5′ netranslatirana regija (znana i kao 5'UTR, vodeća sekvenca, vodeći transkript ili vodeća RNK) jest regija informacijske RNK (iRNK) , direktno uzvodno od inicijacijskog kodona. Ovo područje je važno za regulaciju transklacije transkripta različitim mehanizmima u virusa, prokariota i eukariota. Iako se naziva neprevedenim, 5′ UTR ili njegov dio ponekad se prevodi u proteinski proizvod. Ovaj proizvod tada može regulirati translaciju glavne kodirajuće sekvence iRNK. U mnogim organizmima, međutim, 5′ UTR je potpuno nepreveden, a umjesto toga formira kompleks sekundarne strukture za regulaciju translacije.

Utvrđeno je da 5′ UTR stupa u interakciju s proteinima koji se odnose na metabolizam, i aktivnosti unutar 5′ UTR. Osim toga, ova regija je uključena u regulaciju transkripcije), kao što je gen letalan za spolni gen u rodu Drosophila. Regulatorni elementi unutar 5′ UTR-ova vezani su i za eksport iRNK.

Opća struktura Dužina 5 ′ UTR počinje na mjesto početka transkripcije i završava jednim nukleotidom (nt) prije inicijacijske sekvence (obično AUG) kodirajuće regije. Kod prokariota dužina 5 ′ UTR je oko 3–10 nukleotida, dok je kod eukariota duga od 100 do nekoliko hiljada nukleotida. Naprimjer, transkript ste11 kod Schizosaccharomyces pombe ima 2.273 nukleotida 5′ UTR-a dok lac operon kod Escherichia coli ima samo sedam nukleotida u njenom 5′ UTR-u. Različite veličine su vjerojatno posljedica složenosti eukariotske regulacije koju ima 5′ UTR, kao i većeg kompleksa predinicijacije, koji se mora formirati za početak prevođenja.

5 ′ UTR također može potpuno nedostajati, u slučaju bezvodeće RNK. Ribosomi kod sva tri domena života prihvataju i prevode takve iRNK. Takve sekvence se prirodno nalaze u sva tri domena života. Ljudi imaju mnogo gena povezanih sa pritiskom koji su pod 2 i 3 vodeća nukleotida. Sisari također imaju drugetipove ultra-kratkih vodiča, kao što je TISU-sekvenca.

Element thumb|280px|Translaciju , regulira vezivanje IRP (proteina koji regulira željezo) i IRE (elementa gvožđevogodgovora), koji su ukosničke petlje.

Elementi eukariotskog i prokariotskog 5′ UTR-a jako se razlikuju. Prokariotski 5′ UTR sadrži mjesto vezanja ribosoma (RBS), poznato i kao Shine-Dalgarno sekvenca (AGGAGGU), koje je obično 3–10 parova baza uzvodno od inicijacijskog kodona. Nasuprot tome, eukariotski 5 ′ UTR sadrži Kozak konsenzusni niz (ACCAUGG), koji sadrži inicijacijski kodon. Eukariotski 5 ′ UTR također sadrži cis-djelujuće regulacijske elemente koji se nazivaju uzvodno otvoreni okviri čitanja (uORF) i uzvodni AUG (uAUG) i završni kodoni, koji imaju veliki uticaj na regulaciju translacije. Za razliku od prokariota, 5 ′ UTR u eukariota mogu sadržavati introne. Kod ljudi, ~ 35% svih gena sadrži introne unutar 5 ′ UTR.

Sekundarna struktura Kako 5 ′ UTR ima visok sadržaj GC, unutar njega često se javljaju sekundarne strukture. Ukosnica su jedna takva sekundarna struktura koja se može nalaziti unutar 5 ′ UTR. Ove sekundarne strukture također utiču na regulaciju translaciju.

Također pogledajte 3' netranslatirana regija UORF Trans-prerada UTRdb

Reference

Kategorija:RNK Kategorija:Ekspresija gena