Aktivacijski transkripcijski faktor 4 (taks- pojačivač odgovora B67)', također poznat kao ATF4, je protein koji je kod ljudi kodiran genom ATF4 sa hromosoma 22.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnojg lanca je 351 aminokiselina, a molekulska težina 38.590 Da.
1020304050 MTEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGAEESLGLLDDYLEVAKHFKPHGFS SDKAKAGSSEWLAVDGLVSPSNNSKEDAFSGTDWMLEKMDLKEFDLDALL GIDDLETMPDDLLTTLDDTCDLFAPLVQETNKQPPQTVNPIGHLPESLTK PDQVAPFTFLQPLPLSPGVLSSTPDHSFSLELGSEVDITEGDRKPDYTAY VAMIPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYLGSPQHSPSTRGSPNRSLPSPG VLCGSARPKPYDPPGEKMVAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKR AEQEALTGECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRKARGKKRV P
Funkcija
Ovaj gen kodira transkripcijski faktor, prvobitno identificiran kao široko eksprimirani DNK vezujući protein sisara koji bi mogao vezati pojačivač reakcije na taksov e u LTR HTLV-1. Kodirani protein je takođe izolovan i okarakterisan kao cAMP-odgovorn i element koji vezuje protein 2 (CREB-2). Protein kodiran ovim genom pripada porodici proteina koji se vezuju za DNK koja uključuje porodicu transkripcionih faktora AP-1, cAMP-odgovora elementa vezujućih proteina (CREB) i proteina sličnih CREB-u. Ovi transkripcijski faktori dijele regiju leucinskog zatvarača koja je uključena u interakcije protein-protein, na C-terminalu dijela osnovnih aminokiselina koji funkcionira kao DNK-vezujući domen. Opisana su dva alternativna transkripta koje kodiraju isti protein. Dva pseudogena nalaze se na X hromosomu, regija na q28 koja sadrži veliku obrnutu duplikaciju.
Također je poznato da transkripcijski faktor ATF4 ima ulogu u diferencijaciji osteoblasta, zajedno sa RUNX2 i osteriksom. Terminalna diferencijacija osteoblasta, predstavljena mineralizacijom matriksa, značajno je inhibirana inaktivacijom JNK. Inaktivacija JNK, posljedično smanjuje ekspresiju ATF-4 i mineralizaciju matriksa. Protein IMPACT reguliše ATF4 u C. elegans kako bi produžio životni vijek.
Translacija
Translacija ATF4 ovisi o izvodnom otvorenom okviru čitanje koji se nalazi u 5' UTR-u. Lokacija drugog ORF-a, prikladno nazvanog uORF2, preklapa se sa okvirom otvorenog čitanja ATF4. U normalnim uslovima, uORF1 se prevodi, a zatim se translacija uORF2 dešava tek nakon što se ponovo dobije eIF2-TC. Translacija uORF2 zahtijeva da ribosomi prođu pored "ATF4" ORF, čiji se početni kodon nalazi unutar uORF2. To dovodi do njegove represije. Međutim, tokom stresnih uslova, ribosomski 40S će zaobići uORF2, zbog smanjenja koncentracije eIF2-TC, što znači da nijkedan ribosom ne dobije na vrijeme uputu da prevede uORF2. Umjesto toga, translatira se "ATF4".
Također pogledajte Aktivirajući transkripcijski faktor
Reference
Dopunska literatura
Ebert, S. M., Bullard, S. A., Basisty, N., Marcotte, G. R., Skopec, Z. P., Dierdorff, J. M., ... & Bodine, S. C. (2020). "Activating transcription factor 4 (ATF4) promotes skeletal muscle atrophy by forming a heterodimer with the transcriptional regulator C/EBPβ". Journal of Biological Chemistry, 295(9), 2787–2803.
Vanjski linkovi
PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4
Kategorija:Transkripcijski faktori Kategorija:Geni na hromosomu 22 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika