thumb|280px|Konformacijska promjena natrij-glukozid simportera proizilazi iz otvaranja prema vanćelijskom matriksu prema unutrašnjosti ćelije. U biohemiji, konformacijska promjena jeste promjena oblika makromolekula, često izazvana faktorima okoline. Makromolekula je obično fleksibilna i dinamična. Može mijenjati svoj oblik kao odgovor na promjene u okolini ili druge faktore; svaki mogući oblik naziva se konformacija, a prelaz između njih se naziva konformacijska promjena. Faktori koji mogu izazvati takve promjene uključuju temperaturu, pH, napon, svjetlost u hromoforima, koncentraciju iona, fosforilaciju ili vezivanje liganda.
Laboratorijska analiza Mnoge biofizičke tehnike kao što su kristalografija, NMR, elektronska paramagnetna rezonanca (EPR) korištenjem tehnika spinskog označananja, kružnog dihroizma (CD), Izmjena vodika i deuterija i FRET mogu se koristiti za proučavanje konformacijskih promjena makromolekula. Interferometrija dvostruke polarizacije jeste laboratorijska tehnika sposobna za mjerenje konformacijskih promjena u biomolekulama u stvarnom vremenu pri vrlo visokoj rezoluciji.
Specifična nelinearna optička tehnika nazvana generacija drugog harmonika (SHG) nedavno je primijenjena za proučavanje konformacijskih promjena u proteinima. U ovoj metodi, sonda aktivna na drugom harmoniku postavlja se na mjesto koje se kreće u proteinu mutagenezom ili vezivanjem koje nije specifično za određeno mjesto, a protein se adsorbira ili specifično imobilizira na površinu. Promjena konformacije proteina proizvodi promjenu u neto orijentaciji boje u odnosu na površinsku ravan, a time i intenziteta snopa drugog harmonika. U uzorku proteina s dobro definiranom orijentacijom, ugao nagiba sonde može se kvantitativno odrediti, u stvarnom prostoru i stvarnom vremenu. Neprirodne aminokiseline aktivne na drugom harmoniku također se mogu koristiti kao sonde.
Druga metoda primjenjuje elektro-prekidačke biopovršine, gdje se proteini postavljaju na vrh kratkih molekula DNK koje se zatim provlače kroz puferski rastvor, primjenom naizmjeničnih električnih potencijala. Mjerenjem njihove brzine, koja u konačnici zavisi od njihovog hidrodinamičkog trenja, mogu se vizualizirati konformacijske promjene.
Također pogledajte Baza podataka o konformacijskoj raznolikosti proteina Dinamika proteina Baza podataka o makromolekularnim kretnjama (molmovdb)
Reference
Vanjski linkovi Frauenfelder, H. New looks at protein motions Nature 338, 623 - 624 (20 April 1989). Sensing with electro-switchable biosurfaces Biodesy
Kategorija:Mikrobiološke tehnike Kategorija:Biofizika