l'OTAN i la UE. Xipre està acreditat a Estònia per la seva ambaixada a Hèlsinki, Finlàndia. Estònia està acreditada a Xipre per la seva ambaixada a Atenes, Grècia. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea. La República Txeca té una ambaixada a Tallinn. Estònia té una ambaixada a Praga. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea i de l'OTAN.1921 Dinamarca té una ambaixada a Tallinn. Estònia té una ambaixada a Copenhaguen. Tots dos països són membres de ple dret de la Unió Europea i de l'OTAN. Finlàndia va reconèixer Estònia per primera vegada el 20 de juny de 1920. Finlàndia té una ambaixada a Tallinn i un consolat honorari a Tartu. Estònia té una ambaixada a Hèlsinki i sis consolats honoraris a Kotka, Mariehamn, Oulu, Tampere, Turku i Vaasa. Tots dos països són membres de ple dret del Consell d'Estats de la Mar Bàltica i de la Unió Europea i de l'OTAN. Estònia i Finlàndia tenen una ambaixada conjunta a Canberra. Estònia va donar suport plenament a la sol·licitud de Finlàndia per unir-se a l'OTAN, que va donar lloc a l'adhesió el 4 d'abril de 2023. França va reconèixer Estònia el 26 de gener de 1921. França mai va reconèixer l'ocupació soviètica d'Estònia. França va tornar a declarar el seu reconeixement el 25 d'agost de 1991.