COMM protein 4 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom COMMD4.
Hartz (2015) mapirala je gen COMMD4 u hromosomskoj poziciji 15q24.2, na osnovu poravnanja sekvence COMMD4 (GenBank AK000459) sa genomskom sekvencom (GRCh38).Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 12/17/2015.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 199 aminokiselina, a molekulska težina 21.764 Da..
1020304050 MRFRFCGDLDCPDWVLAEISTLAKMSSVKLRLLCSQVLKELLGQGIDYEK ILKLTADAKFESGDVKATVAVLSFILSSAAKHSVDGESLSSELQQLGLPK EHAASLCRCYEEKQSPLQKHLRVCSLRMNRLAGVGWRVDYTLSSSLLQSV EEPMVHLRLEVAAAPGTPAQPVAMSLSADKFQVLLAELKQAQTLMSSLG Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Masenom spektrometrijskom analizom proteina koji su povezani sa MURR1 (COMMD1) u liziranim ćelijaama HEK293, nakon čega slijede analiza baze podataka i PCR amplifikacija, Burstein et al. (2005) klonirali su COMMD4. Izvedeni protein ima domen metabolizma bakra MURR1 (COMM) koji je bogat leucinom i za koji je predviđeno da stvara beta-listove. Analiza baze podataka otkrila je ekspresiju COMMD4 u svih 13 ispitanih ljudskih tkiva, s najvećom ekspresijom u sjemenicim, plućima i timusu, a najmanjom u jajnicima, koži i pankreasu. Funkcija gena Analizom koimunoprecipitacije, Burstein et al. (2005) otkrili su da je COMMD4 komunicirao s endogenim COMMD1 iz ćelija HEK293. COMMD4 je snažno inhibirao TNF, posredovanu aktivaciju NF-kappa-B. Analize proteina pokazale su da je COMMD4 povezan sa NF-kappa-B podjedinicama RELA, RELB i p105 (NFKB1), ali ne i sa p100 (NFKB2) ili CREL (REL ). Nokdaun endogenog COMMD4 putem interferencijske RNK povisio je TNF-zavisnu aktivaciju gena CIAP2 (BIRC3), koji reaguje na NF-kappa-B. Mao et al. (2011) otkrili su da je COMMD4 stupio u interakciju s nizom specifičnih kulina označenih epitopom, komponentama multimernih kompleksa ubikvitin-ligaze poznatih kao kulin RING-ligaze (CRL). COMMD4 koji je taložen iz ljudskih ćelijskih linija podržavao je poliubikvitinaciju in vitro, vjerovatno zbog svoje interakcije s CRL.Burstein, E., Hoberg, J. E., Wilkinson, A. S., Rumble, J. M., Csomos, R. A., Komarck, C. M., Maine, G. N., Wilkinson, J. C., Mayo, M. W., Duckett, C. S. COMMD proteins, a novel family of structural and functional homologs of MURR1. J. Biol. Chem. 280: 22222-22232, 2005. PubMed: 15799966Mao, X., Gluck, N., Chen, B., Starokadomskyy, P., Li, H., Maine, G. N., Burstein, E. COMMD1 (copper metabolism MURR1 domain-containing protein 1) regulates cullin RING ligases by preventing CAND1 (cullin-associated Nedd8-dissociated protein 1) binding. J. Biol. Chem. 286: 32355-32365, 2011. PubMed: 21778237
Reference
Vanjski linkovi
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika