Transmembranski protein 126B je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM126B. MEM126B je mitohondrijski transmembranski protein koji je komponenta sklopa mitohondrijskog kompleksa I. Gen TMEM126B konzerviran je kod sisaraa.
Kodirani protein služi kao sastavni faktor koji je potreban za formiranje membranskog kraka kompleksa. Stupa u interakciju s NADH dehidrogenazama ubikinon 1 alfa potkompleksnog faktora sastavljanja 13. Prirodno prisutne mutacije u ovom genu povezane su s nedostatkom izoliranog kompleksa I. Pseudogen ovog gena je definiran na hromosomu 9.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 230 aminokiselina, а molekulska težina 25.943 Da. 1020304050 MVVFGYEAGTKPRDSGVVPVGTEEAPKVFKMAASMHGQPSPSLEDAKLRR PMVIEIIEKNFDYLRKEMTQNIYQMATFGTTAGFSGIFSNFLFRRCFKVK HDALKTYASLATLPFLSTVVTDKLFVIDALYSDNISKENCVFRSSLIGIV CGVFYPSSLAFTKNGRLATKYHTVPLPPKGRVLIHWMTLCQTQMKLMAIP LVFQIMFGILNGLYHYAVFEETLEKTIHEE
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Struktura TMEM126B se nalazi na q kraku hromosoma 11, na poziciji q14.1 i ima sedamegzona. Gen TMEM126B proizvodi protein od 4,6 kDa, sastavljen od 54 aminokiseline. Dio je kompleksa mitohondrija l kompleksa I sklopa (MCIA), sastavljen od NDUFAF1, ECSIT i ACAD9 (po sličnosti). Povezuje se sa međukompleksom od 370 kDa, nepotpuno sastavljenog kompleksa I. Kompleks I sastoji se od 45 evolucijski konzerviranih jezgarnih podjedinica, uključujući i mitohondrijsku DNK i jedarno kodirane podjedinice. Jedan njegov krak je ugrađen u unutrašnju mitohondrijsku membranu, a drugi je u organelu. Dva kraka su raspoređena u obliku slova L. Ukupna molekulska težina kompleksa je 1MDa. Prikaz predviđene orijentacije TMEM126B unutar ćelijske membrane, okvirno zasnovan na fosforilaciji, i podacima o hidrofobnosti, prikazan je ispod.
thumb|300px|left
Funkcija Gen TMEM126B kodira mitohondrijski transmembranski protein koji je komponenta kompleksa sklopa mitohondrijskog kompleksa I. Kodirani protein služi kao sklopni faktor koji je potreban za formiranje membranskog kraka kompleksa. TMEM126B se kombinira s drugim faktorima sastavljanja uključujući ACAD9, CIA30 i ECSIT. U nedostatku TMEM126B, takvi faktori sastavljanja nisu regrutirani u mitohondrijsku membranu i nisu sudjelovali u sastavljanju kompleksa I. Poznato je da disfunkcija TMEM126B uzrokuje nekoliko komplikacija u kompleksu I, koje karakteriziraju ozbiljne poteškoće u mitohondrijskom disanju i potpuni neuspjeh sklopa kompleksa I. Međutim, nije poznato da ima značajan uticaj na sklopove mitohondrijskih kompleksa III, IV i V.
Otkriće TMEM126B je prvi put otkriven u istraživanju ekspresije proteina u tkivima hipotalamusno-hipofizno-nadbubrežne osovine, pomoću potpunog kloniranja cDNK. Od tada je otkriven u drugim tkivima.
Gen
Kod ljudi, TMEM126B se nalazi na hromosomu 11, uz bok sledećih gena: DLG2: Član porodice gvanilat kinaza povezane sa membranom. TMEM126A: Paralog TMEM126B eksprimiran u mitohondrijama. CREBZF: Poznat i kao Zhangfei protein, protein koji komunicira sa virusom herpes simplex.
Translacija Konceptna translacija proteina TMEM126B, uključujući projekciju sekundarne strukture, predviđanja transmembranskih regija, i fosforilacije i glikacijskih mjesta nalaze se ispod:
280px
Tkivna distribucija
TMEM126B se eksprimira u većini tipova tkiva, sa značajnim izuzecima, kao što su masno tkivo, uho, tkivo grkljana, limfa, nervno tkivo, hipofiza, slezena, timus, štitnjača, dušnik i pupčana vrpca. Također je visoko eksprimirann u tkivu paratiroideje, koštane srži i mokraćnog mjehura. Također postoje dokazi da je jedna od izoformi TMEM126B eksprimirana u ćelijskoj membrani u memorijskim B-ćelijama adaptivnom imunskom sistemu. slika:Tmem126B expression.png
Predviđena svojstva
Sljedća svojstva TMEM126B predviđena su pomoću bioinformatičke analize:
Molekulska težina:22.7 KDal Izoelektrična tačka: 9,02 Ortolozi TMEM126B-a imaju vrlo promjenjive izoelektrične tačke. Posttranslacijska modifikacija: ima nekoliko mogućih fosforilacijskih, i par mogućih glikacijskih mjesta Nisu predviđeni signalni peptidi.
Interakcije
Osim kopodjedinica za kompleks I, TMEM126B ima interakcije protein-protein sa ECSIT, NDUFAF1, NDUFC2, NDUFA13 i drugima.
Klinički značaj Poznato je da mutacije u "TMEM126B" rezultiraju mitohondrijskim bolestima i povezanim poremećajima. Uglavnom su povezane s nedostatkom kompleksa I, nedostatkom u prvom kompleksu mitohondrijskog respiratornog lanca. Nedostatak kompleksa I koji uključuje disfunkciju mitohondrijskog respiratornog lanca može uzrokovati širok raspon kliničkih manifestacija, od smrtonosne neonatusne bolesti, do neurodegenerativnih poremećaja u odraslih. Fenotipovi uključuju makrocefaliju s progresivnom leukodistrofijom, nespecifičnu encefalopatiju, kardiomiopatiju, Leighov sindrom, miopatiju, bolest jetre, Leberovu nasljednu optičku neuropatiju i neke oblike Parkinsonova bolesti. Osim nedostatka kompleksa I, mutacije "TMEM126B" pokazuju povezanost s teškim višesistemskim poremećajima u djetinjstvu, kao što su hronični zatajenje bubrega i kardiomiopatija i miopatija u djetinjstvu ili odrasloj dobi.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 11 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika