Deletirani protein limfocitne leukemije 2 (nekodirani protein) je dugolančana nekodirajuća RNK koja je kod ljudi kodirana genom DLEU2, lociranom na hromosomskoj sekvenci 13q14. DLEU2 gen je izvorno identificiran kao potencijalni gen za suzbijanje tumora i često se briše kod pacijenata sa hroničnom limfocitnom leukemijom B-ćelija.
Kloniranje i ekspresija Gubitak (delecija) hromosomske regije 13q14 česta je citogenetička promjena u hroničnoj limfocitnoj leukemiji B-ćelija (BCLL), što ukazuje na prisutnost navodnog gena za supresiju tumora na ovom mjestu. Izgradnjom detaljne restrikcijske i transkripcijske mape minimalno deletirane regije od 130 kb, skriningom panela primarnih klonova BCLL, pretraživanjem baze podataka EST i mapiranjem delecije, Liu et al (1997) identificirali su dvas gena, DLEU1 i DLEU2, koje su nazvali Leu1 i Leu2, u minimalno deletiranom području od 10 kb. Gen DLEU2 kodira predviđeni protein sa 84 aminokiseline. Northern blot analiza otkrila je snažnu ekspresiju transkripata od 1,4 i 1,8 kb samo u timusu i sjemenicima.Liu, Y., Corcoran, M., Rasool, O., Ivanova, G., Ibbotson, R., Grander, D., Iyengar, A., Baranova, A., Kashuba, V., Merup, M., Wu, X., Gardiner, A., and 12 others. Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia. Oncogene 15: 2463-2473, 1997. PubMed: 9395242 Corcoran et al. (2004) identificirali su više DLEU2 transkripata proizvedenih preskakanjem egzona, uključivanjem introna i upotrebom alternativnih internih mjesta donora ili prihvata prerade. PCR analiza otkrila je tkivno specifičnu ekspresiju nekoliko varijanti prerađenog DLEU2, a većina tkiva eksprimirala je više varijanti. Gen RFP2 (TRIM13) preklapa DLEU2 u antisens orijentaciji i kod miševa i kod ljudi, a in situ hibridizacija embriona miša otkrila je koekspresiju Dleu2 sa Rfp2 u svim ispitivanim tkivima. Otkrili su da RFP2 kodira navodni bicistronski transkript koji sadrži ORF za RFP2 i DLTET (KCNRG), kao i monocistronske transkripte. Nukleotidne sekvence mišjih i ljudskih DLEU2 cDNK su visoko konzervirane, ali ne i pretpostavljeni ORF-ovi, što sugerira da DLEU2 može biti nekodirajuća RNK koja regulira ekspresiju RFP2.
Struktura gena Liu et al. (1997.) utvrdili su da DLEU2 genu nedostaje TATA-kutija, ali ima nekoliko potencijalnih cis-djelujućih elemenata DNK. Corcoran et al. (2004) utvrdili su da gen DLEU2 obuhvata 143 kb i sadrži 15 egzona, uključujući dva alternativna prva egzona (1A i 1B). Pretpostavljeni bicistronski gen RFP2/DLTET nalazi se između egzona 10 i 12 DLEU2 u antisenskoj orijentaciji. Svi RFON2 i DLTET egzoni potiču od DLEU2 introna, osim RFP2 egzona 1A, koji se direktno preklapa sa DLEU2 egzonom 11. Intron između DLEU2 egzona 1A i 1B sadrži prva četiri egzona DLEU1, koji se transkribira u suprotnoj orijentaciji u DLEU2. DLEU2 intron 6 sadrži dva gena mikroRNK, MIRN15A i MIRN16-1.Corcoran, M. M., Hammarsund, M., Zhu, C., Lerner, M., Kapanadze, B., Wilson, B., Larsson, C., Forsberg, L., Ibbotson, R. E., Einhorn, S., Oscier, D. G., Grander, D., Sangfelt, O. DLEU2 encodes an antisense RNA for the putative bicistronic RFP2/LEU5 gene in humans and mouse. Genes Chromosomes Cancer 40: 285-297, 2004. PubMed: 15188451
Mapiranje Liu et al (1997) mapirali su gen DLEU2 u hromosomskoj regiji 13q14. Corcoran et al. (2004) mapirali su mišji gen Dleu2 u područje hromosoma 14 koje dijeli homologiju sinteze s ljudskim hromosomom 13q14.3.
Molekulska genetika Liu et al. (1997.) nisu uspjeli otkriti nikakve intragenske ili tačkaste mutacije u DLEU1 i DLEU2 u 170 uzoraka CLL. Međutim, prvi egzon svakog gena bio je deletiran u svim ispitivanim slučajevima gelecije 13q14.
Također pogledajte Dugolančana nekodirajuća RNK
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Nekodirajuća RNK Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika